遺伝子発現の量的差異を指標とした、新規病態解析法の確立に関する研究

以基因表达量差异为指标建立病理分析新方法的研究

• 批准号: 13204094
• 负责人: 村上 善則
• 金额: $ 4.48万
• 依托单位: National Cancer Center Research Institute and Research Center for Innovative Oncology, National Cancer Center Hospital East
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13204094/
• 关键词: 遺伝子多型; 遺伝子発現量; アレル; 本態性高血圧症; アンギオテンシノーゲン; ハプロタイプ

個体間の体質や疾患罹患性の差はゲノム塩基配列の多型の差に由来し、この差が遺伝子産物の構造や発現様式の差を介して個体の表現型を修飾すると考えられる。申請者は、遺伝子発現の様式や量を修飾する多型に注目し、遺伝子多型を指標として、各アレル当りの遺伝子発現量(mRNA)を高度定量的に検出するRNA Difference Plot(RDP)法を確立した。この手法を用いて、生活習慣病や遺伝性疾患において、多型、変異の遺伝子発現量に対する影響、遺伝子発現量の表現型に対する影響を明らかにしようと試み、以下の成果を得た。1)本態性高血圧症(EHT)におけるAngiotensinogen(AGT)遺伝子のRDP解析:AGT遺伝子のコドン235のcSNPを標的としたRDP解析を行い、統計学的にEHTの罹患と相関するThreonine型多型アレルからのAGT遺伝子の発現量が、正常血圧者と相関するMethionine型アレルからの発現量より有意に高い例を、M/Tヘテロ接合者の一部に見出した(旭川医科大学、羽田明教授、東京大学、井ノ上逸朗助教授との共同研究)。2)遺伝性疾患の原因遺伝子の発現量に基づく病態解析:原因遺伝子にミスセンス変異をもつ遺伝性疾患の家系において、変異アレル由来のmRNA量が保因者間で差違を示し、これが同一変異をもつ個体間の表現型の差違の原因となる可能性があること、また、各アレルからの発現量がハプロタイプに依存する可能性があることを見出した。

Differences in disease susceptibility among individuals are mediated by differences in the origin and evolution of gene products and modifications in individual phenotypes. The RNA Difference Plot(RDP) method was established for highly quantitative detection of the expression of mRNA in each of the three groups. The following results have been obtained from the study of the effects of different methods on the expression of genes, living habits and genetic diseases. 1) RDP analysis of Angiotensinogen(AGT) gene in essential hypertension (EHT): cSNP marker of AGT gene was analyzed in RDP analysis, statistical correlation between EHT and EHT, occurrence of AGT gene in threanine type polymorphism, occurrence of methionine-type polymorphism in normotensive patients, and occurrence of M/T gene conjugator.(Joint research by Professor Akira Hata, University of Tokyo, and Assistant Professor Iguchi Ue). 2)Pathological analysis of genetic disease causative gene expression: genetic gene expression is dependent on genetic disease family, genetic gene expression is dependent on genetic disease family.

项目成果

Fukuhara, H., Murakami, Y. et al.: "Isolation of the TSLL1 and TSLL2 genes, members of the tumor suppressor TSLC1 gene family encoding transmembrane proteins"Oncogene. 20. 5401-5407 (2001)

Fukuhara, H., Murakami, Y. 等人：“TSLL1 和 TSLL2 基因的分离，它们是编码跨膜蛋白的肿瘤抑制基因 TSLC1 基因家族的成员”Oncogene。

Nishimoto, A., Murakami, Y., Oshimura, M. et al.: "Evidence for a telomerase repressor gene on human chromosome 10p15.1"Oncogene. 20. 828-835 (2001)

Nishimoto, A.、Murakami, Y.、Oshimura, M. 等人：“人类染色体 10p15.1 上端粒酶阻遏基因的证据”癌基因。

Kanbe, T., Murakami, Y. et al.: "Four single-nucleotide polymorphisms in the human BUB1 gene"Journal of Human Genetics. 46. 150-151 (2001)

Kanbe, T., Murakami, Y. 等人：“人类 BUB1 基因中的四种单核苷酸多态性”人类遗传学杂志。

Kuramochi, M., Murakami, Y. et al.: "TSLC1 is a tumor suppressor gene in human non-small cell lung cancer"Nature Genetics. 27. 427-430 (2001)

Kuramochi, M., Murakami, Y. 等人：“TSLC1 是人类非小细胞肺癌的肿瘤抑制基因”Nature Genetics。

Fukuhara, H., Murakami, Y. et al.: "Functional evidence for the presence of tumor suppressor gene on chromosome 10p15 in human prostate cancers"Oncogene. 20. 314-319 (2001)

Fukuhara, H.、Murakami, Y. 等人：“人类前列腺癌染色体 10p15 上存在肿瘤抑制基因的功能证据”Oncogene。