课题基金 / 基金详情

極限微生物に由来する多糖分解酵素の構造-活性相関と糖鎖認識機構

極限微生物に由来する多糖分解酵素の構造-活性相関と糖鎖認識機構
极端微生物多糖降解酶的构效关系及碳水化合物识别机制
批准号：
09240209
负责人：
中村 聡
金额：
$1.15万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1997
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1997 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09240209/
关键词：
キシラナーゼタンパク質工学糖鎖認識触媒ドメインキシラン結合ドメイン

项目摘要

项目成果

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好アルカリ性バシラス属細菌41M-1株が生産するキシラナーゼは、反応の至適をアルカリ性領域に有する.本酵素の触媒ドメインはN末端側に位置しており,そのC末端側には機能未知領域が連結している.本重点領域研究では,本酵素のアルカリ性条件における基質認識ならびに触媒反応機構を分子レベルで解明することを目的とする.平成9年度は,本酵素のC末端領域の機能解明と,基質認識ならびに触媒活性に関与するアミノ酸残基の特性を試みた.41M-1株キシラナーゼのC末端機能未知領域を欠失した変異型酵素△JCも活性を保持しており,本酵素のC末端領域は活性発現に必須ではないことがわかった.次に,C末端領域をグルタチオンSートランスフェラーゼに融合したキメラタンパク質GST-JC1を調製した.GST-JC1は不溶性キシランへの結合能を有しており,本酵素のC末端領域はキシラン結合ドメインであると考えられた.不溶性キシランの加水分解反応において,野生型酵素は△JCよりも数倍高い活性を示した.これより,本酵素のキシラン結合ドメインは,不溶性キシランに特異的に結合し,連結している触媒ドメインによる加水分解反応を促進する機能があると考えられた.41M-1株キシラナーゼの触媒活性に関与するアミノ酸残基を特定する目的で,その触媒ドメインにアミノ酸置換を施した変異型酵素を種々調製し,野生型酵素との活性比較を行った.その結果,E93,E183,W18,W86,Y84およびY95にアミノ酸置換を施した変異型酵素において,キシラナーゼ活性の大幅な低下が認められ,これらのアミノ酸残基の活性への関与が示唆された.E93およびE183が触媒残基として,そしてW18,W86,Y84およびY95は基質キシランとの結合に関与しているものと推察した.
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
H.Wakai他: "Cloning and sequencing of the gene encoding the cell surface glycoprotein of Haloarcula japonica strain TR-1" Extremophiles. 1. 29-35 (1997)
H. Wakai 等：“编码 Haloarcula japonica 菌株 TR-1 细胞表面糖蛋白的基因的克隆和测序”极端微生物。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
D.Sugimori 他: "Purification and Characterization of a ferredoxin from Haloarcula japonica strain TR-1,and cloning of its gene" J.Inorg Chem.67. 250 (1997)
D. Sugimori 等人：“来自 Haloarcula japonica 菌株 TR-1 的铁氧还蛋白的纯化和表征，及其基因的克隆”J. Inorg Chem.67 (1997)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
D.Sugimori 他: "Purification and Characterization of a ferredoxin from Haloarcula japonica strain TR-1" World J.Microbiol.Biotechnol.印刷中
D. Sugimori 等人：“来自 Haloarcula japonica 菌株 TR-1 的铁氧还蛋白的纯化和表征”，世界微生物技术杂志，出版中。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
中村 聡: "好アルカリ性細菌が生産する新規キシラナーゼの分子解剖" 応用糖質科学. (印刷中).
Satoshi Nakamura：“嗜碱性细菌产生的新型木聚糖酶的分子解剖”，《应用糖科学》（出版中）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
ポリマーブラシによるコロイドナノ粒子の形状選択的分離法の開発
  • 批准号：
    24K17574
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 资助金额：
    $2.16万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    中村 聡
  • 依托单位：
    Hokkaido University
離散化された幾何学的フローの研究
  • 批准号：
    24K16917
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 资助金额：
    $3.08万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    中村 聡
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
膵・胆道癌の早期診断を目指したバイオマーカーの検索と臨床応用
  • 批准号：
    22K20826
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
  • 资助金额：
    $1.83万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    中村 聡
  • 依托单位：
    Kyushu University
標準的ケーラー計量の場の量子化を用いたファノ多様体の幾何構造の研究
海外基金