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視交叉上核由来細胞を用いた哺乳類概日リズム発振システムのシミュレーション

視交叉上核由来細胞を用いた哺乳類概日リズム発振システムのシミュレーション
使用视交叉上核来源细胞模拟哺乳动物昼夜节律振荡系统
批准号：
18016033
负责人：
程 肇
金额：
$5.25万
依托单位：
Mitsubishi Kagaku Institute of Life Sciences
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2007
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18016033/
关键词：
概日リズム視交叉上核時計遺伝子シミュレーション

项目摘要

项目成果

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1.SCN由来細胞のmRNAが示す動的反応性の網羅的解析SCN由来細胞のmRNAが示す動的反応性を包括的に解析した。特にPer1::luc導入SCN由来細胞を用いて,トランスクリプトーム解析を行い見出した概日発現振動遺伝子の機能は,細胞複製,遺伝子転写,生体物質代謝,アポトーシズ等細胞活動の多岐にわたっていた。一方,化合物刺激による位相前進や後退時に特異的発現変動を示す遺伝子を抽出して,二つの結果を統合したデータベースを構築した。この中に含まれる全遺伝子78個について,概日リズム形成のコアフィードバックループにより支配されている遺伝子は,ロバストな振動(48個)と迅速な位相変化(48個)という特性を保持しているという仮定に基づき階層的クラスタリングを実施した。明期性の振動を示す二つのクラスターに含まれる遺伝子のプロモータ構造にはCRE及びE boxが高い頻度で存在した。この結果は明期性の振動の維持と迅速な位相シフトにはこの二つのシスエレメントが機能していることを示す。一方,暗期性の振動を示す三つのクラスターの内,一つのクラスターの遺伝子のプロモータには高い頻度でROREと新規配列が存在していた。これらの結果により(1)新規な暗期性転写リズムを支配する転写制御因子,(2)位相が前進または後退時にそれぞれ特異的に活性化される転写ネットワークの存在が明らかになった。さらにこれらの遺伝子を支配する変異体動物の解析を進めた。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
LARK activates posttranscriptional expression of an essential mammalian clock protein, PERIOD1
DOI： 10.1073/pnas.0607567104
发表时间： 2007-02-06
期刊： PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子： 11.1
作者： [Kojima, Shihoko, Matsumoto, Ken, Tei, Hajime]
通讯作者： Tei, Hajime
Bimodal clock gene expression in mouse suprachiasmatic nucleus and peripheral tissues under a 7-hour light and 5-hour schedule.
在 7 小时光照和 5 小时时间表下，小鼠视交叉上核和外周组织中的双峰时钟基因表达。
DOI： --
发表时间： 2007
期刊： J.Biol.Rhythms. 22
影响因子： --
作者： [Watanabe, T., Naito, E, Nakao.N, Tei, H., Yoshimura, T., Ebihara, S.]
通讯作者： S.
Establishment of cell lines derived from the rat suprachiasmatic nucleus
DOI： 10.1016/j.bbrc.2007.02.009
发表时间： 2007-04-06
期刊： BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
影响因子： 3.1
作者： [Kawaguchi, Soshi, Shinozaki, Atsuki, Tei, Hajime]
通讯作者： Tei, Hajime
Constitutive expression of the Period1 gene impairs behavioral and molecular circadian rhythms
DOI： 10.1073/pnas.0600060103
发表时间： 2006-03-07
期刊： PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子： 11.1
作者： [Numano, R, Yamazaki, S, Tei, H]
通讯作者： Tei, H
Period1誘導化合物の位相前進作用の解明とそれを用いた内的脱同調モデルの構築
  • 批准号：
    23K27213
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $6.07万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    程 肇
  • 依托单位：
    Kanazawa University
Period1誘導化合物の位相前進作用の解明とそれを用いた内的脱同調モデルの構築
  • 批准号：
    23H02522
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $12.15万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    程 肇
  • 依托单位：
    Kanazawa University
ポリA鎖長に概日リズムが見られるmRNAのゲノムワイド検索
  • 批准号：
    22651072
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.11万
  • 财政年份：
    2010
  • 负责人：
    程 肇
  • 依托单位：
    Kanazawa University
視交叉上核由来細胞を用いた概日リズム形成ネットワークの同定とシミュレーション
海外基金