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クロマチンインスレーターによる遺伝子クラスター制御と病態解析

クロマチンインスレーターによる遺伝子クラスター制御と病態解析
染色质绝缘子的基因簇调控和病理分析
批准号：
19659081
负责人：
中尾 光善
金额：
$2.05万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2007
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2007 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19659081/
关键词：
ゲノム遺伝子発現抑制クロマチン発生・分化細胞病態

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ゲノム上の個々の遺伝子が独立に発現制御されるためには、ゲノム境界としてのクロマチンインスレーターが不可欠である。本研究では、クロマチンインスレーターによる遺伝子クラスター制御機構と細胞病態への関連性を解析した。'1.CTCFインスレーター複合体の生化学的解析インスレーター結合タンパク質CTCFとその複合体を明らかにするために、酵母2ハイブリッド法で構成因子の同定を継続的に行った。得られたCTCF結合候補分子について、CTCFとの相互作用、クロマチン免疫沈降法、RNAiによるノックダウンを用いて、エンハンサー遮断効果等の解析を行った。'2.ヒトゲノム上のCTCFインスレーターの位置解析CTCF等のChip-on-chip解析を効率化するために、菌体成分を用いた多量化可能なクロマチン免疫沈降手法を改良した。これを用いて、全ゲノムのChip-on-chip解析を契機として、CTCFが染色体結合に働くcohesinと協働して、インスレーター機能を果たすことを報告した。'3.細胞病態におけるCTCFインスレーターの解析細胞病態に関わる遺伝子クラスターにおけるCTCFインスレーター解析、Chip-on-chip解析を検討した。DNAメチル化や他のクロマチン因子がCTCFのDNA結合性に影響する観点から、メチル化DNA結合タンパク質やクロマチンタンパク質等との関連性を検討した。
期刊论文(9)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
細胞核ドメインと遺伝子発現の調節
核结构域和基因表达调控
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [Tokino T, Sasaki Y., 中尾光善, 斉藤典子ほか]
通讯作者： 斉藤典子ほか
細胞異型の成立を探る:がんのエピジェネティクスと核内構造.
探索细胞异型性的形成：癌症表观遗传学和核结构。
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [Tokino T, Sasaki Y., 中尾光善]
通讯作者： 中尾光善
Cohesin mediates transcriptional insulation by CCCTC-binding factor
DOI： 10.1038/nature06634
发表时间： 2008-02-14
期刊： NATURE
影响因子： 64.8
作者： [Wendt, Kerstin S., Yoshida, Keisuke, Peters, Jan-Michael]
通讯作者： Peters, Jan-Michael
Dynamic changes in the epigenomic state and nuclear organization of differentiating mouse embryonic stem cells
DOI： 10.1111/j.1365-2443.2007.01063.x
发表时间： 2007-04-01
期刊： GENES TO CELLS
影响因子： 2.1
作者： [Kobayakawa, Satoru, Miike, Koichiro, Abe, Kuniya]
通讯作者： Abe, Kuniya
共 8 条
    細胞老化の分泌表現型SASPの作動原理の解明と制御法への応用
    • 批准号：
      24K02240
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.9万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      中尾 光善
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    Molecular mechanism of bidirectional signalings between nuclear epigenome and mitochondria and their biological significance
    • 批准号：
      21H02686
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.15万
    • 财政年份：
      2021
    • 负责人：
      中尾 光善
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    Analysis of epigenome and metabolic phenotypes in Thai liver fluke-associated cholangiocarcinoma
    • 批准号：
      20KK0185
    • 项目类别：
      Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
    • 资助金额：
      $11.9万
    • 财政年份：
      2020
    • 负责人：
      中尾 光善
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    クロマチンインスレーターによるエピジェネティック制御と病態解明
    • 批准号：
      18659088
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.05万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      中尾 光善
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    海外基金