权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

生体分子統合データベース・解析システムの構築

综合生物分子数据库及分析系统的构建

基本信息

批准号：
16014219
负责人：
皿井明倫
金额：
$ 3.26万
依托单位：
Kyushu Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

分子のレベルでのさまざまな情報を集約した統合データベース、および、そこから知識を抽出するための技術を開発した。今年度は以下のような成果を得た。1.病気と関連するアミノ酸変異情報などを文献やデータベースから収集し、配列・構造情報と統合した。また、変異と蛋白質の構造、安定性、酵素活性や相互作用との関係を解析した。2.蛋白質の熱力学データの収集を行い、熱力学データベース、ProTherm、に登録した。またデータベースの検索機能などの強化を行った。さらに、蛋白質の熱力学データと構造データとの統合をすすめた。3.蛋白質と核酸の相互作用の定量的実験データを収集し、データベース、ProNIT、に登録した。また、このデータを用いて相互作用の熱力学と構造との関係を解析した。4.文献からのデータの収集を効率化するため、人工知能、自然言語処理、オントロジーなど研究を行った。5.データから知識を抽出するための次のような開発を行った。(1)疾病と関連するアミノ酸変異などが蛋白質の安定性や蛋白質・DNA相互作用に与える影響を予測するため、これらの相関関係を解析した。(2)蛋白質・DNA複合体構造や相互作用情報を利用して転写因子やそのターゲット遺伝子をゲノムスケールで予測する方法の開発を行った。(3)蛋白質・リガンド相互作用データを統計的に解析し、構造記述子から結合活性を予測する方法の開発をすすめた。6.これまでに開発されたデータベースと解析ツールを組み合わせた統合解析システムを構築するための準備をすすめた。これまでに開発が終わったツールについてはインターネットで公開した。

The development of technologies for the integration of molecular information and knowledge This year, the following achievements have been made. 1. The disease is related to different kinds of information, such as collection, arrangement and integration. Analysis of the relationship between protein structure, stability, enzyme activity and interaction 2. Thermodynamics of proteins, Thermodynamics of proteins The search function is enhanced. The thermodynamic structure of protein 3. Quantitative analysis of protein-nucleic acid interactions Analysis of Thermodynamic and Structural Interactions 4. Literature from the collection of information technology, artificial intelligence, natural speech processing, information technology research 5. Knowledge extraction and development (1)Analysis of the correlation between protein stability and protein-DNA interaction (2)Development of a method for predicting protein-DNA complex structure and interaction using the information of the protein and DNA complex (3)Development of methods for statistical analysis, characterization and prediction of protein binding activity 6. Open the door and open the door. This is the end of the story. It's the end of the story.