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クロマチンインスレーターによる遺伝子クラスター制御と病態解析

染色质绝缘子的基因簇调控和病理分析

基本信息

批准号：
19659081
负责人：
中尾光善
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19659081/
关键词：
ゲノム遺伝子発現抑制クロマチン発生・分化細胞病態

项目摘要

ゲノム上の個々の遺伝子が独立に発現制御されるためには、ゲノム境界としてのクロマチンインスレーターが不可欠である。本研究では、クロマチンインスレーターによる遺伝子クラスター制御機構と細胞病態への関連性を解析した。'1.CTCFインスレーター複合体の生化学的解析インスレーター結合タンパク質CTCFとその複合体を明らかにするために、酵母2ハイブリッド法で構成因子の同定を継続的に行った。得られたCTCF結合候補分子について、CTCFとの相互作用、クロマチン免疫沈降法、RNAiによるノックダウンを用いて、エンハンサー遮断効果等の解析を行った。'2.ヒトゲノム上のCTCFインスレーターの位置解析CTCF等のChip-on-chip解析を効率化するために、菌体成分を用いた多量化可能なクロマチン免疫沈降手法を改良した。これを用いて、全ゲノムのChip-on-chip解析を契機として、CTCFが染色体結合に働くcohesinと協働して、インスレーター機能を果たすことを報告した。'3.細胞病態におけるCTCFインスレーターの解析細胞病態に関わる遺伝子クラスターにおけるCTCFインスレーター解析、Chip-on-chip解析を検討した。DNAメチル化や他のクロマチン因子がCTCFのDNA結合性に影響する観点から、メチル化DNA結合タンパク質やクロマチンタンパク質等との関連性を検討した。

In the first place, we have to create a new environment for the future. The purpose of this study is to analyze the relationship between cell disease and control mechanism. 1. Biochemistry analysis of CTCF complex. 2. Biochemistry analysis of CTCF complex. The analysis of CTCF binding candidate molecules, CTCF interaction, CRI immunosedimentation, RNAi binding candidate molecules, CRI binding candidate molecules, CRI binding candidate 2. CTCF on the top of the cell is used to analyze the position of CTCF and other Chip-on-chip analysis. All Chip-on-chip analysis opportunities are reported in this paper. 3. Cell Pathology Analysis CTCF Information Analysis Chip-on-chip Analysis To investigate the relationship between DNA binding and other factors affecting CTCF DNA binding.