课题基金 / 基金详情

蛋白質が認識するDNA構造

蛋白質が認識するDNA構造
蛋白质识别的DNA结构
批准号：
04254105
负责人：
西村 善文
金额：
$21.44万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1992
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1992 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04254105/
关键词：
タンパク質DNA立体構造NMRX線結晶解析DNA給合ドメインがん遺伝子産物Myb

项目摘要

项目成果

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核内原がん遺伝子産物MybのDNA結合ドメインは3個のリピート構造からなり、N末から順にR1,R2,R3と呼ばれている。各リピートの立体構造と機能に関して以下の事がわかった。1.R3の立体構造をNMRにより解析し、3個のヘリックスからなり、2番目と3番目のヘリックスは、ホメオドメインや細菌のリプレッサータンパク質のDNA認識モチーフであるヘリックス・ターン・ヘリックス構造と類似した構造をとっていた。3番目のヘリックスがDNAの大きな溝にはまり、AACの配列を認識していることが示唆された。2.R1の立体構造をNMRにより解析し、R3と類忍した立体構造で、同じく3個のヘリックスからなっていた。保存性の高い3個のトリプトファンは他の脂肪族アミノ酸とともに疎水性コアを形成していたが、ヒスチジンは関与していなかった。3.R2とR3の両方を含むR23,DNA結合ドメイン全体のR123のNMRの解析からR3単独の立体構造はR23やR123中に保存されていた。4.特異的なDNAとの相互作用の結果、DNAとの特異的な結合にはR23が必須であることがわかった。5.DNAの一連の変異実験から、特異的な配列としてAACXGX(C/T/A)配列が同定できた。またDNA側のデリーションの実験と組み合わせることにより、R3がAAC配列をR2がGX(C/T/A)配列を認識していることが示された。6.そのほかOmpR、HーNS,HU等に関してもDNA認識機構を検討した。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
上杉 晴一: "NMR studies of a DNA containing 8-Methoxy-deoxy guanosine" Nucleosides Nucleotides. 11. 261-272 (1992)
Haruichi Uesugi：“含有 8-甲氧基-脱氧鸟苷的 DNA 的核磁共振研究”核苷核苷酸。 11. 261-272 (1992)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
平尾 一郎: "Extra ordinary stable mini-hairpins" Nucleic Acids Res.20. 3891-3896 (1992)
Ichiro Hirao：“超普通稳定的迷你发夹”核酸研究 3891-3896 (1992)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
緒方 一博: "Solution structure of a DNA-binding unit of Myb" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 89. 6428-6432 (1992)
Kazuhiro Ogata：“Myb DNA 结合单元的溶液结构”Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89. 6428-6432 (1992)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
平尾 一郎: "Stability difference between DNA and RNA minihairpins containing two G-C pairs" Nucleic Acids Symposium Series. 27. 127-128 (1992)
Ichiro Hirao：“含有两个 G-C 对的 DNA 和 RNA 微型发夹之间的稳定性差异”核酸研讨会系列 27. 127-128 (1992)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
    • 批准号：
      23K27119
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $8.74万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
    • 批准号：
      23H02426
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.9万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造解析
    • 批准号：
      20247018
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $8.9万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    染色体末端テロメアの構造生物学
    • 批准号：
      17012020
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.44万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    国内基金
    海外基金
    PCV2茎环结构DNA激活cGAS-STING通路诱导的天然免疫应答的作用研究
    • 批准号：
      2026JJ50413
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      王东亮
    • 依托单位：
      湖南农业大学
    机械力响应型DNA探针用于肿瘤微环境细胞力学可视化与药物筛选研究
    • 批准号：
      2026JJ60135
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      杨思慧
    • 依托单位：
      南华大学
    CDC45通过调控DNA复制应激促进肝癌发生发展的机制
    自供能传感阵列同步量化游离DNA与PSA实现前列腺癌的诊断和预后判断
    • 批准号：
      JCZRLH202601177
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
    • 依托单位：
      黄冈师范学院