核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造解析

核转录相关因子的自然变性状态和动态结构分析

• 批准号: 20247018
• 负责人: 西村 善文
• 金额: $ 8.9万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20247018/
• 关键词: NMR; 転写因子; クロマチン; 動的構造; 天然変性状態

真核生物の特に核内タンパク質を標的として、クロマチンリモデリング因子、転写活性化因子、転写抑制化因子、基本転写因子を対象に、NMRを用いて、単独の時の動的構造、遭遇複合体の動的構造、中間体の動的構造、特異的複合体の動的構造を解析し、核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造を解析する。特にクロマチンリモデリング因子のEsa1、神経特異的転写抑制因子REST/NRSFの転写抑制ドメインとコリプレッサーmSin3との複合体、基本転写因子TFIIEとTFIIHとの複合体、ストレス応答の転写因子ATF2の転写活性ドメインとDNA結合ドメインとの複合体の静的な構造に加えて動的構造をNMR法で解析することを目的とした。クロモドメインはメチル化ヒストンを認識するドメインであることがHP1のクロモドメインやポリコーンのクロモドメインやヒトCHD1のタンデムに並んだクロモドメインで知られている。ここでは酵母での生育に必須のヒストンアセチル化酵素Esa1のクロモドメインの構造をNMRで解析しベーダバレル構造を持つtudorドメイン構造であることを見出した。このtudorドメイン単独ではヒストンペプチド結合活性やRNA結合活性を全く持たなかった。このtudorドメインのさらにN末とC末に伸ばすと新たなベーダシートが形成されknotted tudorドメインという新規構造であることを見つけた、さらにknotted tudorドメインはヒストンペプチドには結合しなかったがピリミジンに富む配列のRNAに結合する活性をもつことを見出した。このRNA結合に必須なアミノ酸をアラニンに変異したEsa1では酵母の生育が阻害されたことから、Esa1のRNA結合活性は酵母の生育にとって必須であることを見つけた。

In eukaryotes, eukaryotes are responsible for the activation of eukaryotes, the inhibition of writing, the activation of writing, the inhibition of writing, the basic factors of writing, the use of NMR, the creation of idiosyncrasy, the creation of complex virus, the creation of Chinese virus, the creation of complex virus, the analysis of the creation of complex virus, the analysis of the creation of complex virus, and the analysis of the creation of special complex virus. It is necessary to write an analysis of the nature of the behavior of the factor in the nucleus. The Esa1, the write inhibitor REST/NRSF, the write inhibitor, the write inhibitor, the mSin3 complex, the basic write factor, TFIIE, write inhibitor, In response to the writing factor ATF2, the method of NMR analysis was used to analyze the purpose of the experiment, which is based on the combination of the active sequence DNA and the complex complex of the active sequence. I don't know what to do. I don't know. I don't know. In order to reproduce the yeast, it is necessary to analyze the enzyme Esa1, which is responsible for the production of yeast, and to make the NMR gene. To maintain the tudor gene, you need to make the enzyme to generate the enzyme. The combination of the active tudor and the active RNA can be used to maintain the whole concentration of the active drug. At the end of the day, the tudor will be expanded. In the end, there will be new information on the formation of new rules and regulations. This will result in the formation of new rules and regulations. In this way, you will need to know that you will not be able to do so. In this way, you will be able to combine the RNA with the activity of the RNA. You will not be able to change the performance of the system. The combination of RNA and Esa1 must be used to prevent the growth of yeast, and the combination of Esa1, RNA and active yeast must be activated.

项目成果

転写因子や基本転写因子の天然変性状態

转录因子和基本转录因子的自然简并状态

• 发表时间: 2008
• 作者: 西村善文

Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esalpresumed chromodomain

Esal推测的染色结构域的RNA结合活性所必需的结的新结构和功能模式

• 发表时间: 2008
• 期刊: J. Mol. Biol (in press)
• 作者: S. Hideaki;et. al.
• 通讯作者: et. al.

ソフトな相互作用からなる、塩濃度に敏感な複合体の溶液構造解析

由软相互作用组成的盐浓度敏感配合物的溶液结构分析

• 发表时间: 2008
• 作者: Nagasaki;K.;Kawami;H.;Tomaru;Y.;明石知子・西村善文
• 通讯作者: 明石知子・西村善文