RNA-Erkennung durch modifizierte Aminoglycoside

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Derzeit ist eine zuverlässige Voraussage der selektiven Bindung eines neuen potentiellen Liganden an eine RNA noch nicht möglich. Allerdings wäre das rationale Design und die Vorhersagen der Bindungseigenschaften von Liganden von großer Bedeutung, da mit Hilfe solcher Wechselwirkungen u. a. die Entwicklung antiviraler Verbindungen möglich wäre. In dem hier zur Bewilligung eingereichten Projektvorschlag sollen Informationen über das Bindungsverhalten durch die Kombination von verschiedenen Bindungsmotiven erhalten werden. Wir wollen versuchen, auf der Basis der bekannten Bindungsmotive durch gezielte Veränderung zu selektiven Liganden zu gelangen. Dabei sollen ganz bewußt zwei Bindungsmotive kombiniert werden, da wir somit einen kompetetiven Vergleich zweier Motive erhalten, der wiederum zusätzliche Informationen über die spezifische Bindung an RNA liefert. Zu diesem Zweck sollen Neomycin und davon abgeleitete Strukturen, von denen bekannt ist, daß sie in der Stamm-Region der TAR-RNA binden, guanidiert oder mit Arginin-reichen Peptiden verknüpft werden.