Analysis of sensor proteins which regulates mitochondrial dynamics in skeletal muscle

调节骨骼肌线粒体动力学的传感器蛋白分析

基本信息

  • 批准号:
    21K19066
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.16万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-07-09 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本年度は、昨年度に構築したスクリーニング方法(蛍光タンパク質をレポーターとした新たな実験系)により、shRNAライブラリーを用いた筋ミトコンドリアダイナミクス調節因子の発現を制御する新たな発現制御因子の探索実験を行った。ミトコンドリアダイナミクス調節因子の遺伝子発現調節領域(プロモーター領域及びエンハンサー領域)のレポーターを恒常的に発現するヒト骨格筋細胞株を樹立し、shRNAライブラリーを発現させるレンチウイルスを感染させ、薬剤により感染した細胞のみを抽出した。これらの細胞をFACSを用いて蛍光強度(プロモーター、エンハンサーの活性)が増加、もしくは低下する細胞を選別した。これらの細胞よりゲノムDNAの抽出・精製を行った。今回用いたshRNAライブラリーは標的遺伝子のshRNA配列に加え、該当遺伝子に対応するバーコード配列が含まれている。shRNA部分のDNA配列解析は困難であることが多いため、バーコード配列を標的としたDNA配列を標的とした次世代シーケンサー解析を行った。配列依存的にPCR増幅効率が異なることが予想されたため、PCRのサイクル数を最低限(15サイクル前後)、かつ次世代シーケンサーで解析可能な十分なDNA量が得られるPCRの実験条件を慎重に最適化した。本サンプルを用いて、バーコード配列を標的とした次世代シーケンサーを用いた配列解析を行っい、候補遺伝子の選定を行った。
This year's annual に は, yesterday to construct し た ス ク リ ー ニ ン グ method (蛍 light タ ン パ ク qualitative を レ ポ ー タ ー と し た new た な be 験 department) に よ り, shRNA ラ イ ブ ラ リ ー を with い た reinforcement ミ ト コ ン ド リ ア ダ イ ナ ミ ク ス adjustment factor の 発 now を suppression す る new た な 発 suppression factor の now explore be 験 を line っ た. ミ ト コ ン ド リ ア ダ イ ナ ミ ク ス adjustment factor の posthumous son 伝 発 now adjust field (プ ロ モ ー タ ー field and び エ ン ハ ン サ ー) の レ ポ ー タ ー を constant に 発 now す る ヒ ト skeletal muscle cell lines を し, shRNA ラ イ ブ ラ リ ー を 発 now さ せ る レ ン チ ウ イ ル ス を infection さ せ, 薬 tonic に よ り infection し た cells の み を smoke Out of た. こ れ ら を の cells both FACS を with い て 蛍 light intensity (プ ロ モ ー タ ー, エ ン ハ ン サ ー の activity) が raised addition, も し く は low す を る cells choose don't し た. <s:1> れら <s:1> cells よ ゲノム ゲノムDNA samples extracted and refined を rows った. This reuse い た shRNA ラ イ ブ ラ リ ー は mark heritage 伝 son の shRNA match column に plus え, should have 伝 に 応 seaborne す る バ ー コ ー ド match column が containing ま れ て い る. ShRNA part の DNA match column analysis は difficult で あ る こ と が more い た め, バ ー コ ー ド match column を mark と し た DNA match column を mark と し た nextgen シ ー ケ ン サ ー parsing line を っ た. Column dependent に PCR rights of working ratio が different な る こ と が to think さ れ た た め, PCR の サ イ ク ル number を floor (15 サ イ ク ル) before and after, か つ nextgen シ ー ケ ン サ ー で parsing may な very が な DNA quantity have to ら れ る PCR の be を 験 conditions carefully に optimization し た. This サ ン プ ル を with い て, バ ー コ ー ド match column を mark と し た nextgen シ ー ケ ン サ ー を with い た match column line analytical を っ い, alternate but 伝 の を selected rows っ た.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
大豆タンパク質βコングリシニンによる代謝改善効果
大豆蛋白β-伴大豆球蛋白的代谢改善作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Suzuki Toshihide;Shimizu Makoto;Yamauchi Yoshio;Sato Ryuichiro;清水誠
  • 通讯作者:
    清水誠
Pathophysiological levels of GDF11 activate Smad2/Smad3 signaling and induce muscle atrophy in human iPSC-derived myocytes
GDF11 的病理生理水平激活 Smad2/Smad3 信号传导并诱导人 iPSC 衍生的肌细胞肌肉萎缩
  • DOI:
    10.1152/ajpcell.00341.2022
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Honda Mikako;Makino Takumi;Zhao Xiaolin;Matsuto Mariko;Sakurai Hidetoshi;Takahashi Yu;Shimizu Makoto;Sato Ryuichiro;Yamauchi Yoshio
  • 通讯作者:
    Yamauchi Yoshio
低タンパク質誘導性脂肪肝を制御する新たな転写因子の同定
控制低蛋白诱导脂肪肝的新转录因子的鉴定
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    清水誠;鄭力榕 ;不野歩美;梅村真理子;高橋勇二;山内祥生;佐藤隆一郎
  • 通讯作者:
    佐藤隆一郎
Comparison of gene expression and activation of transcription factors in organoid-derived monolayer intestinal epithelial cells and organoids
类器官来源的单层肠上皮细胞和类器官中基因表达和转录因子激活的比较
  • DOI:
    10.1093/bbb/zbab136
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takahashi Yu;Inoue Yu;Kuze Keitaro;Sato Shintaro;Shimizu Makoto;Kiyono Hiroshi;Yamauchi Yoshio;Sato Ryuichiro
  • 通讯作者:
    Sato Ryuichiro
Orange peel extract reduces the inflammatory state of skeletal muscle after downhill running via an increase in IL-1RA
  • DOI:
    10.1093/bbb/zbab049
  • 发表时间:
    2021-03-19
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Suzuki, Toshihide;Shimizu, Makoto;Sato, Ryuichiro
  • 通讯作者:
    Sato, Ryuichiro
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

