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ペプチドライブラリーを用いたCTLエピトープの解析

使用肽库分析 CTL 表位

基本信息

批准号：
08281208
负责人：
宇高恵子
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1996
资助国家：
日本
起止时间：
1996 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08281208/
关键词：
MHC ペプチドライブラリー T細胞エピトープマラリア

项目摘要

1)MHC結合に対するペプチド上の各アミノ酸の貢献度の測定9アミノ酸長のランダムライブラリーを用いてマウスKb、Db、Ldについてポジショナルスキャニングを行った結果、各MHC分子に特徴的なアミノ酸の結合貢献度の違いが観察された。2)ライブラリーの結合実験値を用いた既知のT細胞エピトープの予測上記結合実験値を加算的に扱い、任意のペプチドについてその結合度を予測した。その結果、300〜500アミノ酸長程度の親蛋白質中に存在するペプチドのうち既知のT細胞エピトープのほとんどは上位1〜7番目にランクされ、Ldのように自然エピトープがすべて1位にあげられたものもあった。しかし、MUT1腫瘍ペプチドにように低く予想されたものもあった。このペプチドは実測でも結合能は測定限界以下であった。3)未知のペプチドに対するMHC結合性の予測上記の予想法を自動化するプログラムを作製した。任意の蛋白質由来のペプチド約60種について結合能を実測し、予想値と比較した。両者の間には正の相関がみられたが、一桁程度のふれのある分布をみせた。これは、各アミノ酸の貢献が完全に独立には扱いきれないことを反映するものであろう。4)既知のマラリア蛋白質中にT細胞エピトープを予想する試み遺伝子配列のわかっているマラリア蛋白質のうち肝細胞期に発現されている可能性のあるものについて高いMHC結合能をもつペプチドを予想した。しかし、今回ライブラリーによる解析が可能となったペプチドトランスポーター欠損株の得られているMHC分子については細胞障害性T細胞に認識されるエピトープの報告がなく、予想と実際のエピトープの比較はできなかった。今後は、ヒトのMHCについてマラリア蛋白質中で提示されるペプチドを予測し、既知の報告と比較し、可能性のあるペプチドについて免疫効果をみたい。

1) the results of MHC combined with each other were used to determine 9% of the total acid concentration of each MHC molecule, and the results of each MHC molecule were compared with each other. 2) the combination of the data and the data is based on the fact that you know that the combination of the data on the computer and the calculation of the data in the above record is based on the combination of the data and the data. The results showed that there was a significant increase in the concentration of acid in the protein of 300,500 and 500. it is known that there is a significant increase in the number of cells in which you know that you are in the first place, and that there is a significant increase in the number of cells in which you know that there is a significant difference between the two groups. I don't think so. I don't want to. I don't know. I don't know, MUT1, I don't know. The combination of this method can be used to measure the temperature below the limit. 3) if you don't know how to combine the MHC, you can use the idea above to make it easier to make a difference. The reason for the determination of any protein is that the combination of about 60 kinds of protein can be used to compare the results. The customers are in the same position as each other, and there is a wide range of temperature distribution. You may be completely independent of each other, and you will reflect the situation. 4) since we know that there is no difference in the number of cells in the protein chain, we know that we do not want to know that we are interested in the protein phase of the liver. We know that it is possible to detect the possibility of the cell phase of the liver in the cell phase of the liver. We know that it is possible to detect the possibility that the combination of high-level MHC can be detected. This time, this time, you may want to know that the MHC molecules are harmful to the cells. You may want to know that the cell is harmful to the cells. In the future, you will be told that you know that your report is better than what you already know, and that you may be immunized. In the future, you will be told that you will be immunized.