CTCFクロマチンインスレーター複合体の同定および病態解析

CTCF染色质绝缘体复合物的鉴定及病理分析

• 批准号: 17659095
• 负责人: 中尾 光善
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Kumamoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17659095/
• 关键词: ゲノム; 遺伝子; 発現制御; 発生・分化; 癌; クロマチン

[1]CTCF複合体の構成因子の同定CTCFの各種ドメインを用いた酵母2ハイブリッド法で、cDNAライブラリーをスクリーニングした。CTCF結合性のクロマチンリモデリング因子が同定されて、得られたクローンのシークエンス、全長cDNAのクローニングを施行した。[2]CTCFとその結合分子の相互作用の解析同定した結合分子の発現ベクターおよび特異的な抗体を作製した。大腸菌で作製したリコンビナントタンパク質を用いたin vitroの結合実験で、直接的な結合性を示した。[3]CTCFとその結合分子の過剰発現およびRNAiによるノックダウンCTCFおよび結合分子の発現ベクターおよび特異的にノックダウンできるsiRNA(またはshRNA発現ベクター)をヒト培養細胞に適用した。[4]CTCF複合体の機能、遣伝子発現・クロマチンとの関連性の解析CTCFおよび結合分子の発現系およびノックダウン系を用いて、内因性の遺伝子群の発現解析およびクロマチン解析を行った。H19遺伝子プロモーターとエンハンサー、CTCF結合配列を組み込んだルシフェラーゼ発現ベクターを作製した。[5]細胞・組織におけるCTCFとその結合分子の発現解析各種の培養細胞株において、CTCFおよびその結合因子の発現状況をノーザンブロット、ウエスタンブロット、免疫細胞染色で解析した。両者が共発現、共局在することが明らかになった。

[1] The same components of the CTCF complex are used to identify various elements of CTCF using the yeast 2-step method, and cDNA fragments can be obtained. CTCF binding gene expression is determined by the expression of the gene, and by the expression of the full-length cDNA. [2] Analysis of CTCF binding molecule interactions and identification of binding molecules and specific antibody production. E. coli can be used in vitro and direct binding. [3]CTCF and CTCF binding molecule development and RNAi development and specific siRNA(or shRNA development) are suitable for cell culture. [4] Function of CTCF complex, analysis of the relationship between the development of CTCF complex and the development of CTCF complex, analysis of the development of CTCF complex and the development of CTCF complex, analysis of CTCF complex and the development of CTCF complex. H19-CCTCF is a combination of CCTCF and CCTCF. [5]Analysis of binding factors in cell and tissue culture. Analysis of binding factors in cell and tissue culture. The two of them are together, and the two of them are together in the future.

项目成果

Activation of Sp1-mediated transcription by Rta of Epstein-Barr virus via an interaction with MCAF1.

• DOI: 10.1093/nar/gki956
• 发表时间: 2005
• 期刊: Nucleic acids research
• 影响因子: 14.9
• 作者: Chang LK;Chung JY;Hong YR;Ichimura T;Nakao M;Liu ST
• 通讯作者: Liu ST

Epigenetic silencing of the imprinted gene ZAC by DNA methylation is an early event in the progression of human ovarian cancer

• DOI: 10.1002/ijc.20971
• 发表时间: 2005-07-10
• 期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
• 影响因子: 6.4
• 作者: Kamikihara, T;Arima, T;Wake, N
• 通讯作者: Wake, N

Haloganated thymidine analogs restore the expression of silenced genes without demethylation.

卤化胸苷类似物可恢复沉默基因的表达而不发生去甲基化。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Cancer Res. 65
• 作者: P. Baroch;et. al.;J.Fan
• 通讯作者: J.Fan

In situ SUMOylation analysis reveals a modulatory role of RanBP2 in the nuclear rim and PML bodies

• DOI: 10.1016/j.yexcr.2006.01.013
• 发表时间: 2006-05-01
• 期刊: EXPERIMENTAL CELL RESEARCH
• 影响因子: 3.7
• 作者: Saitoh, N;Uchimura, Y;Nakao, M
• 通讯作者: Nakao, M

細胞核の分子生物学(分担:132-154ページ)

细胞核的分子生物学（分区：第 132-154 页）

• 发表时间: 2005
• 作者: Zhang L;Benson DW;Tristani-Firouzi M;Ptacek LJ;Tawil R;Schwartz PJ;George AL;Horie M;Andelfinger G;Snow GL;Fu YH;Ackerman MJ;Vincent GM.;斉藤典子ら。
• 通讯作者: 斉藤典子ら。