清水 誠其他文献

条件制御の能力を高める指導方法の研究-児童が考えた実験を取り組ませることの効果-
提高控制条件能力的教学方法研究 -让孩子们进行自己设计的实验的效果-
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    清水誠;石井都;梅津恵子;島田直也;高垣マユミ;高橋 修(分担執筆);高橋 修(分担執筆);清水誠;清水 誠;清水誠・高垣マユミ・安田修一・牧野正;紺野雅弘・清水誠・吉井規雄
  • 通讯作者:
    紺野雅弘・清水誠・吉井規雄
The Neverending Adoration and Idolization of Goethe
对歌德永无休止的崇拜和崇拜
  • DOI:
  • 发表时间:
    2002
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    井戸田総一郎;Soichiro Itoda;井戸田総一郎;井戸田総一郎;Soichiro Itoda;井戸田総一郎;Soichiro Itoda;Soichiro Itoda;原 克;Soichiro Itoda;原 克;Soichiro Itoda;原克;Soichiro Itoda;清水 誠;井戸田総一郎;清水 誠;Soichiro Itoda;原 克(単著);Soichiro Itoda
  • 通讯作者:
    Soichiro Itoda
German as a Germanic Language (10) : Strong Verbs, Preterite-Present Verbs and Vowel Gradation
德语作为日耳曼语言(10):强动词、过去现在动词和元音分级
  • DOI:
    10.14943/bfhhs.169.l1
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    SHIRAI;Satoko; NAGANO;Yasuhiko;堀 博文;戸塚学;清水 誠
  • 通讯作者:
    清水 誠
満州アウトバーン計画 ベルリン発、東京経由、ハルピン行き
柏林经东京至哈尔滨的满洲高速公路计划
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    HARA;Katsumi;清水 誠;原 克;清水 誠;原 克
  • 通讯作者:
    原 克
骨格筋萎縮における抗肥満ホルモンFGF21の発現制御機構および機能解析
抗肥胖激素FGF21在骨骼肌萎缩中的表达调控机制及功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    川邊 充希;清水 誠;三浦 雄也;橋詰 力;山内 祥生;佐藤 隆一郎
  • 通讯作者:
    佐藤 隆一郎

