修飾塩基を含むRNAの化学合成
修飾塩基を含むRNAの化学合成
批准号:
12029207
负责人:
和田 猛
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 --
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英文摘要
天然には、tRNAをはじめとして、A,C,G,U以外の修飾塩基を含む核酸分子が数多く存在し、それぞれが固有の構造と生理活性を担っている。本研究は、これらの修飾塩基を含む核酸分子を化学合成し、修飾塩基の構造特性、反応性、物理化学的性質、生理活性を化学的な立場から明かにすることを究極の目的とする。ごく最近、Watanabe,SuzukiらはミトコンドリアtRNAから2種類の新規修飾ウリジンを単離した。これらはミトコンドリア病と呼ばれる疾病の発病メカニズムに関与していることが強く示唆されている。これらの新規修飾ウリジンは、詳細な質量分析からウラシルおよび2-チオウラシルの5位がタウリノメチル基で修飾された構造(τm^5Uおよびτm^5s^2U)であると推定した。そこで、本研究ではτm^5Uおよびτm^5s^2Uを化学合成し、これらの構造決定を行った。2',3'-O-イソプロピリデンウリジンに対してパラホルムアルデヒドとタウリンをトリエチルアミンの存在下で反応させたところ、ウラシル塩基の5位にタウリノメチル基を導入することができた。保護基を除去した後に、逆相カラムクロマトグラフィーで精製を行い、τm^5Uを25%の収率で単離した。得られた化合物の構造は^1HNMRおよび^<13>CNMRで確認した。また、合成した化合物はミトコンドリアより単離された標品と^1HNMRおよびMS,MS-MSスペクトルが完全に一致し、化学構造を決定することができた。一方、2',3'-O-イソプロピリデン-2-チオウリジンに対しても同様の反応を試みたところ、τm^5s_2Uを合成することができた。現在、得られた化合物の構造解析を詳細に行っている。
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Sekine,M.,Kurasawa,O.,Shoda,K.,Seio.,K,Wada,T.: "Synthesis and Properties of Oligonucleotides Having a Phosphorus Chiral Center by Incorporation of Conformationally Rigid 5'-Cyclouridylic Acid Derivatives"J.Org.Chem.. 65・20. 6515-6524 (2000)
Sekine, M.、Kurasawa, O.、Shoda, K.、Seio., K、Wada, T.:“通过掺入构象刚性 5-环尿苷酸衍生物来合成具有磷手性中心的寡核苷酸及其性质”J。有机化学.. 65・20.
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Sekine,M.,Kurasawa,O.,Shohda,K.,Seio,K.,and Wada,T.: "Synthesis and Properties of Oligodeoxynucleotides Incorporating a Conformationally Rigid Uridine Unit Having a Cyclic Structure at the 5'-Terminal Site"J.Org.Chem.. 65・17. 5104-5113 (2000)
Sekine, M.、Kurasawa, O.、Shohda, K.、Seio, K. 和 Wada, T.:“包含在 5 末端位点具有环状结构的构象刚性尿苷单元的寡脱氧核苷酸的合成和特性”有机化学杂志 65・17. (2000)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Moriguchi,T.,Yanagi,T.,Kunimori,M.,Wada,T.and Sekine,M.: "Synthesis and Properties of Aminoacylamido-AMP : Chemical Optimization for the Construction of an N-Acyl Phosphoramidate Linkage"J.Org.Chem.. 65・24. 8229-8238 (2000)
Moriguchi, T.、Yanagi, T.、Kunimori, M.、Wada, T. 和 Sekine, M.:“氨基酰氨基-AMP 的合成和性能:构建 N-酰基磷酸酰胺键的化学优化”J.Org .化学.. 65・24. 8229-8238 (2000)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Tsuruoka,Y.Shoda,K.Wada,T.and Sekine,M.: "Synthesis and Conformational Properties of Oligonucleotides Incorporating 2'-O-phosphorylated Ribonucleotide as Structural Motifs of Pre-tRNA Splicing Intermediates"J.Org.Chem.. 65・12. 7479-7494 (2000)
Tsuruoka, Y. Shoda, K. Wada, T. 和 Sekine, M.:“掺入 2-O-磷酸化核糖核苷酸作为前 tRNA 剪接中间体结构基序的寡核苷酸的合成和构象特性”J.Org.Chem.. 65・12。7479-7494(2000)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Wada,T.,Shimizu,M.,Oka,N.and Saigo,K.: "A novel approach to the synthesis of oligodeoxyribonucleotide boranophosphates"Nucleic Acids Symposium Series. 44. 135-136 (2000)
Wada,T.、Shimizu,M.、Oka,N. 和 Saigo,K.:“合成寡脱氧核糖核苷酸硼磷酸酯的新方法”核酸研讨会系列。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
高活性・低毒性を両立する立体制御ボラノホスフェート核酸医薬の開発
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批准号:23K21353
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2024
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负责人:和田 猛
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依托单位:
Development of stereopure boranophosphate oligonucleotide therapeutics having both high activity and low toxicity
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批准号:21H02610
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2021
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负责人:和田 猛
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依托单位:
ボラノホスフェートDNAを用いるHIV-nefタンパク質の発現制御
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批准号:13015205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2001
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负责人:和田 猛
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依托单位:
新規アンチセンス核酸を用いるHIV-nefタンパク質の発現制御
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批准号:12035205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:和田 猛
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依托单位:
修飾塩基を含むRNAの化学合成および構造と機能の探索
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批准号:11155210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:和田 猛
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依托单位:
新規アンチセンス核酸を用いるエイズウイルス遺伝子の発現制御
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批准号:11161212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:和田 猛
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依托单位:
官能基選択的ホスホリル化反応を用いる機能性核酸の分子構築
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批准号:09780524
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:和田 猛
