膵島特異的遺伝子の発現調節軸に焦点を絞った糖尿病遺伝子の探索

聚焦胰岛特异性基因表达调控轴寻找糖尿病基因

• 批准号: 18018018
• 负责人: 武田 純
• 金额: $ 7.1万
• 依托单位: Gifu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018018/
• 关键词: 糖尿病; インスリン分泌; 食欲; トランスクリプトーム; 遺伝子多型; 関連解析; 膵島; グルココルチコイド; 生活習慣病; 組織特異性

大規模in situ hybridizationによる候補の獲得膵島特異的機能に関連する遺伝子を網羅的に集積するためにEST in situ hybridizationを確立し,今年度までに特異性の高い発現遺伝子134個(既知43個,未知91個)を同定している。第一段階の遺伝子のうち,機能が明らかな20遺伝子(194/233エクソン)について変異スクリーニングを実施した。その結果,MODYの成因となる遺伝子変異の同定には至っていないが,181SNPを同定することができた。現在,これらのSNPと2型糖尿病の発症との関連を解析している。インスリン分泌と食欲調節との関連についての解析ゲノム配列を用いて特異性の高い遺伝子について,10Kb以内の予測プロモーター配列におけるGREの有無をin siloco解析した。ESTとアレイ解析で2,498個もホルモン合成分泌関連の遺伝子を選別し,さらにgene ontology解析により587個のグルココルチコイド応答遺伝子を得た。rVISTA2.0によるGRE解析により,86個の遺伝子を獲得した。しかし,sgkのみがグルココルチコイド応答性を示した。グルココルチコイド応答遺伝子の解析グルココルチコイド負荷条件により検出した15遺伝子に着目し,3種類がGREを有する候補として選別された(sgk,bc16,pdk4)。プロモーター領域のGC応答配列の転写制御活性はsgkのみに認められたことから,プロモーターを介した直接制御以外のグルココルチコイド調節も生理機能において重要であることが示唆された。さらに,以前に実施されたゲノム全域にわたる感受性遺伝子座のスクリーニングにおいて,気分障害の感受性遺伝子座のマップ領域にsgkが存在したことから,同遺伝子は重要候補と考えられた。現在,SNPハプロタイプを用いた関連解析を進めている。

Large-scale in situ hybridizationによる candidate specimens obtain 膵 island-specific functional に association する remains 伝 を web に accumulation するために in situ hybridizationを established that this year までに specifically has a high <s:1> occurrence of 134 伝 residues (43 known and 91 unknown)を and determined that <s:1> て る る る. Traces of the first Duan Jie の 伝 son の う ち, functional が Ming ら か な 20 heritage 伝 child (194/233 エ ク ソ ン) に つ い て - different ス ク リ ー ニ ン グ を be applied し た. そ の results, MODY の causes と な る heritage 伝 sub - different の with fixed に は to っ て い な い が, 181 SNPS を with fixed す る こ と が で き た. Now, <s:1> れら <s:1> SNPと type 2 diabetes <s:1> occurrence と <s:1> association を analysis of <s:1> て る る る る る. イ ン ス リ ン secretion regulation と appetite と の masato even に つ い て の parsing ゲ ノ ム matched with column を い て high specificity の い posthumous son 伝 に つ い て, の within 10 KB can be プ ロ モ ー タ ー match column に お け る GRE の presence of を siloco in parsing し た. EST と ア レ イ parsing で 2498 も ホ ル モ ン synthetic secretion masato even の heritage 伝 son を し, さ ら に gene ontology parsing に よ り 587 の グ ル コ コ ル チ コ イ ド 応 a heritage 伝 son を た. rVISTA2.0によるGRE resolution によ によ,86 cultural heritage 伝 pieces を obtained た た. Youdaoplaceholder5 ド応,sgk チコ みがグ ココ ココ チコ チコ ド応 ド応 answerable を shows た た. グ ル コ コ ル チ コ イ ド 応 a posthumous son 伝 の parsing グ ル コ コ ル チ コ イ ド load conditions に よ り 検 out し た 15 heritage 伝 に the mesh し, を has 3 kinds が GRE す る alternate と し て choose don't さ れ た (SGK, bc16, pdk4). の GC 応 プ ロ モ ー タ ー field a match column の planning write suppression activity は SGK の み に recognize め ら れ た こ と か ら, プ ロ モ ー タ ー を interface し た directly outside the system of imperial の グ ル コ コ ル チ コ イ ド adjust も physiology に お い て important で あ る こ と が in stopping さ れ た. さ ら に, previously に be applied さ れ た ゲ ノ ム global に わ た る susceptibility heritage 伝 stroma の ス ク リ ー ニ ン グ に お い て, 気 points handicap of の susceptibility heritage 伝 stroma の マ ッ プ field に SGK が exist し た こ と か ら, with heritage 伝 son は important alternate と exam え ら れ た. Now,SNPハプロタ プを プを resolves を into めて る る る using the た correlation.

项目成果

Mutant HNF-1α and mutant HNF-1β identified in MODY3 and MODY5 downregulate DPP-IV gene expression in Caco-2 cells.

MODY3 和 MODY5 中鉴定的突变体 HNF-1α 和突变体 HNF-1β 下调 Caco-2 细胞中的 DPP-IV 基因表达。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Biochem Biophys Res Commun 346
• 作者: N.Gu;et al.
• 通讯作者: et al.

The ratio of leptin to adiponectin can be used as an index of insulin resistance

• DOI: 10.1016/j.metabol.2007.09.011
• 发表时间: 2008-02-01
• 期刊: METABOLISM-CLINICAL AND EXPERIMENTAL
• 影响因子: 9.8
• 作者: Oda, Naohisa;Iniamura, Shigeo;Itoh, Mitsuyasu
• 通讯作者: Itoh, Mitsuyasu

Association studies of variants in the genes involved in pancreatic β-cell function in type 2 diabetes in Japanese

日本 2 型糖尿病患者胰腺 β 细胞功能相关基因变异的关联研究

• 发表时间: 2006
• 期刊: Diabetes 55
• 作者: N.Yokoi;et al.
• 通讯作者: et al.

Sucrase-isomaltase gene expression is inhibited by mutant hepatocyte nuclear factor (HNF)-1α and mutant HNF-1β in Caco-2 cells

• DOI: 10.3177/jnsv.52.105
• 发表时间: 2006-04-01
• 期刊: JOURNAL OF NUTRITIONAL SCIENCE AND VITAMINOLOGY
• 影响因子: 1.6
• 作者: Gu, N;Adachi, T;Yasuda, K
• 通讯作者: Yasuda, K

Association of TCF7L2 polymorphisms with susceptibility to type 2 diabetes in 4,087 Japanese subjects

• DOI: 10.1007/s10038-007-0231-5
• 发表时间: 2008-02-01
• 期刊: JOURNAL OF HUMAN GENETICS
• 影响因子: 3.5
• 作者: Miyake, Kazuaki;Horikawa, Yukio;Kasuga, Masato
• 通讯作者: Kasuga, Masato