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基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性

基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
全面分离基本转录因子TFIID控制的靶基因及其启动子特征
批准号：
12206060
负责人：
古久保 哲朗
金额：
$0.0万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2000 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12206060/
关键词：
転写因子基本転写因子転写制御出芽酵母転写調節機構マイクロアレイTFIIDTAF

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项目成果

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TATAボックス/イニシエーター等のコアプロモーター構造を認識する基本転写因子TFIIDは、転写開始前複合体のアッセンブリーに際して核となる分子であり、転写調節因子から受け取った信号を転写量の増減へと変換する上で中心的な役割を果たす。我々はTFIIDサブユニット(TAF)の生体内機能について解析を進める過程で、yTAF145のN末端に存在するTBP機能阻害領域(TAND;TAF N-terminal domain)がTFIIDによる転写活性化の分子スイッチとして機能する可能性を見い出した。またコアプロモーターの認識能に異常をきたすyTAF145点変異体(N568Δ,T657K)を新たに単離し、認識配列を決定するべく詳細なエレメントマッピングを進め、これらの変異株においてはTATAボックス以外のコアプロモーターエレメントの認識に異常が見られることを示した。一方、上記ΔTAND株についてゲノムスケールで標的遺伝子を探索したところ、再現性のある14個の候補遺伝子を見出した。標的遺伝子の数が見かけ上極めて限られているのは、他の転写因子複合体が転写活性化においてTFIIDと重複した役割を果たすためと考えられる。またN568Δ,T657K株についてもアレイ解析を行い、それぞれ約240個、約500個の標的候補遺伝子を同定した。またN568Δ株については約240個、T657K株については約500個の候補遺伝子を同定したが、このうち170個が共通であり、残り70個、330個についてはそれぞれの変異株に特異的であった。すなわち少なくとも170+70+330=570個の遺伝子の発現が、何らかの形でyTAF145の中央領域の機能に依存するものと考えられる。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
C.R.Lim,Y.Kimata,H.Ohdate,T.Kokubo,N.Kikuchi,T.Horigome,K.Kohno: "The Saccharomyces cerevisiae RuvB-like protein, tih2p, is required for cell cycle progression and RNA polymerase II-directed transcription"Journal of Biological Chemistry. 275・29. 22409-224
C.R. Lim、Y. Kimata、H. Ohdate、T. Kokubo、N. Kikuchi、T. Horigome、K. Kohno：“酿酒酵母 RuvB 样蛋白 tih2p 是细胞周期进展和 RNA 聚合酶 II 指导所必需的转录“生物化学杂志.275・29.22409-224
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
T.Kotani,K-i.Banno,M.Ikura,A.G.Hinnebusch,Y.Nakatani,M.Kawaichi,T.Kokubo: "A role of transcriptional activators as anti-repressors for the auto-inhibitory activity of TATA box binding of TFIID"Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 97・13. 7178-7183 (2000)
T. Kotani、K-i. Banno、M. Ikura、A. G. Hinnebusch、Y. Nakatani、M. Kawaichi、T. Kokubo：“转录激活剂作为 TFIID 的 TATA 盒结合的自动抑制活性的抗阻遏物的作用”美国国家科学院院刊 97・13。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
A.Kobayashi,T.Miyake,Y.Ohyama,M.Kawaichi,T.Kokubo: "Mutations in the TATA binding protein, affecting transcriptional activation, show synthetic lethality with the TAF145 gene lacking the TAFN-terminal domain in Saccharomyces cerevisiae"Journal of Biologic
A.Kobayashi、T.Miyake、Y.Ohyama、M.Kawaichi、T.Kokubo：“TATA 结合蛋白的突变影响转录激活，在酿酒酵母中缺乏 TAFN 末端结构域的 TAF145 基因显示出合成致死性”杂志
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Y.Tsukihashi,T.Miyake,M.Kawaichi,T.Kokubo: "Impaired core promoter recognition caused by novel yeast TAF145 mutations can be restored by creating a canonical TATA element within the promoter region of the TUB2 gene"Molecular and Cellular Biology. 20・7. 23
Y. Tsukihashi、T. Miyake、M. Kawaichi、T. Kokubo：“通过在 TUB2 基因的启动子区域内创建规范的 TATA 元件，可以恢复由新型酵母 TAF145 突变引起的核心启动子识别受损”《分子与细胞生物学》。 20・7.23
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
出芽酵母におけるプロモーターリプログラミング因子の同定とコア因子選択機構の解明
  • 批准号：
    23K05642
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $3.0万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    古久保 哲朗
  • 依托单位：
    Yokohama City University
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
  • 批准号：
    20052024
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $4.61万
  • 财政年份：
    2008
  • 负责人：
    古久保 哲朗
  • 依托单位：
    Yokohama City University
新規窒素固定菌における遺伝子発現の可視化
  • 批准号：
    06F05755
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $0.77万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    古久保 哲朗
  • 依托单位：
    Yokohama City University
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
  • 批准号：
    18055028
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $5.57万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    古久保 哲朗
  • 依托单位：
    Yokohama City University
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