染色体末端テロメアの構造生物学

染色体末端端粒的结构生物学

• 批准号: 17012020
• 负责人: 西村 善文
• 金额: $ 5.44万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17012020/
• 关键词: DNA; TRF2; ゲノム; タンパク質; 転写; テロメア; 老化; がん化

染色体末端のテロメアの構造は細胞老化やがん化に密接に関連する。テロメアDNAに結合するタンパク質としてTRF1とTRF2の2種類が知られている。今回我々はTRF2とテロメア二重鎖DNAとの複合体構造をNMR法で決定しTRF2によるテロメアDNAの認識機構を解明した。既に当研究室で決定していたTRF1とテロメア二重鎖DNA複合体構造と比較することによりテロメアDNAへの結合能が強くなったTRF2変異体を作成することが出来た。さらにTRF2はテロメアDNAの1本鎖3'突出末端が作るグアニン4重らせん構造と相互作用することを見出した。特に平行4重らせん構造と強く相互作用することからテロメア保護におけるTRF2の役割の一端を解明した。その他にも基本転写因子のTFIIEに関しては既に当研究室で決定していたβサブユニットのコアドメインの構造に引き続きαサブユニットのコアドメインであるZn結合ドメインの構造をNMR法で決定し、また基本転写因子のTFIIEの質量をMSで正確に測定した結果TFIIEはこれまで言われてきたようなααββのヘテロテトラマーではなくαβのヘテロダイマーであることを解明した。さらにがん抑制因子でもある神経特異的な転写抑制因子NRSF/RESTはサイレンサーに結合し非常に数多くの神経特異的な遺伝子の発現を抑制するタンパク質であるが、NRSF/RESTの転写抑制機構を解明するため転写コリプレッサーSin3との複合体の構造を解析した。NRSF/RESTのN末約80アミノ酸領域が相互作用領域だと知られていたが、その領域は単独では天然変成状態であり、その中の約10数アミノ酸からなる疎水性領域がSin3と相互作用してヘリックスを形成し遺伝子近傍にSin3をリクルートする。

The structure of chromosome termini is closely related to cell aging and transformation. The two types of TRF1 and TRF2 are known to bind to DNA. The structure of TRF 2 and TRF 2 DNA complexes was determined by NMR. When the laboratory determines that TRF1 and TRF2 are double locked DNA complexes, the binding energy of TRF 1 and TRF2 is increased. TRF2 is a 3'-terminal fragment of DNA. Special parallel four-fold structure and strong interaction between the two sides of the TRF2 The TFIIE of other basic writing factors was determined by NMR in the laboratory. The quality of TFIIE is determined correctly. NRSF/REST is a neuro-specific transcription inhibitor that binds to a very large number of neuro-specific transcription inhibitors. NRSF/REST is a transcription inhibitor that inhibits the production of neuro-specific transcription inhibitors. NRSF/REST is a transcription inhibitor that explains the structure of the complex. NRSF/REST has about 80 active acid domains and about 10 active acid domains, which interact with each other in the form of Sin3.

项目成果

Comparison between TRF2 and TRF1 on their telomeric DNA-bound structures and DNA-binding activities.

TRF2和TRF1端粒DNA结合结构和DNA结合活性的比较。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Protein Sci. 14
• 作者: Hanaoka;S.;Nagadoi;A.;Nishimura;Y.
• 通讯作者: Y.

Investigation of molecular size of transcription factor TFIIE in solution

• DOI: 10.1002/prot.20647
• 发表时间: 2005-11-15
• 期刊: PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
• 影响因子: 2.9
• 作者: Itoh, Y;Unzai, S;Akashi, S
• 通讯作者: Akashi, S

ラマンおよびCDによる高次構造解析-生物薬科学実験講座、核酸II核酸の分離と構造

拉曼和CD的高阶结构分析 - 生物制药科学实验课程，核酸II 核酸的分离和结构

• 发表时间: 2005
• 作者: Muramatsu;Y. Tahara;H. Ono;T. Tsuruo;T. Seimiya;H.;西村善文
• 通讯作者: 西村善文

The neural repressor NRSF/REST binds the PAH1 domain of the Sin3 corepressor by using its distinct short hydrophobic helix

• DOI: 10.1016/j.jmb.2005.10.008
• 发表时间: 2005-12-09
• 期刊: JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
• 影响因子: 5.6
• 作者: Nomura, M;Uda-Tochio, H;Nishimura, Y
• 通讯作者: Nishimura, Y

Structural Insights into the Asymmetric Effects of Zinc-Ligand Cysteine Mutations in the Novel Zinc Ribbon Domain of Human TFIIEα for Transcription.

人类 TFIIEα 新型锌带结构域中锌配体半胱氨酸突变对转录的不对称影响的结构见解。

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Biochem. 138
• 作者: Okuda;M.;Tanaka;A.;Hanaoka;F.;Ohkuma;Y.;Nishimura;Y.
• 通讯作者: Y.