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A simple system for developing the microsatellite markers using RSE-PCR and pyrosequencing

A simple system for developing the microsatellite markers using RSE-PCR and pyrosequencing
使用 RSE-PCR 和焦磷酸测序开发微卫星标记的简单系统
批准号：
24658138
负责人：
SHIRAISHI Susumu
金额：
$2.5万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2012
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2012 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24658138/
关键词：
DNAマーカーマイクロサテライト4塩基繰返し森林科学育種学分子生態学４塩基繰返し

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项目成果

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DNA molecular markers were widely utilized as powerful tool in breeding, genetics, and ecology. Among these markers, microsatellite marker is highly variable, and possesses a large quantity of genetic information. Constructing a new system, a next generation sequencer (pyrosequencing) was introduced to gain the huge sequences of microsatellite regions in genomes. The new system showed the possibility for a simple and inexpensive microsatellite development.
期刊论文(4)
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会议论文
Development of tetranucleotide microsatellite markers in Pinus kesiya Royle ex Gordon
凯西亚松四核苷酸微卫星标记的开发
DOI： 10.1007/s12686-012-9814-3
发表时间： 2012
期刊： Conservation Genetics Resources
影响因子： 1.1
作者： [D. V. Thao, M. Yamashita, A. Watanabe, S. Shiraishi]
通讯作者： S. Shiraishi
Isolation and characterization of tetranucleotide microsatellite markers for Pinus merkusii
梅库斯松四核苷酸微卫星标记的分离和表征
DOI： --
发表时间： 2013
期刊： Conservation Genet Resour
影响因子： --
作者： [Thao DV, Widyatmoko AYPBC, Guan L Watanabe A, Gotoh E, Shiraishi S]
通讯作者： Shiraishi S
A simple sequencing system of complete chloroplast genome using long PCR and NGS in coniferous species
  • 批准号：
    25660124
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.5万
  • 财政年份：
    2013
  • 负责人：
    SHIRAISHI Susumu
  • 依托单位：
    Kyushu University
A new feed profiling using DNA information for wild-herbivores
  • 批准号：
    22658050
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.29万
  • 财政年份：
    2010
  • 负责人：
    SHIRAISHI Susumu
  • 依托单位：
    Kyushu University
Global transcriptome analysis of the pine wilt disease and application to the resistance breeding
  • 批准号：
    21380100
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.23万
  • 财政年份：
    2009
  • 负责人：
    SHIRAISHI Susumu
  • 依托单位：
    Kyushu University
Constructing a new breeding system for afforestation CDM in tropical Acacia forestry
  • 批准号：
    17208014
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额：
    $29.12万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    SHIRAISHI Susumu
  • 依托单位：
    Kyushu University
海外基金