転座型白血病のDNAチップを用いた分子機構の解析

DNA芯片分析易位白血病的分子机制

• 批准号: 14026010
• 负责人: 林 泰秀
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14026010/
• 关键词: 遺伝子; ゲノム; バイオテクノロジー; マイクロアレイ; 癌

転座型白血病細胞の新規転座関連遺伝子を単離して、その遺伝子の発生と分化における役割およびキメラ遺伝子の標的遺伝子を検索した。我々はこれまで11q23転座型白血病のMLL遺伝子の相手遺伝子をCBP, p300, ABI1, AF5q31など8種単離した。転座型白血病に関連する遺伝子を次々と単離しつつ、これらの遺伝子をin vitroとマウスの系を用いて正常での役割を検討する。転座型急性リンパ性白血病(ALL)の新鮮検体を用いて、転座の相手による発現の相違をDNA Chipを用いて検索し、下流の標的遺伝子を探索した。t(4;11)15検体、t(11,19)6検体、t(5;11)2検体、および対照としてt(12;21)6検体、t(1;19)3検体からRNAを抽出し、Affymetrix社のDNA Chip(12,000個)により発現プロファイルの解析を行った。t(4;11)のみ発現している遺伝子が10種、t(11;19)のみに発現している遺伝子が12種みられ、両方に共通して発現がみられる遺伝子が、FLT3, HOXA9, HOXA10等15種にみられた。興味あることに、MLL再構成のある21検体中予後による発現パターンの相違がみられ(p=0.01)、転写因子のRUNX2が予後良好群で、CDP遺伝子が予後不良群で高発現を示した。また21例で共通して発現が高かったFLT3遺伝子の変異を調べたところ、4例(18%)で変異がみられた。これらの遺伝子の発現を定量reverse transcriptase(RT)-PCRでチェックしたところ、ほぼアレイの発現と一致していた。MLL再構成例の共通の標的遺伝子および転座相手の相違によるMLLのキメラ遺伝子の下流の標的遺伝子の相違を探索するため、これらの遺伝子を詳細に検討し、共通する下流遺伝子をしぼる作業を進めている。

The new locus related genes of leukemic cells are isolated, the development and differentiation of the genes are realized, and the target genes of the genes are detected. The MLL gene of 11q23 leukemias has 8 different genes: CBP, p300, ABI1, AF5q31. The relationship between leukaemia and gene expression is discussed in vitro and in normal cases. To explore the application of DNA Chip in the detection of novel forms of acute leukemia (ALL) and the development of novel DNA chips in patients with ALL. t(4;11)15 samples, t(11,19)6 samples, t(5;11)2 samples, t(12;21)6 samples, t(1;19)3 samples, RNA extraction, Affytrix DNA Chip(12,000) detection and analysis. There are 10 species of t(4;11), 12 species of t(11;19), 15 species of t(11;19), FLT3, HOXA9, HOXA10, etc. Interest, MLL reconstruction, and 21-element analysis show that RUNX2, a write factor, is a good group, CDP is a bad group, and the opposite is true (p=0.01). 21 cases were common and 4 cases (18%) were different. Quantitative reverse transcriptase(RT)-PCR was used to detect the gene expression of the gene. MLL reconstruction example common target gene and base phase contrast, MLL's target gene and downstream target gene contrast exploration, the target gene detailed discussion, common downstream gene work progress

项目成果

Taketani T: "Novel NUP98-HOXC11 Fusion Gene Resulted from a Chromosomal Break within Exon 1 of HOXC11 in Acute Myeloid Leukemia with t(11;12)(p15;q13)"Cancer Res. 62. 4571-1574 (2002)

Taketani T：“急性髓系白血病 t(11;12)(p15;q13) 中 HOXC11 外显子 1 内的染色体断裂导致新型 NUP98-HOXC11 融合基因”癌症研究。

Kitagawa Y: "Prevalent involvement of illegitimate V(D)J recombination in chromosome 9p21 deletions in Lymphoid Leukemia"J Biol Chem. 227. 46289-46297 (2002)

Kitakawa Y：“淋巴细胞白血病中染色体 9p21 缺失中普遍存在非法 V(D)J 重组”J Biol Chem。

Taketani T: "The t(7;11)(p15;p15) in acute myeloid leukemia results in fusion of the NUP98 gene with a HOXA cluster gene, HOXA13, but not HOXA9"Genes Chromosomes Cancer. 34. 437-443 (2002)

Taketani T：“急性髓系白血病中的 t(7;11)(p15;p15) 导致 NUP98 基因与 HOXA 簇基因 HOXA13 融合，但不与 HOXA9 融合”基因染色体癌症。

Ono R: "LCX, leukemia-associated protein with a CXXC domain, is fused to MLL in acute myeloid leukemia with trilineage dysplasia having t(10;11)(q22;q23)"Cancer Res. 62. 4075-4080 (2002)

Ono R：“LCX，具有 CXXC 结构域的白血病相关蛋白，与具有 t(10;11)(q22;q23) 的三系发育不良的急性髓系白血病中的 MLL 融合”Cancer Res。

Taketani T: "The HOXD11 gene is fused to the NUP98 gene in acute myeloid leukemia with the t(2;11)(q31;p15)"Cancer Res. 62. 33-37 (2002)

Taketani T：“在急性髓系白血病中，HOXD11 基因通过 t(2;11)(q31;p15) 与 NUP98 基因融合”Cancer Res。