课题基金 / 基金详情

DNAの曲がりとタンパク質による認識の構造的基盤

DNAの曲がりとタンパク質による認識の構造的基盤
DNA弯曲和蛋白质识别的结构基础
批准号：
63580213
负责人：
西村 善文
金额：
$1.6万
依托单位：
Yokohama City University (1989)The University of Tokyo (1988)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1988
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1988 至 1989
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-63580213/
关键词：
DNAの曲がりOmpRDNA結合タンパク質転写制御DNA二重らせん転写活性化タンパク質ラマン分光NMR分子動力学

项目摘要

项目成果

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◎曲ったDNAと特異的に結合するタンパク質である大腸菌の転写制御因子であるOmpRについて次の事を行った。(1)OmpRタンパク質は2つのドメイン構造から成り、そのN末ドメインは浸透圧のセンサ-タンパク質である。EnvZによりリン酸化され、C末ドメインはDNA結合ドメインである事が判った。(2)OmpRのDNA結合ドメインの大腸菌大量発現条を作成し、大量精製する事に成功した。またそのドメインのNMRの測定により、いくつかのアミノ酸の帰属を行った。(3)OmpRのNMRの測定によりいくつかのメチオニン残基のシグナルの帰属を化学修飾の実験と平行することにより行った。(4)現在OmpRのDNA結合ドメインのみを、大腸菌大量発現条で^<15>Nラベルを行ない、その三次元構造を二次元NMR、三次元NMRで解析するための準備を行っている。◎OmpR以外のDNA結合タンパク質として他2次の2種類を取り上げた。(1)大腸菌のリン酸レギュロンの転写調節タンパク質であるPhoBのDNA結合ドメインの大量精製を行なった。(2)プロトオンコジ-ンであるMybタンパク質のDNA結合ドメインを大量精製し、ケイ光スペクトル、ラマンスペクトルよりMybタンパク質中のトリプトファンの環境を調べた。◎曲ったDNAの高次構造を計算機シミュレ-ションで求めた。(1)ニワトリの性染色体の一つであるW染色体のくり返し単位は、約0.7kbで11/3回転している事が判った。(2)ヒト遺伝子のいくつかについてその超高次構造を計算機により求め染色体のバンド構造と相関について調べた。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
加藤晃一他: "Proton Nuclear Magnetic Resonance Study of a Selectively Deutirated Mouse Monoclonal Antibody" J.Biochemistry. 106. 361-364 (1989)
Koichi Kato 等人：“选择性去饱和小鼠单克隆抗体的质子核磁共振研究”J.Biochemistry 106. 361-364 (1989)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
加藤晃一他: "Applications of BC Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy to the Molecular Structural Analyses of the Antibody Molecule" J.Biochemistry. 105. 867-869 (1989)
Koichi Kato 等人：“BC 核磁共振波谱在抗体分子分子结构分析中的应用”J.Biochemistry 105. 867-869 (1989)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
加藤雅士他: "Location of Phosphorelation site and DNA-binding site of a positive regulator,OmpR." FEBS Lett. 249. 168-172 (1989)
Masashi Kato 等人：“正调节因子的磷酸化位点和 DNA 结合位点的位置，OmpR”249. 168-172 (1989)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
楯真一: FEBS Letters. 242. 27-30 (1988)
泰特新一：FEBS 快报 242. 27-30 (1988)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
    • 批准号：
      23K27119
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $8.74万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
    • 批准号：
      23H02426
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.9万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造解析
    • 批准号：
      20247018
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $8.9万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    染色体末端テロメアの構造生物学
    • 批准号：
      17012020
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.44万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    国内基金
    海外基金
    双组分调节系统envZ/ompR参与嗜水气单胞菌耐药机制和致病机制的研究
    • 批准号：
      32302933
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      30.00万元
    • 批准年份：
      2023
    • 负责人：
      刘俊琦
    • 依托单位：
      湖南省畜牧兽医研究所
    乳制品中HVPG-ST4阪崎克罗诺杆菌EnvZ/OmpR系统介导的危害形成及噬菌体靶向防控机制
    转录调节因子CpxR与OmpR协同调控Xenocoumacin1生物合成的分子机制
    • 批准号：
      32072474
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      58.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      王永红
    • 依托单位：
      西北农林科技大学
    OmpR依赖TCS调控钩端螺旋体主要外膜蛋白抗原表达及LPS合成与变构分子机制研究
    • 批准号：
      81971951
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      55.0万元
    • 批准年份：
      2019
    • 负责人：
      胡玮琳
    • 依托单位：
      浙江大学