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網膜マイクロアレイと候補SNPを用いた糖尿病性網膜症の遺伝素因の同定

使用视网膜微阵列和候选 SNP 鉴定糖尿病视网膜病变的遗传易感性

基本信息

批准号：
16012222
负责人：
武田純
金额：
$ 4.16万
依托单位：
Gifu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究開始時に所有したラット網膜由来の17,184個の3'ESTからハウスキーパーを除去したマイクロアレイを作成した。同アレイを用いてGKラットの糖尿病発症前後の網膜組織について解析を行なった。糖尿病ラットはヒトと同じ増殖性変化は示さないが、虚血性変化は生じる。そこで前後でmRNA発現が変化する遺伝子をESTアレイを用いて検索した結果、大きく変化した遺伝子群にHypoxia inducible factor(HIF)-1α遺伝子が含まれた。同遺伝子はもともと我々のヒト膵島ESTから同定されたものであるので、インスリン分泌に関する転写調節と網膜症の遺伝リンクを考える上で興味深い分子である。増殖網膜症の血管新生において血管内皮増殖因子VEGFが重要な働きを担うが、VEGF遺伝子は転写因子HIF-1αで正に転写制御される。そこで昨年度に同遺伝子の直接解析を開始した。頻度の高い13個のSNPを求めて、168人の増殖網膜症を有する症例と185人の非糖尿病者の間で関連解析を行ったところ、3'端のSNP-13の出現頻度に有意差を認めた(P=0.0171)。連鎖不平衡を考慮してSNPハプロタイプを構築し、300サンプル数を用いて成績を確認した。このSNPは近隣の3種類のミスセンス変異と有意の連鎖不平衡にあったので、本年度は同cSNPsから原因サイトの特定を試みた。性差、年齢、BMI等で補正した結果、アミノ酸置換であるSNP-10にのみ有意差を見出した。すなわち、Haplotype25-10と10-13においてマイナーアリル2/2の組み合わせにおいて出現頻度に有意差を見出した(p=0.0060,p=0.0005)。そこで現在、PCR-mutagenesisによって変異を野生型に導入し、VEGF遺伝子プロモーターのHRE配列を用いたレポーターアッセイを行ない、変異蛋白の転写調節能を解析した。

At the beginning of this study, all of the three-year-old networks were created by removing all the information from the 17184-year-old network. The same method was used to analyze the network tissue before and after the diagnosis of diabetes with GK. The symptoms of diabetes mellitus (DM) and diabetes mellitus (DM) are similar to those of diabetes mellitus (DM). In front and back of the mRNA, you can use the results of the Hypoxia inducible factor (HIF)-1 α subgroup, which is called Hypoxia inducible factor (HIF)-1 α, to make sure that you can use the results of the experiment. In the same way as I

项目成果

期刊论文数量（11）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Effect of mutations in HNF-1α and HNF-1β on the transcriptional regulation of human sucrase-isomaltase (SI) in Caco2 cells.

HNF-1α 和 HNF-1β 突变对 Caco2 细胞中人蔗糖酶-异麦芽酶 (SI) 转录调控的影响。

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
Biochem.Biophys.Res.Commun. 325
影响因子：
0
作者：
Wulf;G.G.;et al.;稲垣暢也;Y.Shimamoto et al.;Y.Kim.et al.;N.Shihara et al.;S.M.Echwald et al.;N.Gu et al.
通讯作者：
N.Gu et al.

Mutation analysis of NROB2 among 1545 Danish men identifies a novel G93D variant with reduced functional activity.

对 1545 名丹麦男性的 NROB2 突变分析发现了一种功能活性降低的新型 G93D 变体。

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
Hum.Mut. 24
影响因子：
0
作者：
Wulf;G.G.;et al.;稲垣暢也;Y.Shimamoto et al.;Y.Kim.et al.;N.Shihara et al.;S.M.Echwald et al.
通讯作者：
S.M.Echwald et al.

Construction of a multi-functional cDNA library specific for normal mouse pancreatic islets and its application to microarray.

正常小鼠胰岛特异性多功能cDNA文库的构建及其在芯片上的应用

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
DNA Res. 11
影响因子：
0
作者：
Wulf;G.G.;et al.;稲垣暢也;Y.Shimamoto et al.;Y.Kim.et al.;N.Shihara et al.;S.M.Echwald et al.;N.Gu et al.;M.Nishimura et al.
通讯作者：
M.Nishimura et al.

Inhibitory effect of small heterodimer partner hepatocyte nuclear factor-4 mediates bile acid-induced repression of human angiotensinogen gene.

小异二聚体伴侣肝细胞核因子 4 的抑制作用介导胆汁酸诱导的人血管紧张素原基因抑制。