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合成DNAマイクロアレイを用いたウイルス感染細胞のトランスクリプトーム解析

使用合成 DNA 微阵列对病毒感染细胞进行转录组分析

基本信息

批准号：
14021023
负责人：
渡辺慎哉
金额：
$ 3.84万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14021023/
关键词：
ヒトサイトメガロウイルスマイクロアレイ宿主遺伝子

项目摘要

平成14年度は、年度内に作製したHuman 22,000 ＆ HCMV 179遺伝子アレイを用いて、ヒトサイトメガロウイルス(HCMV)感染後のヒト正常線維芽細胞(HF)・IMR32・Saos2・SW982・Y79細胞の遺伝子発現プロファイルを取得した。HFとIMR32はウイルス遺伝子に関してきわめて似た発現パタンを示した。しかし、HFで感染初期に激しく起きるIFN反応性遺伝子群の発現がIMR32では検出不能だった。また、SW982ではウイルス遺伝子の発現変化をほとんど検出できなかったにもかかわらず、IFN反応性遺伝子群の発現上昇を弱いながら検出した。さらに、Saos2では、感染初期に発現するHCMV遺伝子およびIFN反応性遺伝子群の発現上昇を検出できず、感染後期にHCMVの遺伝子の発現レベル上昇を確認した。Y79では、感染初期にウイルス遺伝子のわずかな発現レベル上昇を捉えたものの、宿主遺伝子の大きな発現レベル変化を見いだせなかった。培養細胞系においてHCMV許容性を示すのは、正常細胞であるHFとごく少数の細胞株に限られている。IMR32はこの限られたHCMV許容細胞株の一つで、少なくともウイルス遺伝子に関してはHF同様の発現パタンを示すことが明らかとなり、これまでの知見を裏付けた。しかし、宿主遺伝子の発現パタンはHFとIMR32で大きく異なっており、これらの違いがウイルス産生効率などの両者で異なる性質を決定している可能性がある。HCMV許容性が報告されていない3細胞株において、それぞれが異なる宿主遺伝子発現プロファイルを示した事から、これらの細胞株では非許容の程度が同じではなく、ウイルスの増殖サイクルの異なる段階で阻害がおきていることが考えられる。

Human 22,000 & HCMV produced in FY2014 and in FY2014 179 Normal lineage bud cells of 179 のヒトアレイを infected with いて, ヒトサイトメガロウイルス (HCMV) (HF)・IMR32・Saos2・SW982・Y79 cells have been obtained from the remaining cells. HFとIMR32はウイルス伝子に关してきわめて resembles た発appears パタンをshows した. The symptoms of HF infection in the early stages of infection include the emergence of IFN reaction syndrome and the emergence of IMR32.また、SW982ではウイルス伝子の発成変化をほとんど検出できなかったにもかかわらず, IFN reactive residual subgroup の発 appear to rise を weak いながら検出した.さらに、Saos2では、Initial stage of infection に発appears HCMV legacy およびIFN reflexive legacy The group's symptoms are rising and the infection is rising, and the late-stage infection of HCMV is confirmed. Y79では、Infection initial stageにウイルス弝子のわずかな発appearsレベルriseをCaptureえたものの, the host's legacy 伝子の大きな発appears レベル変化を见いだせなかった. The cultured cell line HCMV is permissive, and the normal cell line HF is limited to a small number of cells. IMR32はこのlimited HCMV-permissive cell lineの一つで、小なくともウイルス伝子に风してはHF同様の発appears パタンをshows すことが明らかとなり, これまでの知见を里发けた.しかし、Host's legacy 伝子の発 appear パタンはHFとIMR32で大きくdifferentなっており、これThe difference between the efficiency and the nature of the problem determines the probability of the problem. HCMV permissiveness report: されていない3 cell line: において, それぞれがdifferent なるhost remains 伝子発 appear プロファイルをshow した事から、これThe degree of non-permissibility of らの cell lines is the same as that of じではなく and ウイルスのThe サイクルのdifferent なるsteps are blocked by the がおきていることが卡えられる.