ヒトゲノム解読から発見した注目すべき8個の新規遺伝子の機能解析と医療への応用

人类基因组测序发现的八个重要新基因的功能分析和医学应用

基本信息

批准号：
17019061
负责人：
清水信義
金额：
$ 3.84万
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17019061/
关键词：
ゲノム解析疾患新規遺伝子

项目摘要

1:DGCR8は1つのWWドメインと2つのDSRBドメインを併せ持った極めて稀な構造を持つタンパク質を産生する。マウス胎児を用いた解析で、DiGeorge/CAFS症候群の発症組織に一致する発現を認めた。2:LLN12(RUTBC2)は特に脳で強い発現を示しており機能が注目される。RUTBCの全長クローニング、発現系の構築を行った。3:ZNF295はBTB/POZドメインとZincフィンガードメインを持つ。ドーパミントランスポーター(DAT)遺伝子の転写を促進することが知られているZFP161タンパクと結合して転写を抑制することを発見した。4:C8orfK23(FER1L5)は新規遺伝子であり巨大タンパク質をつくることが判明した。ホモローグ検索の結果、非症候群性難聴DFNB9の原因遺伝子OTOFにもっとも類似していた。5:CSMD3は連鎖解析により良性の家族性てんかんの原因候補遺伝子と考えられる。CSMDファミリーは脳で強く発現しているが、8番染色体の解析の結果CSMD1は多様性が極めて高いことが判明した。6:PKHD1L1は多発性嚢胞腎(ARPKD)の原因遺伝子であるPKHD1のファミリー遺伝子である。モデル生物としてメダカを選択し、RT-PCRにより67エキソンの配列決定を行うことができた。7:DSCR4はヒト組織の中では胎盤にのみ検出されるが、マウス胎盤には検出されないという極めてまれなタンパク質である。転写開始点を含む一連の欠失体を作製し、活性を測定したところnt-800付近の領域で著しい活性の上昇が見られた。8:COH1(VPS13B)はCohen症候群の原因遺伝子として確認された巨大タンパク質である。VSP13Aは舞踏病・有棘赤血球症の原因遺伝子であることから、VSP13ファミリーのすべてが何らかの重要な生理作用を営んでいると考える。

1：DGCR8产生具有极为罕见结构的蛋白质，结合了一个WW结构域和两个DSRB结构域。使用小鼠胎儿的分析表明，表达与Digeorge/CAFS综合征的发作一致。 2：LLN12（RUTBC2）在大脑中特别强烈表达，其功能引起了人们的关注。进行了RUTBC的全长克隆和表达系统的构建。 3：ZNF295具有BTB/POZ域和一个锌指域。已经发现它与ZFP161蛋白结合，已知可以促进多巴胺转运蛋白（DAT）基因的转录并抑制转录。 4：C8orfk23（FER1L5）是一种新型基因，并产生巨大的蛋白质。同源物搜索表明，基因与非综合听力损失DFNB9的致病基因最相似。 5：通过连锁分析，CSMD3被认为是良性家族性癫痫的可能致病基因。 CSMD家族在大脑中强烈表达，但是对8号染色体的分析表明，CSMD1非常多样化。 6：PKHD1L1是负责多囊肾脏病（ARPKD）的基因PKHD1的家族基因。 Medaka被选为模型生物，可以通过RT-PCR测序67个外显子。 7：DSCR4是一种极为罕见的蛋白质，仅在人体组织中的胎盘中检测到，而在小鼠胎盘中则没有检测到。制备了一系列包含转录起源的缺失，并测量了活性，并且在NT-800附近的区域发现了活动的显着增加。 8：COH1（VPS13B）是一种巨型蛋白质，已被鉴定为科恩综合征的致病基因。由于VSP13A是负责绒毛膜和多刺红细胞增多症的基因，因此人们认为所有VSP13家族都有一些重要的生理作用。