清水 誠的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('清水 誠', 18)}}的其他基金

老化細胞除去を基軸とした新たな抗老化食品成分の創製
基于去除衰老细胞创造新的抗衰老食品成分
  • 批准号:
    23K26849
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Study of anti-aging food factors which activate senolysis
激活衰老作用的抗衰老食物因子的研究
  • 批准号:
    23H02156
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
ゲルマン語類型論から見たドイツ語の新しい構造記述
日耳曼语言类型学视角下的德语新结构描述
  • 批准号:
    19K00540
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
カーボンナノ粒子の腸管吸収と細胞応答
碳纳米粒子的肠道吸收和细胞反应
  • 批准号:
    20658033
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
食物質による腸管上皮トランスポートソーム制御の機能的解析
膳食物质对肠上皮转运体调节的功能分析
  • 批准号:
    20056006
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
無機有機複合層状半導体におけるトリエキシトンの探求
探索无机-有机复合层状半导体中的三激子
  • 批准号:
    19740188
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
腸管の高分子吸収細胞M-cellのモデル系構築と吸収機能制御因子の探索
肠道大分子吸收细胞M-cell模型体系的构建及吸收功能调节剂的寻找
  • 批准号:
    17658061
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
電子正孔対の高効率輸送とこれを利用した光学非線形性の研究
电子空穴对的高效传输及其光学非线性研究
  • 批准号:
    17760019
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
脂肪細胞の分化およびサイトカイン産生のタウリンによる制御
牛磺酸调节脂肪细胞分化和细胞因子产生
  • 批准号:
    15658041
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
無機・有機複合層状半導体における励起子間相互作用の研究
无机/有机复合层状半导体中激子-激子相互作用的研究
  • 批准号:
    15740189
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

相似海外基金

女性ホルモンが関与するミトコンドリアを中心としたオルガネラ連関による骨格筋適応
通过以涉及雌性激素的线粒体为中心的细胞器相互作用进行骨骼肌适应
  • 批准号:
    24K02827
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
骨細胞由来の骨格筋恒常性阻害因子の探索研究
骨细胞源性骨骼肌稳态抑制剂的探索性研究
  • 批准号:
    22K19607
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
2型糖尿病の筋力低下を防止する骨格筋ミトコンドリアの新たな制御機構の解明
阐明骨骼肌线粒体的新调节机制,可预防 2 型糖尿病患者的肌肉无力
  • 批准号:
    22K17745
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
骨格筋のミトコンドリア増減に関与する局所因子と体液性因子の影響
参与骨骼肌线粒体增加/减少的局部和体液因素的影响
  • 批准号:
    22K11600
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
骨格筋におけるPGC-1αを介したカルジオリピン生合成機序の解明
骨骼肌中PGC-1α介导的心磷脂生物合成机制的阐明
  • 批准号:
    22K17831
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
「機能未知で未命名な運動応答性遺伝子」による骨格筋ミトコンドリアの量的・質的制御
通过“功能未知的未命名运动反应基因”对骨骼肌线粒体进行定量和定性控制
  • 批准号:
    21H03332
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
生活習慣の乱れによる骨格筋機能低下の機序解明
阐明生活方式障碍导致骨骼肌功能下降的机制
  • 批准号:
    21K11591
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
加齢による骨格筋ミトコンドリア構造の変化と運動の効果
骨骼肌线粒体结构与年龄相关的变化以及运动的影响
  • 批准号:
    21K11401
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
疾患iPS細胞を用いた骨格筋代謝におけるミトコンドリア機能の意義の解明
使用患病 iPS 细胞阐明线粒体功能在骨骼肌代谢中的重要性
  • 批准号:
    21K08587
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
骨格筋の運動適応に関与する長鎖ノンコーディングRNAの同定とその生理機能
骨骼肌运动适应相关长链非编码RNA的鉴定及其生理功能
  • 批准号:
    20K19491
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了