课题基金 / 基金详情

染色体末端テロメアの構造生物学

染色体末端テロメアの構造生物学
染色体末端端粒的结构生物学
批准号：
17012020
负责人：
西村 善文
金额：
$5.44万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2005 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17012020/
关键词：
DNATRF2ゲノムタンパク質転写テロメア老化がん化

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
染色体末端のテロメアの構造は細胞老化やがん化に密接に関連する。テロメアDNAに結合するタンパク質としてTRF1とTRF2の2種類が知られている。今回我々はTRF2とテロメア二重鎖DNAとの複合体構造をNMR法で決定しTRF2によるテロメアDNAの認識機構を解明した。既に当研究室で決定していたTRF1とテロメア二重鎖DNA複合体構造と比較することによりテロメアDNAへの結合能が強くなったTRF2変異体を作成することが出来た。さらにTRF2はテロメアDNAの1本鎖3'突出末端が作るグアニン4重らせん構造と相互作用することを見出した。特に平行4重らせん構造と強く相互作用することからテロメア保護におけるTRF2の役割の一端を解明した。その他にも基本転写因子のTFIIEに関しては既に当研究室で決定していたβサブユニットのコアドメインの構造に引き続きαサブユニットのコアドメインであるZn結合ドメインの構造をNMR法で決定し、また基本転写因子のTFIIEの質量をMSで正確に測定した結果TFIIEはこれまで言われてきたようなααββのヘテロテトラマーではなくαβのヘテロダイマーであることを解明した。さらにがん抑制因子でもある神経特異的な転写抑制因子NRSF/RESTはサイレンサーに結合し非常に数多くの神経特異的な遺伝子の発現を抑制するタンパク質であるが、NRSF/RESTの転写抑制機構を解明するため転写コリプレッサーSin3との複合体の構造を解析した。NRSF/RESTのN末約80アミノ酸領域が相互作用領域だと知られていたが、その領域は単独では天然変成状態であり、その中の約10数アミノ酸からなる疎水性領域がSin3と相互作用してヘリックスを形成し遺伝子近傍にSin3をリクルートする。
英文摘要
染色体末端のテロメアの構造は細胞老化やがん化に密接に関連する。テロメアDNAに結合するタンパク質としてTRF1とTRF2の2種類が知られている。今回我々はTRF2とテロメア二重鎖DNAとの複合体構造をNMR法で決定しTRF2によるテロメアDNAの認識機構を解明した。既に当研究室で決定していたTRF1とテロメア二重鎖DNA複合体構造と比較することによりテロメアDNAへの結合能が強くなったTRF2変異体を作成することが出来た。さらにTRF2はテロメアDNAの1本鎖3'突出末端が作るグアニン4重らせん構造と相互作用することを見出した。特に平行4重らせん構造と強く相互作用することからテロメア保護におけるTRF2の役割の一端を解明した。その他にも基本転写因子のTFIIEに関しては既に当研究室で決定していたβサブユニットのコアドメインの構造に引き続きαサブユニットのコアドメインであるZn結合ドメインの構造をNMR法で決定し、また基本転写因子のTFIIEの質量をMSで正確に測定した結果TFIIEはこれまで言われてきたようなααββのヘテロテトラマーではなくαβのヘテロダイマーであることを解明した。さらにがん抑制因子でもある神経特異的な転写抑制因子NRSF/RESTはサイレンサーに結合し非常に数多くの神経特異的な遺伝子の発現を抑制するタンパク質であるが、NRSF/RESTの転写抑制機構を解明するため転写コリプレッサーSin3との複合体の構造を解析した。NRSF/RESTのN末約80アミノ酸領域が相互作用領域だと知られていたが、その領域は単独では天然変成状態であり、その中の約10数アミノ酸からなる疎水性領域がSin3と相互作用してヘリックスを形成し遺伝子近傍にSin3をリクルートする。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Comparison between TRF2 and TRF1 on their telomeric DNA-bound structures and DNA-binding activities.
TRF2和TRF1端粒DNA结合结构和DNA结合活性的比较。
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： Protein Sci. 14
影响因子： --
作者： [Hanaoka, S., Nagadoi, A., Nishimura, Y.]
通讯作者： Y.
Investigation of molecular size of transcription factor TFIIE in solution
DOI： 10.1002/prot.20647
发表时间： 2005-11-15
期刊： PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
影响因子： 2.9
作者： [Itoh, Y, Unzai, S, Akashi, S]
通讯作者： Akashi, S
ラマンおよびCDによる高次構造解析-生物薬科学実験講座、核酸II核酸の分離と構造
拉曼和CD的高阶结构分析 - 生物制药科学实验课程，核酸II 核酸的分离和结构
DOI： --
发表时间： 2005
期刊：
影响因子： --
作者： [Muramatsu, Y. Tahara, H. Ono, T. Tsuruo, T. Seimiya, H., 西村善文]
通讯作者： 西村善文
The neural repressor NRSF/REST binds the PAH1 domain of the Sin3 corepressor by using its distinct short hydrophobic helix
DOI： 10.1016/j.jmb.2005.10.008
发表时间： 2005-12-09
期刊： JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
影响因子： 5.6
作者： [Nomura, M, Uda-Tochio, H, Nishimura, Y]
通讯作者： Nishimura, Y
共 6 条
    クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
    • 批准号：
      23K27119
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $8.74万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
    • 批准号：
      23H02426
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.9万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造解析
    • 批准号：
      20247018
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $8.9万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    DNA結合タンパク質の塩基配列特異性の網羅的な定量化
    • 批准号：
      15014227
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.12万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    国内基金
    海外基金
    血流限制性运动通过 TRF2/SIRT3/FOXO3a 调节 2 型糖尿病患者内皮祖细胞功能的机制研究
    • 批准号：
      2022JJ50027
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      麻晓君
    • 依托单位：
      邵阳学院
    基于PPI关键残基构象设计的选择性TRF2小分子抑制剂及其抗肝癌活性与机制研究
    • 批准号：
      --
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      52万元
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      刘志国
    • 依托单位：
      温州医科大学
    TRF2 小分子靶向药物发现及其抗肝癌药理活性研究
    • 批准号：
      LZ22H300002
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2021
    • 负责人：
      刘志国
    • 依托单位：
      温州医科大学
    ALKBH5通过STAT3调控端粒重复结合因子TRF2减轻老化心肌缺血后处理损伤的机制研究
    • 批准号：
      82001479
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      24.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      张璇
    • 依托单位：
      天津医科大学