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核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造解析

核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造解析
核转录相关因子的自然变性状态和动态结构分析
批准号：
20247018
负责人：
西村 善文
金额：
$8.9万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20247018/
关键词：
NMR転写因子クロマチン動的構造天然変性状態

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
真核生物の特に核内タンパク質を標的として、クロマチンリモデリング因子、転写活性化因子、転写抑制化因子、基本転写因子を対象に、NMRを用いて、単独の時の動的構造、遭遇複合体の動的構造、中間体の動的構造、特異的複合体の動的構造を解析し、核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造を解析する。特にクロマチンリモデリング因子のEsa1、神経特異的転写抑制因子REST/NRSFの転写抑制ドメインとコリプレッサーmSin3との複合体、基本転写因子TFIIEとTFIIHとの複合体、ストレス応答の転写因子ATF2の転写活性ドメインとDNA結合ドメインとの複合体の静的な構造に加えて動的構造をNMR法で解析することを目的とした。クロモドメインはメチル化ヒストンを認識するドメインであることがHP1のクロモドメインやポリコーンのクロモドメインやヒトCHD1のタンデムに並んだクロモドメインで知られている。ここでは酵母での生育に必須のヒストンアセチル化酵素Esa1のクロモドメインの構造をNMRで解析しベーダバレル構造を持つtudorドメイン構造であることを見出した。このtudorドメイン単独ではヒストンペプチド結合活性やRNA結合活性を全く持たなかった。このtudorドメインのさらにN末とC末に伸ばすと新たなベーダシートが形成されknotted tudorドメインという新規構造であることを見つけた、さらにknotted tudorドメインはヒストンペプチドには結合しなかったがピリミジンに富む配列のRNAに結合する活性をもつことを見出した。このRNA結合に必須なアミノ酸をアラニンに変異したEsa1では酵母の生育が阻害されたことから、Esa1のRNA結合活性は酵母の生育にとって必須であることを見つけた。
英文摘要
真核生物の特に核内タンパク質を標的として、クロマチンリモデリング因子、転写活性化因子、転写抑制化因子、基本転写因子を対象に、NMRを用いて、単独の時の動的構造、遭遇複合体の動的構造、中間体の動的構造、特異的複合体の動的構造を解析し、核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造を解析する。特にクロマチンリモデリング因子のEsa1、神経特異的転写抑制因子REST/NRSFの転写抑制ドメインとコリプレッサーmSin3との複合体、基本転写因子TFIIEとTFIIHとの複合体、ストレス応答の転写因子ATF2の転写活性ドメインとDNA結合ドメインとの複合体の静的な構造に加えて動的構造をNMR法で解析することを目的とした。クロモドメインはメチル化ヒストンを認識するドメインであることがHP1のクロモドメインやポリコーンのクロモドメインやヒトCHD1のタンデムに並んだクロモドメインで知られている。ここでは酵母での生育に必須のヒストンアセチル化酵素Esa1のクロモドメインの構造をNMRで解析しベーダバレル構造を持つtudorドメイン構造であることを見出した。このtudorドメイン単独ではヒストンペプチド結合活性やRNA結合活性を全く持たなかった。このtudorドメインのさらにN末とC末に伸ばすと新たなベーダシートが形成されknotted tudorドメインという新規構造であることを見つけた、さらにknotted tudorドメインはヒストンペプチドには結合しなかったがピリミジンに富む配列のRNAに結合する活性をもつことを見出した。このRNA結合に必須なアミノ酸をアラニンに変異したEsa1では酵母の生育が阻害されたことから、Esa1のRNA結合活性は酵母の生育にとって必須であることを見つけた。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
転写因子や基本転写因子の天然変性状態
转录因子和基本转录因子的自然简并状态
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [西村善文]
通讯作者： 西村善文
Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esalpresumed chromodomain
Esal推测的染色结构域的RNA结合活性所必需的结的新结构和功能模式
DOI： --
发表时间： 2008
期刊： J. Mol. Biol (in press)
影响因子： --
作者： [S. Hideaki, et. al.]
通讯作者： et. al.
ソフトな相互作用からなる、塩濃度に敏感な複合体の溶液構造解析
由软相互作用组成的盐浓度敏感配合物的溶液结构分析
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Nagasaki, K., Kawami, H., Tomaru, Y., 明石知子・西村善文]
通讯作者： 明石知子・西村善文
クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
  • 批准号：
    23K27119
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $8.74万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    西村 善文
  • 依托单位：
    Yokohama City University
クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
  • 批准号：
    23H02426
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.9万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    西村 善文
  • 依托单位：
    Yokohama City University
染色体末端テロメアの構造生物学
  • 批准号：
    17012020
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $5.44万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    西村 善文
  • 依托单位：
    Yokohama City University
DNA結合タンパク質の塩基配列特異性の網羅的な定量化
  • 批准号：
    15014227
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $5.12万
  • 财政年份：
    2003
  • 负责人：
    西村 善文
  • 依托单位：
    Yokohama City University
海外基金