ヒトゲノム解析から発見した注目すべき8個の新規遺伝子の機能解析と医療への応用

人类基因组分析发现的八个值得注意的新基因的功能分析和医学应用

• 批准号: 18018037
• 负责人: 清水 信義
• 金额: $ 5.95万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018037/
• 关键词: ゲノム; 遺伝子; タンパク質; 発生・分化; 医療; ヒトゲノム; 比較ゲノム解析; 遺伝子疾患; ディジョージ症候群; コーエン症侯群; 多発性嚢胞腎; 家族性てんかん

本研究では、永年のヒトゲノム解読から研究代表者らが発見した約300個の新規遺伝子の中から、特に興味深い疾患原因および疾患関連遺伝子8個(DGCR8、SGSM1、ZNF295、CSMD3、FFER1L6、PKHDIL1、DSCR4、VPS13B)を選抜し、比較ゲノム解析/トランスクリプトーム解析/プロテオーム解析/フェノーム解析に渡る総合的なアプローチを駆使して解析を行った。DiGeorge症候群の原因遺伝子の一つとして我々が提唱してきたDGCR8に関しては。タンパクの強制発現と免疫染色の結果から、DGCR8がRNA干渉においてmiRNA形成過程で重要な役割を果たすというモデルを提唱した(Shiohama, A., et. al. Exp Cell Res.(2007))。脳で強い発現を示すSGSMlについては、SGSMファミリーがいずれも脳で強い発現を示すこと、免疫沈降法の結果からRAPサブファミリーの全てとRAPIDモチーフを介して、RABサブファミリーの幾つかとTBCモチーフを介して結合することを明らかにした(Yang, H., et. al. Genomics.(2007))。ZNF295は転写抑制因子であるが、ドーパミントランスポーター遺伝子の転写活性因子ZFP161と結合してその転写を抑制することを見出した。さらに、メダカのオルソログのノックダウン解析を行なったところ、脳全体の縮小と脳室の拡大が観察された。ヒト胎盤にのみ検出されるDSCR4については、欠失変異体を用いたプロモーター活性を測定し、nt-800付近で著しい活性の上昇と抑制を示す塩基配列を見出した(Asai, S., et. al. Biochim Biophys Acta.(2008))。その他3つの遺伝子に関しても進化上重要となる数種のゲノムを用いた比較ゲノム解析、ヒト・メダカを用いた発現解析、ノックダウン解析を行った。

In this study, the representatives of the year-on-year study have reviewed the selection of 8 (DGCR8, SGSM1, ZNF295, CSMD3, FFER1L6, PKHDIL1, DSCR4, VPS13B) candidates in the new regulations. Compare the data parsing

项目成果

Nucleolar localization of DGCR8 and identification of eleven DGCR8-associated proteins

• DOI: 10.1016/j.yexcr.2007.07.020
• 发表时间: 2007-12-10
• 期刊: EXPERIMENTAL CELL RESEARCH
• 影响因子: 3.7
• 作者: Shiohama, Aiko;Sasaki, Takashi;Shimizu, Nobuyoshi
• 通讯作者: Shimizu, Nobuyoshi

miRNA生成に関与するDGCR8タンパクの新たな機能

DGCR8蛋白参与miRNA产生的新功能

• 发表时间: 2007
• 作者: Sasaki;T.;et al.;塩濱 愛子
• 通讯作者: 塩濱 愛子

RAP およびRAB ファミリーG タンパクと相互作用する新規タンパクSGSMファミリーの性状解析

与 RAP 和 RAB 家族 G 蛋白相互作用的新型蛋白 SGSM 家族的表征

• 发表时间: 2007
• 作者: Sasaki;T.;et al.;塩濱 愛子;楊 浩
• 通讯作者: 楊 浩

Evolutionary conservation of a unique amino acid sequence in human DICER protein essential for binding to Argonaute family proteins

• DOI: 10.1016/j.gene.2007.04.001
• 发表时间: 2007-07-15
• 期刊: GENE
• 影响因子: 3.5
• 作者: Sasaki, Takashi;Shimizu, Nobuyoshi
• 通讯作者: Shimizu, Nobuyoshi

Comparative genomics of medaka and fugu

• DOI: 10.1016/j.cbd.2005.10.008
• 发表时间: 2006-03-01
• 期刊: COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY D-GENOMICS & PROTEOMICS
• 影响因子: 3
• 作者: Shimizu, N;Sasaki, T;Shima, A
• 通讯作者: Shima, A