翻訳における終結と開始の連携機構の解明

阐明翻译终止与起始之间的协调机制

• 批准号: 17026008
• 负责人: 上田 卓也
• 金额: $ 3.58万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17026008/
• 关键词: 生体外蛋白質合成系; 終結因子; 終止コドン; RRF; tmRNA; smpB

私達は、大腸菌の翻訳因子やリボソームを完全に精製し、再構築したPURE(Protein synthesizing system Using Recombinant Elements)システムを完成させることに成功している。PUREシステムによって翻訳のすべてのプロセスを、試験管のなかで行うことが可能であるばかりではなく、すべてのプロセスのスナッブショットを取ることが可能である。本研究では、RF1とRF2による終止コドンのデコーディングの機構をPUREシステムにより明らかにすることを目標としている。PUREシステムを用いた実験系によって、RF1とRF2の、ペブチドアンチコドン部位に変異を導入し、これらのRFの終止コドンの解読の特性を解析した。その結果、これらのペプチドアンチコドンの領域は、終止コドンの解読特性には関与しないことが示唆された。また、RRFは、翻訳終結後のリボソーム・訳NA複合体を解消のプロセスの解析を行った。その結果、RRFは、リボソームを樹来考えられていた30S、50Sの解離した形ではなく、70Sの状態で解離させることが示された。また、この終結プロセスにおいて、サブユニットの会合の安定性にスペルミジンなどのポリアミンが重要であることが示唆された。さらに、PURE systemを用いて、trans-translationのメカニズム解明を行い、smpBがtmRNAのコドンアンチコドンの相互作用を機能的に補う働きがあることが示された。

PURE(Protein synthesizing system Using Recombinant Elements) system was successfully completed. PURE STEM: PURE STEM: In this study, RF1 and RF2 were used to determine the structure of the system. PURE STEM SYSTEM: RF1, RF2, RF TERMINATION STEM SYSTEM: RF TERMINATION STEM As a result, the domain of the terminal is closed, and the terminal is closed. The analysis of the complex structure after the termination of RRF and RRF was performed. The result is that the RRF is not stable, and the RRF is stable. The final result of this analysis is that the stability of the association is very important. In addition, the PURE system is now in use, the trans-translation and management system is now in operation, and the function of smpB as a complement to the interaction of tmRNA and mRNA is clearly demonstrated.

项目成果

Efficient protein selection based on ribosome display system with purified components

• DOI: 10.1016/j.bbrc.2006.11.017
• 发表时间: 2007-01-05
• 期刊: BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
• 影响因子: 3.1
• 作者: Ohashi, Hiroyuki;Shimizu, Yoshihiro;Ueda, Takuya
• 通讯作者: Ueda, Takuya

Chaperone properties of mammalian mitochondrial translation elongation factor Tu

• DOI: 10.1074/jbc.m608187200
• 发表时间: 2007-02-09
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Suzuki, Hiroaki;Ueda, Takuya;Takeuchi, Nono
• 通讯作者: Takeuchi, Nono

Co-translational binding of GroEL to nascent polypeptides in followed by post-translational encapsulation by GroES to mediate protein folding.

GroEL 与新生多肽共翻译结合，随后由 GroES 进行翻译后封装以介导蛋白质折叠。

• 发表时间: 2006
• 期刊: J Biol Chem 281
• 作者: Ying;B.W.;Taguchi;H.;Ueda;T.
• 通讯作者: T.

Co-translational involvement of the chaperonin GroEL in the folding of newly translated polypeptides.

伴侣蛋白 GroEL 参与新翻译多肽折叠的共翻译。

• 发表时间: 2005
• 期刊: J Biol Chem 280(12)
• 作者: Ying;B.W.;Taguchi;H.;Kondo;M.;Ueda;T.
• 通讯作者: T.

Esterification of Escherichia coli tRNAs with D-histidine and D-lysine by aminoacyl-tRNA synthetases.

通过氨酰基-tRNA 合成酶将大肠杆菌 tRNA 与 D-组氨酸和 D-赖氨酸进行酯化。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Biosci Biotechnol Biochem 69(5)
• 作者: Takayama;T.;Ogawa;T.;Hidaka;M.;Shimizu;Y.;Ueda;T.;Masaki;H.
• 通讯作者: H.