新分野「食のエピジェノミクス」創生の基礎研究

创建新领域“食品表观基因组学”的基础研究

• 批准号: 16658055
• 负责人: 加藤 久典
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16658055/
• 关键词: アミノ酸; エピジェネティクス; ヒストン; クロマチン; 転写因子; DNAメチル化; 食餌タンパク質; ラット; ゲノム; RLGS; 栄養条件

本年度は、食餌成分のうちアミノ酸に注目し、アミノ酸の利用性によるエピジェネティクスレベルでの変化を検出できるか否かを解析した。特にアミノ酸に欠乏に鋭敏に応答する遺伝子であるIGFBP-1遺伝子に着目し、これらの遺伝子部位におけるヒストンのアセチル化およびメチル化の変動を免疫クロマチン沈降法(ChIP法)で検出した。HepG2細胞をロイシン欠乏培地(-Leu)で12時間処理し、同遺伝子を含む領域約30kbpについて3kbpの解像度で測定した。ヒストンH3のアセチル化は転写開始点付近(+73および-3357)においてロイシン欠乏で有意に増加した。H4については転写領域から上流20kbにかけて幅広い領域で有意な増加が認められた。H3のメチル化に関しても、転写促進性のLys4のメチル化では転写開始点付近で増加し、逆に抑制性のLys9のメチル化は10数kb以上上流の領域で減少しており、ロイシン欠乏による同遺伝子の転写制御と良く対応していた。同じ条件において各種転写因子の結合状態をChIP法で調べたところ、数kb上流付近へのATF-3、ATF-4およびC/EBPβの結合が-Leuで有意に増加しており、これは他のアミノ酸応答遺伝子であるアスパラギンシンターゼ(AS)遺伝子でも明確に観察された。これらの転写因子の機能をより明確にするため、各転写因子をノックダウンした場合にIGFBP-1およびAS遺伝子のアミノ酸に対する応答がどのようになるかを検討した。ATF-3およびATF-4のノックダウンの場合にこれら遺伝子の発現上昇が抑制されたので、これらの転写因子の重要性が確認された。

This year, the composition of the bait was analyzed in terms of its availability and availability. In particular, IGFBP-1 gene expression was detected by the method of immuno sedimentation (ChIP), which was used to detect the presence of acid deficiency, acute sensitivity, and protein. HepG2 cells were cultured for 12 hours, and the same gene was detected at a resolution of about 30kbp. The number of entries in the list of entries was increased intentionally when the entry point was close to (+73-3357). H4 has a wide range of fields from the upper 20kb to the lower 20kb. It has been intentionally added and recognized. H3 is related to Lys 4, which is promoted by H3, and Lys 9, which is inhibited by H3. Lys4 is related to H3, and Lys9 is related to H3. Lys 9 is related to H3, and Lys 9 is related to H3. Lys 9 is related to H3, and Lys 9 is related to H3. Lys 9 is related to H3, and Lys 9 is related to H3. Lys In the same condition, the combination state of various writing factors is determined by ChIP method. The combination state of ATF-3, ATF-4 and C/EBPβ is intentionally increased by ChIP method. The combination state of ChIP method is determined by ChIP method. The function of these writing factors is clearly defined, and each writing factor is discussed in the case of IGFBP-1 and AS. ATF-3 and ATF-4 are recognized for their importance in suppressing the rise in the occurrence of these genes.