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がん発症前高リスクに関わるがん体質遺伝素因の実体解明と試行的コホート解析

阐明与高癌前风险相关的癌症遗传易感性和试验队列分析

基本信息

批准号：
17015030
负责人：
清水憲二
金额：
$ 4.42万
依托单位：
Okayama University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では「がん体質遺伝」の実体に迫るために、がん関連候補遺伝子のミスセンス1塩基多型(ms-SNP)を広汎に検索してきた。これまでに計135遺伝子で205箇所のms-SNP候補を見出し、担がん患者(計344名)及び対照健常人集団におけるアレル分布を解析した。本年度は対照健常人検体数を約2倍に増やして(計202名)再検討した結果、昨年度までの19種と新規に8種のms-SNPが統計学的に有意なリスクを示した。この27種の内訳は、肺、頭頸部、大腸、食道、乳腺などのがんで高リスクSNPが21種(オッズ比;1.62〜14.2)と保護的SNPが6種(オッズ比;0.12〜0.61)を占め、DNAの修復/複製(7)、がん抑制(5)、染色体分配(5)、細胞周期制御(3)及びその他の機能(3)に関与する23遺伝子群であった。また27種のうち20種は複数種のがんに影響し、うち22種は本研究による新発見である。検体毎にms-SNPの重複(累積オッズ比:COR)を検討した結果、肺腺がんのリスクに関わる13種のms-SNP遺伝子型が重複し、CORが30以上を示す人は、健常人では5%で、肺腺がん患者では30%に達した(P=6.7x10^<-8>,OR=8.33)。同じく肺扁平上皮がんのリスク因子11種でCORが20以上の人は、健常人7.9%、肺扁平上皮がん患者59%であった(P=6.9x10^<-1>1,OR=16.6)。同様の傾向は頭頸部、大腸、食道などのがんでも認められ、健常人と患者群の平均CORは3〜15倍の差があった。このように、本研究で明らかになったms-SNP27種は、実際に発がんリスクの遺伝的背景となっていることが強く示唆された。以上の結果を協力病院の通院非がん患者246名について適用したところ、計34名で各種のがん発症リスクが特に高いことが判明したため、主治医による継続的フォローを開始した。

In this study, we investigated the relationship between genetic diversity and candidate genes in a broad range of ms-SNPs. The distribution of ms-SNP candidates was analyzed for 135 genes and 205 patients (344 patients) and for healthy individuals. This year, the number of healthy individuals increased by about 2 times (202). The results of re-examination showed that there were 19 new ms-SNPs and 8 new ms-SNPs in the previous year. Among the 27 SNPs, 21 SNPs (ratio: 1.62 ~ 14.2) were associated with DNA repair/replication, 6 SNPs (ratio: 0.12 ~ 0.61) were associated with inhibition, 5 SNPs were associated with chromosome allocation, 3 SNPs were associated with cell cycle control, and 3 SNPs were associated with other functions. There are 27 kinds of new findings in this study, 20 kinds of new findings, and 22 kinds of new findings in this study. The cumulative ratio of ms-SNP duplication (COR) was 30 or higher in 13 of the 13 ms-SNP genotypes in the lung, 5% in healthy individuals, and 30% in lung patients (P=6.7x10^<-8>,OR=8.33). There were 11 COR factors above 20 in lung squamous epithelium, 7.9% in healthy people and 59% in lung squamous epithelium patients (P= <-1>6.9x10^1,OR=16.6). The average COR of the head and neck, large intestine and esophagus was 3 ~ 15 times higher than that of the healthy group. In this study, 27 SNPs were identified in the background and in practice. As a result, 246 patients from the general hospital of the cooperative hospital were diagnosed with various diseases, and 34 patients were diagnosed with various diseases.