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Comprehensive analysis of pathogenic ncRNA in host environment

宿主环境致病性ncRNA综合分析

基本信息

批准号：
17F17421
负责人：
関水和久
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Teikyo University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2017
资助国家：
日本
起止时间：
2017-10-13 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

今年度において黄色ブドウ球菌の機能性RNAである黄色ブドウ球菌のrsaC遺伝子破壊株について、マウスに感染させた状態でin vivo RNA-Seq解析について時間経過を含めてより詳細に実施した。その結果、感染後24時間以降に心臓や腎臓など複数の臓器において、黄色ブドウ球菌のsodium:proton antiporterをコードする発現量が低下していることが明らかになった。感染後6時間においては有意な発現変動は認められなかった。これはrsaC遺伝子が感染後期で病原性の発揮に寄与する点と一致している。また、本遺伝子の病原性に関する機能については明らかになっていないことから、rsaC遺伝子の新しい遺伝子機能を見出したと考えられる。一方、本遺伝子はrsaC遺伝子の近傍にあるため、遺伝子の相補を含めて再度検討する必要がある。従って本研究において、rsaC遺伝子が病原性発揮において必須であること、及び、嫌気的条件下における病原性の発揮に必要であること明らかにできたと考えられる。また、我々がカイコ感染モデルで探索し、マウス全身感染モデルにおいても病原性が低下することを見出した8つの新規病原性遺伝子について、試験管内培養条件における機能性RNAの発現変動を実施した。その結果、共通して発現量が低下した機能性RNAは見出されなかったが、いくつかの発現変動パターンが認められることがわかった。さらに、本年度において本研究結果をまとめ、学会発表を行うとともに、論文として投稿しているところである。

This year, the functional RNA of yellow bezoar was detected in vivo RNA-Seq analysis, and the infection status was determined in detail. As a result, 24 hours after infection, the incidence of multiple organ diseases decreased significantly. 6 hours after infection, the virus is intentionally detected. The development of pathogenicity in the late stages of infection is consistent with that of rsaC vectors. The pathogenicity of rsaC gene is related to the function of rsaC gene. A party, the original son of the rsaC son of the near, the son of the complement, including the re-examination of the necessary In this study, the pathogenic development of rsaC gene must be carried out under the conditions of high temperature and high humidity. The development of functional RNA under culture conditions in vitro has been investigated and new rules have been found for pathogenic RNA production. As a result, the amount of common RNA is low, and functional RNA is not found in all cases. This year's research results are published in Chinese.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Discovering novel roles of genes for virulence of Staphylococcus aureus USA300 using invertebrate model silkworm

使用无脊椎动物模型蚕发现金黄色葡萄球菌 USA300 毒力基因的新作用

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Suresh Panthee;Hiroshi Hamamoto;Atmika Paudel;Kazuhisa Sekimizu
通讯作者：
Kazuhisa Sekimizu

In-vivo transcriptomic analysis of Staphylococcus aureus infections

金黄色葡萄球菌感染的体内转录组分析

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shiba Tomoo;Inaoka Daniel Ken;Takahashi Gen;Tsuge Chiaki;Kido Yasutoshi;Young Luke;Ueda Satoshi;Balogun Emmanuel Oluwadare;Nara Takeshi;Honma Teruki;Tanaka Akiko;Inoue Masayuki;Saimoto Hiroyuki;Harada Shigeharu;Moore Anthony L.;Kita Kiyoshi;Suresh Panthee
通讯作者：
Suresh Panthee

細菌感染症研究における様々な網羅的RNA解析手法

用于细菌传染病研究的多种综合RNA分析方法