転座型白血病のDNAチップを用いた分子機構の解析

DNA芯片分析易位白血病的分子机制

• 批准号: 13214022
• 负责人: 林 泰秀
• 金额: $ 2.37万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13214022/
• 关键词: 遺伝子; ゲノム; バイオテクノロジー; マイクロアレイ; 癌

11q23転座型白血病の細胞株と新鮮検体を用いて、転座の相手による発現の相違をDNA Chipを用いて検索し、下流の標的遺伝子を探索した。t(4;11)-とt(11,19)-白血病の細胞株各5株と新鮮検体各8例からRNAを抽出し、cDNAを合成し、Affymetrix社のDNA Chip(12,000個)により発現プロファイルの解析を行った。t(4;11)とt(11,19)の発現プロファイリングは非常に類似していたが、両方を比較すると、t(4;11)のみ発現している遺伝子が10種、t(11;19)のみに発現している遺伝子が12種みられ、両方に共通して発現がみられる遺伝子がHOXA9,HOXA10等15種にみられた。これらの遺伝子の発現をreverse transcriptase(RT)-polymerare chain reaction (PCR)でチェックしたところ、ほぼアレイの発現と一致していた。MLL再構成例の共通の標的遺伝子および転座相手の相違によるMLLのキメラ遺伝子の下流の標的遺伝子の相違を探索するため、これらの遺伝子を詳細に検討している。さらに新鮮白血病各5例を集めて共通する下流遺伝子をしぼる作業を進めている。今年度はさらに乳児急性骨髄性白血病のt(X;11)(q22;q23)のXq22領域よりcDNA panhandle PCR法を用いて新規遺伝子のSEPTIN6をクローニングした。この遺伝子はこれまでのMLLの相手遺伝子CDCREL1,AF17q925と相同性がみられ、SEPTIN familyと思われた。SEPTIN6とAF17q25は、成人組織では脳を除いたほとんどの組織で強く発現していたが、胎児組織では、SEPTIN6の発現は心臓、肺、脳、肝臓では発現していたが、AF17q25は肺、脳、肝臓での発現が強かったのに対して心臓ではほとんど発現していなかった。このMLL-SEPTIN6キメラ遺伝子をもつ乳児AMLは、3例ともFAB分類M1とM2であり、従来のMLL再構成のあるM4,M5とは異なっていた。現在、SEPTIN6遺伝子をES細胞に導入し、ノックアウトマウスの作成を行っている。

11q23 Leukemia Cell Lines and Fresh Samples Using DNA Chip for Detection of DNA Sequences and Downstream Target Sequences t(4;11)-t(11,19)-5 leukemia cell lines each, 8 fresh samples each, RNA extraction, cDNA synthesis, Affytrix DNA Chip(12,000), discovery and analysis. There are 10 species of t(4;11), 12 species of t(11; 19), and 15 species of t(11;19). The reverse transcriptase(RT)-polymerase chain reaction (PCR) is the same as the reverse transcriptase(RT). MLL reconstruction example common target gene and base phase contrast, MLL's target gene and downstream target gene contrast exploration, this paper discusses in detail 5 cases of fresh leukemia were collected, and the results were analyzed. This year, the cDNA panhandle PCR method for t(X;11)(q22;q23) and Xq22 domain of infantile acute osteoblastic leukemia was used to detect the SEPTIN6 gene. The MLL's phase sequence CDCREL1,AF17q925 and identity sequence SEPTIN family sequence SEPTIN6: AF17q25: Adult tissue, fetal tissue, SEPTIN6: Heart, lungs, liver, lungs, liver, heart, liver, liver, lung, liver, liver MLL-SEPTIN 6 Now, SEPTIN6 gene is introduced into ES cells, and its production is carried out.

项目成果

Ono R.: "SEPTIN6, a Human Homologue to Mouse Septin6, Is Fused to MLL in Infant Acute Myeloid Leukemia with Complex Chromosomal Abnormalities Involving 11q23 and Xq24"Cancer Res. 62. 333-337 (2002)

Ono R.：“SEPTIN6 是小鼠 Septin6 的人类同源物，在患有涉及 11q23 和 Xq24 的复杂染色体异常的婴儿急性髓性白血病中与 MLL 融合”癌症研究。

Niitsu N.: "Downregulation of MLL-CBP fusion gene expression is associated with differentiation of SN-1 cells with t(11 ; 16)(q23 ; p13)"Oncogene. 20. 375-384 (2001)

Niitsu N.：“MLL-CBP 融合基因表达的下调与具有 t(11 ; 16)(q23 ; p13)”癌基因的 SN-1 细胞分化相关。

Niitsu N.: "Sensitization by 5-aza-2'-deoxycytidine of leukaemia cells with MLLabnormalities to induction of differentiation by all-trans retinoic acid andlalpha, 25-dihydroxyvitamin D3"Br J Haematol. 112. 315-326 (2001)

Niitsu N.：“具有 MLLab 异常的白血病细胞的 5-氮杂-2-脱氧胞苷对全反式视黄酸和 1α，25-二羟基维生素 D3 诱导分化的敏感性”Br J Haematol。

Murata T.: "Defect of histone acetyltransferase activity of the nuclear transcriptional coactivator CBP may cause Rubinstein-Taybi syndrome"Hum Mol Genet. 10. 1071-1076 (2000)

Murata T.：“核转录共激活因子 CBP 的组蛋白乙酰转移酶活性缺陷可能导致 Rubinstein-Taybi 综合征”Hum Mol Genet。

Shibuya N.: "t(10 ; 11)-Acute Leukemias with MLL-AF10 and MLL-ABI1 Chimeric Transcripts ; Specific Expression Patterns of ABI1 Gene in Leukemia and Solid Tumor Cell Lines"Genes Chromosomes Cancer. 32. 1-10 (2001)

Shibuya N.：“具有 MLL-AF10 和 MLL-ABI1 嵌合转录本的 t(10；11)-急性白血病；白血病和实体瘤细胞系中 ABI1 基因的特异性表达模式”基因染色体癌症。