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依托单位:
エイズウイルス遺伝子を標的とした新規アンチセンス核酸のマルチ固相合成
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批准号:10180209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:和田 猛
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依托单位:
アミノ基・リン酸基無保護法による新規アンチセンス核酸の分子構築
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批准号:08878084
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1996
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负责人:和田 猛
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依托单位:
超高速DNA/RNA化学合成法の開発-酵素反応にせまる効率的核酸合成反応-
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批准号:06780462
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1994
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负责人:和田 猛
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依托单位:
環状ADPリボースの化学合成-イオン輸送のカギを握る新しい情報伝達分子-
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批准号:05858076
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1993
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负责人:和田 猛
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依托单位:
6-N-ホスホリルアデノシンの化学合成とその生理活性に関する研究
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批准号:04854053
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1992
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负责人:和田 猛
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依托单位:
国内基金
海外基金
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tRNA来源小片段RNA调控胎盘滋养细胞凋亡参与子痫前期发病机制的研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:15.0万元
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批准年份:2024
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负责人:郭智伟
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依托单位:
五子二参汤“滋阴佐阳”调控tRNA来源小RNA途径的生精机制研究
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批准号:82374461
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项目类别:面上项目
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资助金额:52.00万元
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批准年份:2023
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负责人:罗杰坤
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依托单位:
tRNA来源的新型非编码小RNA调控成骨分化的作用机制研究
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批准号:82360177
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:32万元
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批准年份:2023
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负责人:汪涛
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依托单位:
tRNA-derived small RNA上调YBX1/CCL5通路参与硼替佐米诱导慢性疼痛的机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2022
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负责人:张祥忠
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依托单位:
十字花科黑腐病菌全基因组tRNA衍生小RNA(tsRNA)鉴定及功能研究
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批准号:32160035
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:34万元
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批准年份:2021
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负责人:唐东阶
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依托单位:
tRNA来源小片段RNA tiRNA-8080在结直肠癌发生发展中的作用及机制研究
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批准号:82173001
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项目类别:面上项目
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资助金额:54.7万元
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批准年份:2021
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负责人:郭智伟
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依托单位:
tRNA片段及RNA磷硫酰化修饰在细胞应激反应中的动态变化规律研究
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:58万元
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批准年份:2020
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负责人:曹博
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依托单位:
tRNA片段及RNA磷硫酰化修饰在细胞应激反应中的动态变化规律研究
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批准号:32070629
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2020
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负责人:曹博
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依托单位:
TET2蛋白通过RNA5-羟甲基胞嘧啶修饰调控tRNA片段产生
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批准号:2020JJ4179
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2020
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负责人:何崇圣
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依托单位:
线粒体tRNA修饰酶MTU1缺陷影响线粒体RNA代谢水平的作用机制
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批准号:LQ21C060004
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2020
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负责人:陈潮
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依托单位: