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修飾塩基を含むRNAの化学合成

含有修饰碱基的 RNA 的化学合成

基本信息

批准号：
12029207
负责人：
和田猛
金额：
$ 1.34万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12029207/
关键词：
修飾塩基 RNA tRNA ミトコンドリアミトコンドリア病 τm^5U τm^5s^2U

项目摘要

天然には、tRNAをはじめとして、A,C,G,U以外の修飾塩基を含む核酸分子が数多く存在し、それぞれが固有の構造と生理活性を担っている。本研究は、これらの修飾塩基を含む核酸分子を化学合成し、修飾塩基の構造特性、反応性、物理化学的性質、生理活性を化学的な立場から明かにすることを究極の目的とする。ごく最近、Watanabe,SuzukiらはミトコンドリアtRNAから2種類の新規修飾ウリジンを単離した。これらはミトコンドリア病と呼ばれる疾病の発病メカニズムに関与していることが強く示唆されている。これらの新規修飾ウリジンは、詳細な質量分析からウラシルおよび2-チオウラシルの5位がタウリノメチル基で修飾された構造(τm^5Uおよびτm^5s^2U)であると推定した。そこで、本研究ではτm^5Uおよびτm^5s^2Uを化学合成し、これらの構造決定を行った。2',3'-O-イソプロピリデンウリジンに対してパラホルムアルデヒドとタウリンをトリエチルアミンの存在下で反応させたところ、ウラシル塩基の5位にタウリノメチル基を導入することができた。保護基を除去した後に、逆相カラムクロマトグラフィーで精製を行い、τm^5Uを25%の収率で単離した。得られた化合物の構造は^1HNMRおよび^<13>CNMRで確認した。また、合成した化合物はミトコンドリアより単離された標品と^1HNMRおよびMS,MS-MSスペクトルが完全に一致し、化学構造を決定することができた。一方、2',3'-O-イソプロピリデン-2-チオウリジンに対しても同様の反応を試みたところ、τm^5s_2Uを合成することができた。現在、得られた化合物の構造解析を詳細に行っている。

The number of nucleic acid molecules containing modified groups other than A,C,G and U in nature is large, and the structure and physiological activity of the nucleic acid molecules are important. In this study, the chemical synthesis, structural characteristics, reactivity, physicochemical properties and physiological activities of nucleic acid molecules containing modified groups were studied. Recently, Watanabe,Suzuki has changed the rules of the two kinds of modifications. The disease is caused by the presence of a virus in the body, and the presence of a virus in the body. This new modification is based on a detailed mass analysis of the 5-bit structure (τm^5U − τm^5s^2U). This study is based on chemical synthesis and structural determination. The 2',3'-O-type software contains the following five bits: the first bit of the software, the second bit of the software, and the third bit of the software After the protective group is removed, the reverse phase is refined, and the recovery rate is 25%. The structure of the compound was confirmed by 1HNMR and <13>CNMR. The compounds were synthesized and identified by 1HNMR and MS spectra. The chemical structures of the compounds were determined. A square, 2',3'-O-solution is prepared by mixing the two solutions. Now, the structural analysis of these compounds has been carried out in detail.