Ｋｅａｐ１－Ｎｒｆ２の相互作用を阻害する擬天然物特殊ペプチドのプロドラッグ化

抑制 Keap1-Nrf2 相互作用的伪天然产物特殊肽的前药化

• 批准号: 13F03730
• 负责人: 菅 裕明
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13F03730/
• 关键词: ペプチド; ケミカルバイオロジー; キモカイン; トランスポーター; 遺伝記号; 特殊ペプチド; tRNAアルシ化; 翻訳; アミノ酸; リボソーム

CXCR7を標的とした特殊環状ペプチドの探索CXCR7はGPCRファミリー膜タンパク質の一つであり、炎症誘導因子キモカインの一つであるCXCL12を受容タンパク質として知られている。また、この受容体はHIVに代表されるウィルス感染において重要な標的タンパク質としても知られている。Geielmann博士は、磁気ビーズに固定化したCXCR7に対し、特殊環状ペプチドライブラリーを用いたRaPIDセレクションを行い、結果として12種類の特殊ペプチドを発見した。これら個々の特殊環状ペプチドクローンをRaPIDディスプレイで評価したところ、いずれもバックグラウンド（ビーズ単独）の数千倍の結合能力を示し、定性的ではあるがCXCR7に対して結合できる特殊環状ペプチドが発見できた証拠を得た。そこでこれらを全て化学合成し、共同研究先に送付、現在さらなる結合評価と生理活性評価、ならびに共結晶化を進めている。(2) hTOM40を標的とした特殊環状ペプチドの探索Geielmann博士は、磁気ビーズに固定化したhTOM40に対し、特殊環状ペプチドライブラリーを用いたRaPIDセレクションを行い、結果として多種類の特殊ペプチドを発見した。これらのうち、８種類の特殊環状ペプチドを選び、個々の特殊環状ペプチドクローンをRaPIDディスプレイで評価したところ、いずれもバックグラウンド（ビーズ単独）に対し優位な結合能力を示し、定性的ではあるがhTOM40に対して結合できる特殊環状ペプチドが発見できた証拠を得た。そこでこれらの特殊環状ペプチドを化学合成し、それぞれの解離定数をSPR-Biacoreを用いて解析した。その結果、130 nM～1000 nMのレンジで結合することがわかった。残念ながら、それほど高い親和性をもっているとは言い難い特殊環状ペプチドではあるが、これはら全て共同研究先に送付、フリブルグ大Schneider研で生理活性評価、ならびにバーゼル大Hiller研で共結晶化を進めている。

CXCR7 を mark と し た special annular ペ プ チ ド の explore CXCR7 は GPCR フ ァ ミ リ ー membrane タ ン パ ク qualitative の a つ で あ り, inflammation induced factor キ モ カ イ ン の a つ で あ る CXCL12 を by let タ ン パ ク qualitative と し て know ら れ て い る. ま た, こ の に representative by let body は HIV さ れ る ウ ィ ル ス infection に お い て important な mark タ ン パ ク qualitative と し て も know ら れ て い る. Dr Geielmann は, magnetic 気 ビ ー ズ に immobilized し た CXCR7 に し seaborne, special annular ペ プ チ ド ラ イ ブ ラ リ ー を with い た RaPID セ レ ク シ ョ ン を い, results と し て 12 kinds の special ペ プ チ ド を 発 see し た. こ れ ら a 々 の special annular ペ プ チ ド ク ロ ー ン を RaPID デ ィ ス プ レ イ で review 価 し た と こ ろ, い ず れ も バ ッ ク グ ラ ウ ン ド (ビ ー ズ 単) alone thousands of times の の combining ability を し, qualitative で は あ る が CXCR7 に し seaborne て combining で き る special annular ペ プ チ ド が 発 see で き た card 拠 を た. そ こ で こ れ ら を し て chemical synthesis, joint research に first pay, now さ ら な る combination evaluation 価 と physiological activity evaluation 価, な ら び に total crystallization を into め て い る. (2) hTOM40 を mark と し た special annular ペ プ チ ド の explore Geielmann Dr は, magnetic 気 ビ ー ズ に immobilized し た hTOM40 に し seaborne, special annular ペ プ チ ド ラ イ ブ ラ リ ー を with い た RaPID セ レ ク シ ョ ン を い, results と し て variety の special ペ プ チ ド を 発 see し た. こ れ ら の う ち, 8 species の special annular ペ プ チ ド を び, a 々 の special annular ペ プ チ ド ク ロ ー ン を RaPID デ ィ ス プ レ イ で review 価 し た と こ ろ, い ず れ も バ ッ ク グ ラ ウ ン ド (ビ ー ズ 単 alone) に し seaborne primacy な combining ability を し, qualitative で は あ る が hTOM40 に し seaborne て combining で き る special annular ペ Youdaoplaceholder0 presents で た た た certifies 拠を to た. そ こ で こ れ ら の special annular ペ プ チ ド を chemical synthetic し, そ れ ぞ れ の dissociation constant を SPR - Biacore を with い て parsing し た. The そ そ result, 130 nM to 1000 nM レ ジで ジで ジで combined with する する とがわ とがわ った った った. Remnants read aloud な が ら, そ れ ほ ど い high affinity を も っ て い る と い い special difficult は words ring ペ プ チ ド で は あ る が, こ れ は ら て all joint research に first pay, フ リ ブ ル グ Schneider research review 価 で physiological activity, な ら び に バ ー ゼ ル Hiller research で including crystallization を into め て い る.

项目成果

Hydrolysis-Resistant RNA-Peptide Conjugates that Bind to the Ribosome

与核糖体结合的抗水解 RNA 肽缀合物

• 发表时间: 2014
• 作者: Anna-Skrollan Geiermann;Donna Matzov;Ada Yonath;Ronald Micura
• 通讯作者: Ronald Micura

Native chemical ligation of hydrolysis-resistant 3’-NH-cysteine-modified RNA, Curr. Protoc.

抗水解 3-NH-半胱氨酸修饰 RNA 的天然化学连接，Protoc。

• 发表时间: 2015
• 期刊: Nucleic Acid Chem.manuscript under revision
• 作者: Anna-Skrollan Geiermann and Ronald Micura

フリブルグ大学/バーゼル大学(スイス)

弗里堡大学/巴塞尔大学（瑞士）

Chemical synthesis of hydrolysis-resistant 3'-peptidyl-tRNA mimics that bind to the ribosome

与核糖体结合的抗水解 3-肽基-tRNA 模拟物的化学合成

• 发表时间: 2014
• 作者: Anna-Skrollan Geiermann;Donna Matzov;Anat Bashan;Ada Yonath
• 通讯作者: Ada Yonath

Native chemical ligation of hydrolysis-resistant peptide-RNA conjugates that bind to the ribosome

与核糖体结合的抗水解肽-RNA 缀合物的天然化学连接

• 发表时间: 2014
• 作者: Anna-Skrollan Geiermann;Donna Matzov;Anat Bashan;Ada Yonath
• 通讯作者: Ada Yonath