ヒト・ゲノム解析研究

人类基因组分析研究

• 批准号: 03NP0401
• 负责人: 松原 謙一
• 金额: --
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Creative Basic Research
• 财政年份: 1991
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1991 至 1995
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03NP0401/
• 关键词: ヒト・ゲノム; ゲノム構造解析; ゲノム機能解析; cDNA; DNA解析技術; モデル生物; 生物情報科学; 物理的地図; 遺伝的地図; 塩基配列決定

生命の設計図であるゲノムの構造と機能を研究解析し、そこに包含される遺伝情報を理解するために、総括班ならびに3つの研究班を組織して研究の推進を図り、次の成果を得た。1.総括班。全体としての活動を円滑に進めるため各種会合の企画立案調整、機器の計画的購入と配分、情報交流、評価などを積極的に進めるほか、米国における新技術等の調査や各センタ-との打合わせ等により国際的に整合性のある我国のゲノム研究体制を確立した。また、社会の接点の問題研究の一環として国際生命倫理福井セミナ-を開き広く意見の交流と問題点の整理を図った。2.ヒト・ゲノム構造解析班。ヒト染色体21番につき殆ど完全な形のNot I酒限酵素切断地図を作成したほか、6,8,X,Y,11につき約0.5〜2メガベ-スの密度でマ-カ-を置いてゆく物理的地図の作成作業を開始し、特定領域についてこれを完成させたほか、全体として約1/3〜1/2程度の完成度の地図作りを行った。これらの成果は、ゲノムデ-タベ-ス作成における1991年度分の国際的作業の約半分近くを占める貢献である。これと並んで、特定領域の詳細なマップ作りを進める作業を、免疫グロブリン遺伝子H鎖V領域とHLA遺伝子群について実行した。これは、大づかみなマップ作りが終わった後に来るべき仕事のモデルとなる先導的研究である。本年度のうちに、大量の資料を扱いつつそれらを処理、分析し、デ-タ化して整理する方法論の開発と実行において著しい進展を見せることができた。3.cDNA解析班。ヒト肝細胞の中で発現している全遺伝子をカタログ化し、その発現頻度まで解析できる「3特異的cDNAライブラリ-分析」がスタ-トし、約2000クロ-ンの分析を終えるという成果を挙げた。この成功は、次年度から各臓器における発現遺伝子の系統的解析プロジェクトに発展できるものであり、世界に先駆けてゲノム研究に構造解析のみでなく機能解析をも並行して行うべきであるとする新しい方向性を与えるものである。これに伴って良質なcDNAライブラリ-の作成やその迅速な分類、カタログ化、デ-タ整理などにおける新しい手法が種々開発され、世界のcDNA研究者数の急速な増大を誘導するきっかけを作ったものと評価できる。4.DNA解析技術開発班。DNAの分離、切断、クロ-ニング、染色体上へのマッピング等に関わる技術開発を進める中から、二次元電気泳動技術によるゲノムスキャンニング法の確立、T3ファ-ジによるDNA欠失セットの作成技術、BUDRを用いる染色体の分染とin situハイブリッド法の組み合わせ技術の確立という国際視献技術を完成することができた。また、枯草菌、分裂酵母、線虫をモデル生物として選び国内と国際協力してゲノムデ-タベ-スを作り且つそれに伴って高度の技術開発とデ-タベ-ス間の相互比較を導くシステム作りを現実化することができた。次年度から具体的成果の奔流が予想できる。

Life design, structure, function, research, analysis, analysis 1. Comprehensive classes. All kinds of activities are carried out in a smooth way, and various kinds of joint project filing adjustment, equipment purchase and distribution, information exchange, evaluation, active progress, research on new technologies in the United States, international integration, establishment of China's national research system, etc. are carried out. Also, as part of the research on issues at the interface of society, Fukui Himina, an international bioethics expert, will open up a wide range of exchanges of opinions and sorting out problem points. 2. The structural analysis class. Chromosome 21 is almost completely shaped and Not I. Enzymes are cut off. The density of chromosome 21 is about 0.5 ~ 2. The density of chromosome 21 is about 1/3 ~ 1/2. In 1991, about half of the international work was contributed to the success of the project. For example, in the case of a specific domain, the specific domain is specified in detail, and the specific domain is specified in detail. This is the first time I've ever done this. This year, a large number of data were processed, analyzed and organized, and the methodology was developed and developed. 3. cDNA analysis class. The complete cDNA sequence was detected in the liver cells, and the frequency of its occurrence was analyzed. The results of the analysis of 3-specific cDNA sequences were analyzed in about 2000 years. This success is due to the analysis and development of the discovery subsystem system of each device in the next year, and the development of the world's first research, structural analysis, functional analysis, parallel operation, new orientation and development. The rapid development of new methods for the classification, classification, and organization of high-quality cDNA, as well as the rapid increase in the number of cDNA researchers worldwide, has led to a rapid increase in the number of cDNA researchers worldwide. 4. DNA analysis technology development class. DNA isolation, cleavage, chromosome separation, chromosome separation, etc. related technology development, secondary electrokinetic technology, the establishment of the DNA separation method, T3-DNA DNA deletion technology, BUDR use of chromosome separation in situ, the establishment of the assembly technology, the completion of international vision technology. In addition, the selection and domestic and international cooperation of various biological organisms such as subtilis, fission yeast, and nematode require the development of real-time systems, and this is accompanied by a high degree of technical development and mutual comparison between real-time systems. The next year, concrete achievements will flow forward and be thought of as "".

项目成果

Tokino,T.,Imai,T.,Tanigami,A.,Takiguchi,S.and Nakamura,Y.: "Physical mapping of a 950-db region surrounding a locus (D10S102) tightly linked to the MEN2A gene." Genomics. 12. 394-400 (1992)

Tokino,T.、Imai,T.、Tanigami,A.、Takiguchi,S. 和 Nakamura,Y.：“与 MEN2A 基因紧密连锁的基因座 (D10S102) 周围 950 db 区域的物理图谱。”

Arinami,T.,Ishikawa,M.,Inoude,A.,Yanagisawa,M.,Masaki,T.,Yoshida,M.C.and Hamaguchi,H.: "Chromosomal assignments of the human endothelin family genes:The endothelin-1 gene (EDN1) to 6p23-p24,the endothelin-2 (EDN2) to 1p34,and the endothelin-3 gene (EDN3)

Arinami,T.、Ishikawa,M.、Inoude,A.、Yanagisawa,M.、Masaki,T.、Yoshida,M.C. 和 Hamaguchi,H.：“人类内皮素家族基因的染色体分配：内皮素-1 基因（

Miyao,A.,Yoshimura,A.,Sato,T.,Yamamoto,T.,Theeragool,G.,and Kobayashi,Y.: "Sequence of the Bacillus subtilis homolog of Escherichia coli cell division gene murG." Gene. (1992)

Miyao,A.、Yoshimura,A.、Sato,T.、Yamamoto,T.、Theeragool,G. 和 Kobayashi,Y.：“大肠杆菌细胞分裂基因 murG 的枯草芽孢杆菌同源物的序列”。

Yoshikawa,H.and Ogasawara,N.: "Structure and function of DnaA and the DnaA-box in eubacteria:evolutionary relationships of bacterial replication origins." Mol.Microbiol.5. 2589 (1991)

Yoshikawa, H. 和 Ogasawara, N.：“真细菌中 DnaA 和 DnaA-box 的结构和功能：细菌复制起源的进化关系。”

Kawasaki,K.,Minoshima,S.,Kudoh,J.,Fukuyama,R.and Shimizu,N.: "Methylation Status of Ribosomal RNA Gene Clusters in the Flow-Sorted Human Acrocentric Chromosomes,Mammalian Genome"

Kawasaki,K.、Minoshima,S.、Kudoh,J.、Fukuyama,R. 和 Shimizu,N.：“流式分选人类近端着丝粒染色体、哺乳动物基因组中核糖体 RNA 基因簇的甲基化状态”