転座型白血病のDNAチップを用いた分子機構の解析

DNA芯片分析易位白血病的分子机制

• 批准号: 15023214
• 负责人: 林 泰秀
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15023214/
• 关键词: 遺伝子; ゲノム; バイオテクノロジー; マイクロアレイ; 癌

転座型白血病細胞の新規転座関連遺伝子を単離して、その遺伝子の発生と分化における役割およびキメラ遺伝子の標的遺伝子を検索した。我々はこれまで11q23転座型白血病のMLL遺伝子の相手遺伝子をCBP, P300,ABI1,AF5q31など8種単離した。今年度は転座型急性リンパ性白血病(ALL)の新鮮検体を用いて、転座の相手による発現の相違をDNAChipを用いて検索した。t(4;11)15検体、t(11,19)6検体、t(5;11)2検体および対照としてt(12;21)6検体、t(1;19)3検体をAffymetrix社のDNA Chip(12,600個)により発現プロファイルの解析を行った。t(4;11)とt(11;19)の両方に共通して発現がみられる遺伝子がFLT3,HOXA9,HOXA10等50種にみられた。MLL再構成のある21検体中予後による発現パターンの相違がみられ(P=0.01)、転写因子のCBF2遺伝子が予後良好群で、CDP遺伝子が予後不良群で高発現を示した。また21例で共通して発現が高かったFLT3遺伝子の変異を調べたところ、乳児ALL 44例中8例(18%)で変異がみられた。また小児ALL 112例では、高2倍体ALL 19例中4例(21.5%)に変異がみられたが、TEL-AML1、E2A-PBX1、BCR-ABL例では変異はみられなかった。これらの遺伝子の発現を定量reverse transcriptase(RT)-PCRでチェックしたところ、ほぼアレイの発現と一致していた。これらの遺伝子を詳細に検討し、共通する下流遺伝子をしぼる作業を進めている。現在、昨年単離したMLL-SEPT6融合cDNAを導入した細胞をマウスに移植し、増殖や造腫瘍性の検討も行っている。

The new locus related genes of leukemic cells are isolated, the development and differentiation of the genes are realized, and the target genes of the genes are detected. The MLL gene of leukemia with 11q23 loci has 8 different genes: CBP, P300,ABI1,AF5q31. This year's novel form of acute leukemia (ALL) was detected by DNA Chip. t(4;11)15 samples, t(11,19)6 samples, t(5;11)2 samples, t(12;21)6 samples, t(1;19)3 samples, Affytrix DNA Chip(12,600) samples, t(5; 11) 2 samples, t (12; 21) 6 samples, t (1;19) 3 samples. t(4;11) t(11;19) MLL reconstruction was found in the 21 models, CBF2 gene was found in the good group, CDP gene was found in the bad group (P=0.01). 21 cases were common and 8 cases (18%) of 44 cases of breast ALL were different. Among 19 cases of ALL, 4 cases (21.5%) were different in TEL-AML1, E2A-PBX 1 and BCR-ABL. Quantitative reverse transcriptase(RT)-PCR was used to detect the gene expression of the gene. This is a detailed review of the data, and a common review of the data. Now, last year, MLL-SEPT6 fusion cDNA was introduced into cells for transplantation, proliferation and selection.

项目成果

Xu G: "Frequent mutations in the GATA-1 gene in the transient myeloproliferative disorder of Down syndrome."Blood. 102・8. 2960-2968 (2003)

Xu G：“唐氏综合症短暂性骨髓增生性疾病中 GATA-1 基因的频繁突变”，Blood 102・8 2960-2968（2003）。

Chen YY: "Genomic structure and mutational analysis of the human KIF1Balpha gene located at 1p36.2 in neuroblastoma."Int J Oncol.. 23・3. 737-744 (2003)

陈YY：“神经母细胞瘤中位于1p36.2的人类KIF1Bα基因的基因组结构和突变分析。”Int J Oncol.. 737-744 (2003)。

Hiwatari M: "Fusion of an AF4-related gene, LAF4, to MLL in childhood acute lymphoblastic leukemia with t(2;11)(q11;q23)."Oncogene. 22・18. 2851-2855 (2003)

Hiwatari M：“儿童急性淋巴细胞白血病中 AF4 相关基因 LAF4 与 t(2;11)(q11;q23) 的融合。”Oncogene 22・18 (2003)。

Echlin-Bell DR: "Polymorphisms in the MLL breakpoint cluster region (BCR)."Hum Genet. 113・1. 80-91 (2003)

Echlin-Bell DR：“MLL 断点簇区域（BCR）中的多态性”。Hum Genet，113・1（2003）。

Tsutsumi S: "Two distinct gene expression signatures in pediatric acute lymphoblastic leukemia with MLL rearrangements."Cancer Res. 63・16. 4882-4887 (2003)

Tsutsumi S：“伴有 MLL 重排的儿童急性淋巴细胞白血病的两种不同基因表达特征。”Cancer Res. 63・16 (2003)。