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アミノアシルtRNA合成酵素の構造解析を通して見る翻訳系の進化

アミノアシルtRNA合成酵素の構造解析を通して見る翻訳系の進化
通过氨酰-tRNA 合成酶的结构分析翻译系统的进化
批准号:
04272220
负责人:
芝 清隆
金额:
$1.28万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1992
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1992 至 --

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项目成果

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今年度の研究では、既報の原核生物、下等真核生物由来のイソロイシルtRNA合成酵素(以下、lle-RSと略す)の一次構造比較をもとに、Cross-SpeciesPCR法を用いヒトのlle-RS遺伝子を分離し、次にその構造解析からlee-RSの進化に関して考察をおこなった。まず、複数の生物から単離されている、lee-RSの一次構造上に保存された領域を同定し、ここに相当するdegeneratePCRプライマーをデザインした。このプライマーを用い、ヒト培養細胞のmRNAから出発し、RT-PCR法により相当する遺伝子断片を増幅した。この方法により2種の異なる遺伝子断片が増幅されており、ヒト細胞が2つ以上のlle-RSを持つことを示す。次に、これらPCR産物をプローブとして、ヒトT細胞cDNAライブラリーをスクリーニングし、2種のlle-RSを相当するcDNAの分離し、その塩基配列を決定した。決定した2つの遺伝子(TypeAとTypeBと呼ぶことにする)の特徴をまとめると、1.TypeAは大腸菌の遺伝子との相同性が高く、TypeBは酵母細胞質型酵素遺伝子との相同性が高い。2.TypeBは、C末に既報のlle-RS遺伝子には無いドメインを持っている。このTypeBが持つC末端のドメインは、動物細胞に特有の、細胞質でのARS同志の高分子量複合体形成に役割をもっている可能性が考えられる。3.酵素のC末端領域は、グラム陰性菌とTypeAを含むグループ、および、酵母、ヒトラヒメナ、メタン菌とTypeBを含むグループとの間では、明かに異なる構造保存性を示す。前者にはZnフィンガー様構造が存在するのが特徴である。これらの事実は、TypeAは、ヒトのミトコンドリア型イソロイシン酵素を、TypeBは、細胞質型酵素を表わしている可能性を示唆している。2つの酵素がそれぞれ保存している特徴と機能との関連の追究が今後の興味の対象となる。また、クローン化されたミトコンドリア型遺伝子を利用し、ミトコンドリアがもつtRNA分子に対する認識機構の問題にも、研究を広げて行きたい。
期刊论文(10)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
アリサ・シェパード: "RNA binding determinant in some class I tRNA synthetases identified by alignment-guided mutagenesis." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 89. 9964-9968 (1992)
Alisa Shepherd:“通过比对引导诱变鉴定出一些 I 类 tRNA 合成酶中的 RNA 结合决定簇。”Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89. 9964-9968 (1992)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
芝 清隆: "Tripartite functional assenbly of a large class I aminoacyl tRNA synthetase." Journal of Biological Chemistry. 267. 22703-22706 (1992)
Kiyotaka Shiba:“大型 I 类氨酰 tRNA 合成酶的三重功能组装。”《生物化学杂志》267。22703-22706(1992)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
ポール・シンメル: "Intron location and funcional deletions in relation to the design and evolution of a subgroup of class I tRNA synthetase." Ptotein Science. 1. 1387-1391 (1992)
Paul Schimmel:“与 I 类 tRNA 合成酶亚组的设计和进化相关的内含子位置和功能缺失。”Ptotein Science 1. 1387-1391 (1992)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
芝 清隆: "Functional assembly of a randomly Dleaved protein." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 89. 1880-1884 (1992)
Kiyotaka Shiba:“随机分离蛋白质的功能组装。”Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89。1880-1884(1992)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Differentiation of EVs using artificial proteins and immune assay
  • 批准号:
    23K05774
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $3.08万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    芝 清隆
  • 依托单位:
人工タンパク質を用いた低エネルギー型ナノ無機材料形成システムの確立
  • 批准号:
    21651058
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.11万
  • 财政年份:
    2009
  • 负责人:
    芝 清隆
  • 依托单位:
人工タンパク質の技術開発
  • 批准号:
    17012026
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $30.66万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    芝 清隆
  • 依托单位:
シンセティックアプローチによる生物システム形成原理の探求
  • 批准号:
    16011262
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.11万
  • 财政年份:
    2004
  • 负责人:
    芝 清隆
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
热带病原菌钩端螺旋体的tRNA修饰定位与生理生化功能分析
  • 批准号:
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2026
  • 负责人:
    林桓
  • 依托单位:
POLR3G通过重塑tRNA图谱上调增殖因子LMNB1的蛋白表达促进前列腺癌进展的机制研究
  • 批准号:
    2026JJ50071
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2026
  • 负责人:
    邹成
  • 依托单位:
天冬氨酸/天冬氨酰tRNA合成酶-1轴通过调控钙稳态促进结直肠癌进展的作用与机制研究
  • 批准号:
    2026JJ30151
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2026
  • 负责人:
    刘先领
  • 依托单位:
利用阻抑tRNA系统靶向RPGR基因治疗视网膜色素变性的作用及机制研究