课题基金 / 基金详情

Analysis of sensor proteins which regulates mitochondrial dynamics in skeletal muscle

Analysis of sensor proteins which regulates mitochondrial dynamics in skeletal muscle
调节骨骼肌线粒体动力学的传感器蛋白分析
批准号：
21K19066
负责人：
清水 誠
金额：
$4.16万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2021-07-09 至 2024-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19066/
关键词：
ミトコンドリアダイナミクス骨格筋ミトコンドリア老化RNAiスクリーニング

项目摘要

项目成果

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本年度は、昨年度に構築したスクリーニング方法（蛍光タンパク質をレポーターとした新たな実験系）により、shRNAライブラリーを用いた筋ミトコンドリアダイナミクス調節因子の発現を制御する新たな発現制御因子の探索実験を行った。ミトコンドリアダイナミクス調節因子の遺伝子発現調節領域（プロモーター領域及びエンハンサー領域）のレポーターを恒常的に発現するヒト骨格筋細胞株を樹立し、shRNAライブラリーを発現させるレンチウイルスを感染させ、薬剤により感染した細胞のみを抽出した。これらの細胞をFACSを用いて蛍光強度（プロモーター、エンハンサーの活性）が増加、もしくは低下する細胞を選別した。これらの細胞よりゲノムDNAの抽出・精製を行った。今回用いたshRNAライブラリーは標的遺伝子のshRNA配列に加え、該当遺伝子に対応するバーコード配列が含まれている。shRNA部分のDNA配列解析は困難であることが多いため、バーコード配列を標的としたDNA配列を標的とした次世代シーケンサー解析を行った。配列依存的にPCR増幅効率が異なることが予想されたため、PCRのサイクル数を最低限（15サイクル前後）、かつ次世代シーケンサーで解析可能な十分なDNA量が得られるPCRの実験条件を慎重に最適化した。本サンプルを用いて、バーコード配列を標的とした次世代シーケンサーを用いた配列解析を行っい、候補遺伝子の選定を行った。
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会议论文
大豆タンパク質βコングリシニンによる代謝改善効果
大豆蛋白β-伴大豆球蛋白的代谢改善作用
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [Suzuki Toshihide, Shimizu Makoto, Yamauchi Yoshio, Sato Ryuichiro, 清水誠]
通讯作者： 清水誠
Pathophysiological levels of GDF11 activate Smad2/Smad3 signaling and induce muscle atrophy in human iPSC-derived myocytes
GDF11 的病理生理水平激活 Smad2/Smad3 信号传导并诱导人 iPSC 衍生的肌细胞肌肉萎缩
DOI： 10.1152/ajpcell.00341.2022
发表时间： 2022
期刊： American Journal of Physiology-Cell Physiology
影响因子： 5.5
作者： [Honda Mikako, Makino Takumi, Zhao Xiaolin, Matsuto Mariko, Sakurai Hidetoshi, Takahashi Yu, Shimizu Makoto, Sato Ryuichiro, Yamauchi Yoshio]
通讯作者： Yamauchi Yoshio
低タンパク質誘導性脂肪肝を制御する新たな転写因子の同定
控制低蛋白诱导脂肪肝的新转录因子的鉴定
DOI： --
发表时间： 2021
期刊：
影响因子： --
作者： [清水誠, 鄭力榕 , 不野歩美, 梅村真理子, 高橋勇二, 山内祥生, 佐藤隆一郎]
通讯作者： 佐藤隆一郎
Comparison of gene expression and activation of transcription factors in organoid-derived monolayer intestinal epithelial cells and organoids
类器官来源的单层肠上皮细胞和类器官中基因表达和转录因子激活的比较
DOI： 10.1093/bbb/zbab136
发表时间： 2021
期刊： Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
影响因子： --
作者： [Takahashi Yu, Inoue Yu, Kuze Keitaro, Sato Shintaro, Shimizu Makoto, Kiyono Hiroshi, Yamauchi Yoshio, Sato Ryuichiro]
通讯作者： Sato Ryuichiro
共 9 条
    老化細胞除去を基軸とした新たな抗老化食品成分の創製
    • 批准号：
      23K26849
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $9.24万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      清水 誠
    • 依托单位：
      Ochanomizu University
    Study of anti-aging food factors which activate senolysis
    • 批准号：
      23H02156
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.81万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      清水 誠
    • 依托单位：
      Ochanomizu University
    ゲルマン語類型論から見たドイツ語の新しい構造記述
    • 批准号：
      19K00540
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      清水 誠
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    カーボンナノ粒子の腸管吸収と細胞応答
    • 批准号：
      20658033
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.18万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      清水 誠
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    海外基金