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核内RNPリモデリングと品質管理機構の解明

核RNP重塑和质量控制机制的阐明

基本信息

批准号：
17026010
负责人：
廣瀬哲郎
金额：
$ 3.52万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

哺乳類の遺伝子には長大なイントロンが複数個挿入されている。それらは転写後にRNAスプライシングの機構によって正確に切り取られ、成熟mRNAが形成される。本研究では、このRNAスプライシング反応時に特異的にイントロンに結合し、スプライシング反応後のイベントに関与するIBP160という因子の同定と、その機能解明を中心に以下の成果を得た。1.研究開始時にp160と名付けていたイントロン結合タンパク質の正体を部位特異的UVクロスリンク法と免疫沈降を組み合わせた方法で明らかにし、これまで機能未知のスプライソソーム因子でRNAヘリカーゼ様モチーフを持つタンパク質であることが明らかになった。この因子をIBP160(Intron Binding Protein 160kDa)と命名した。2.IBP160のイントロン上の結合部位を詳細にマッピングし、ブランチ部位上流の33〜40塩基上流の限られた領域に位置特異的/配列非依存的に結合することを見出した。またその結合はスプライシング後期ステージのC1複合体において起こることも実験的に証明した。3.RNA干渉によってIBP160を除去したHeLa細胞から核エクストラクトを抽出し、in vitro反応を行うことによってスプライシングとカップルして生合成が起こるboxC/D snoRNPの会合がIBP160に依存して起こっていることを示した。4.IBP160とEJC構成因子がC1複合体中で相互作用することを部位特異的UVクロスリンクと免疫共沈降によって発見した。上記の研究と平行して、RNAの品質管理の研究も行った。品質管理に関わると考えられるhUPF1,hUPF2,hRrp6などをRNA干渉によってノックダウンし、その結果現れるRNAの蓄積パターンの変化を調べた。その結果、複数のnoncoding RNAやU3 snoRNAなどの核内低分子RNAの前駆体量の上昇などを観察した。

The child of a mammal child grows up to copy several entries. After the RNA has been written, it is necessary to ensure that the machine is properly selected and the mature mRNA is formed. In this study, we tested the combination of the RNA response time response test, and the response time response test. After the anti-response test, we tested the same accuracy as the IBP160 response factor, and the machine was able to understand the following results obtained by the center. 1. At the beginning of the study, p160 was used in combination with the UV assay for the specific location of the body. The immuno-precipitation method was used to determine the effect of the whole body on the immune system. The results showed that there was no significant difference between the two groups in terms of the number of factors involved in the study, and the mechanism was used to determine the effect of the factor on the expression of the gene. The device was used to determine the accuracy of the test. The device was used to determine the accuracy of the test. Name the factor IBP160 (Intron Binding Protein 160kDa). The combination of the upper part of the 2.IBP160 device, the upper part of the upper stream, the upper stream of the upper stream, the location of the upper stream, the location of the domain, the location of the location, the location of the location. This is the first time that the C1 complex will be activated in the later stage of the experiment. In 3.RNA, the HeLa cells were removed, the nucleus was extracted, and the in vitro was reversed. The boxC/D snoRNP was synthesized and the IBP160 dependency was rendezvous. In the 4.IBP160-EJC-factor C1 complex, the interaction was detected by UV co-precipitation and immunoprecipitation. In the previous research, parallel research, RNA quality management, research and line research. Quality management

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

RNAプロセシングを監視する核内RNA品質管理機構

监控 RNA 加工的核 RNA 质量控制机制

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
蛋白質核酸酵素 51
影响因子：
0
作者：
湯山耕平;山本直樹;柳澤勝彦;Yanagisawa K.;Yanagisawa K.;Yanagisawa K.;Yanagisawa K.;Yanagisawa K.;Tetsuro Hirose;井手上賢
通讯作者：
井手上賢

RNAプロセシングの進行を規定するRNPリモデリング

RNP 重塑调节 RNA 加工的进程