ヒトゲノム解析から発見した注目すべき8個の新規遺伝子の機能解析と医療への応用

人类基因组分析发现的八个值得注意的新基因的功能分析和医学应用

基本信息

批准号：
18018037
负责人：
清水信義
金额：
$ 5.95万
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、永年のヒトゲノム解読から研究代表者らが発見した約300個の新規遺伝子の中から、特に興味深い疾患原因および疾患関連遺伝子8個(DGCR8、SGSM1、ZNF295、CSMD3、FFER1L6、PKHDIL1、DSCR4、VPS13B)を選抜し、比較ゲノム解析/トランスクリプトーム解析/プロテオーム解析/フェノーム解析に渡る総合的なアプローチを駆使して解析を行った。DiGeorge症候群の原因遺伝子の一つとして我々が提唱してきたDGCR8に関しては。タンパクの強制発現と免疫染色の結果から、DGCR8がRNA干渉においてmiRNA形成過程で重要な役割を果たすというモデルを提唱した(Shiohama, A., et. al. Exp Cell Res.(2007))。脳で強い発現を示すSGSMlについては、SGSMファミリーがいずれも脳で強い発現を示すこと、免疫沈降法の結果からRAPサブファミリーの全てとRAPIDモチーフを介して、RABサブファミリーの幾つかとTBCモチーフを介して結合することを明らかにした(Yang, H., et. al. Genomics.(2007))。ZNF295は転写抑制因子であるが、ドーパミントランスポーター遺伝子の転写活性因子ZFP161と結合してその転写を抑制することを見出した。さらに、メダカのオルソログのノックダウン解析を行なったところ、脳全体の縮小と脳室の拡大が観察された。ヒト胎盤にのみ検出されるDSCR4については、欠失変異体を用いたプロモーター活性を測定し、nt-800付近で著しい活性の上昇と抑制を示す塩基配列を見出した(Asai, S., et. al. Biochim Biophys Acta.(2008))。その他3つの遺伝子に関しても進化上重要となる数種のゲノムを用いた比較ゲノム解析、ヒト・メダカを用いた発現解析、ノックダウン解析を行った。

在这项研究中，八个特别有趣的引起疾病和疾病相关的基因（DGCR8，SGSM1，ZNF295，CSMD3，FFER1L6，PKHDIL1，DSCR4和VPS13B）是从大约300个新的基因中从长期以来的人类基因中发现的，分析和分析中的研究中发现的大约300个新基因中选择的，该基因是从远处进行的300个新颖基因，这些基因是从现有人类基因进行分析的，并且是一种分析，是一种分析，是一种分析，是一种分析，是一种分析，是一种分析，是一种分析，是从一个分析和分析中发现的，转录组分析，蛋白质组分析和现象分析。关于DGCR8，我们提出的DGCR8是Digeorge综合征的致病基因之一。蛋白质强迫表达和免疫染色的结果提出了一个模型，其中DGCR8在RNA干扰中在miRNA形成中起重要作用（Shiohama，A。，etal。ExpCell Res。（2007））。关于在大脑中表现出强烈表达的SGSML，所有SGSM家族在大脑中均表现出强烈的表达，免疫沉淀结果表明，它们通过快速基序与所有RAB亚科结合了所有RAB亚家族，并通过TBC基序（Yang，H。，H。等人，等等。（2007）。（2007年）。尽管ZnF295是转录阻遏物，但发现它与多巴胺转运蛋白基因的转录激活因子ZFP161结合并抑制其转录。此外，对MEDAKA直系同源物的敲低分析表明，整个大脑都减少了，并且观察到心室增大。对于仅在人胎盘中检测到的DSCR4，使用缺失突变体测量启动子活性，并发现基本序列显示出在NT-800附近的活性显着增加和抑制（Asai，S。，et。BiochimBiophys Acta。（2008））。还进行了对进化重要的几种基因组进行比较基因组分析，也进行了使用人类Medaka和其他基因的表达分析。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Comparative genomics of medaka and fugu

DOI：
10.1016/j.cbd.2005.10.008
发表时间：
2006-03-01
期刊：
COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY D-GENOMICS & PROTEOMICS
影响因子：
3
作者：
Shimizu, N;Sasaki, T;Shima, A
通讯作者：
Shima, A

miRNA生成に関与するDGCR8タンパクの新たな機能

DGCR8蛋白参与miRNA产生的新功能

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sasaki;T.;et al.;塩濱愛子
通讯作者：
塩濱愛子

RAP およびRAB ファミリーG タンパクと相互作用する新規タンパクSGSMファミリーの性状解析

与 RAP 和 RAB 家族 G 蛋白相互作用的新型蛋白 SGSM 家族的表征

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sasaki;T.;et al.;塩濱愛子;楊浩
通讯作者：
楊浩

The DNA sequence of medaka chromosome LG22

DOI：
10.1016/j.ygeno.2006.09.003
发表时间：
2007-01-01
期刊：
GENOMICS
影响因子：
4.4
作者：
Sasaki, Takashi;Shimizu, Atsushi;Shimizu, Nobuyoshi
通讯作者：
Shimizu, Nobuyoshi

Identification of three novel proteins (SGSMl, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB) - mediated signaling pathway.

鉴定调节小G蛋白（RAP和RAB）介导的信号传导途径的三种新蛋白（SGSM1、2、3）。

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Genomics 90
影响因子：
0
作者：
T.Toyomasu;M.Tsukahara;A.Kaneko;R.Niida;W.Mitsuhashi;T.Dairi;N.Kato;T.Sassa;大利徹;府川美和子;Saadat I;Matsumoto Y;Murata-Kamiya N;Asai S.;Yang H.
通讯作者：
Yang H.