课题基金 / 基金详情

蛋白質が認識するDNA構造

蛋白質が認識するDNA構造
蛋白质识别的DNA结构
批准号：
02263104
负责人：
西村 善文
金额：
$35.2万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1990
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1990 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-02263104/
关键词：
DNA結合タンパク質ラマン分光NMR高次構造DNAの湾曲Mybタンパク質OmpR

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项目成果

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○蛋白質が認識するDNA構造の班として次の事を解明した。1.塩基配列特異的にDNAと結合するタンパク質として,原がん遺伝子mybの産物Mybタンパク質のDNA結合ドメインの大腸菌大量発現系を作成し,精製法を確立した。そのタンパク質のラマンスペクトルを測定し,その結果,αーヘリックスが存在する事,トリプトファンが疎水的な環境にある事を見出し,これらの実験と部位特異的突然変異の実験とをもとにして,トリプトファンクラスタ-という新しいタイプのDNA結合モチ-フを提案した。2.上記トリプトファンクラスタ-の結合モチ-フを大量に化学合成し,2次元NMRの測定をおこない,水溶液中の3次元立体構造解析を行なった。3.DNAオリゴマ-の水溶液中の3次元立体構造解析を,ラマンスペクトル,NMRスペクトルの測定結果について,制限付分子動力学計算を行ないえた。塩基配列はCCTTAAGGである。4.大腸菌の外膜タンパク質OmpFとOmpCの発現を培地浸透圧に対応して制御するOmpRは,リン酸化によってompFとompCの両遺伝子のプロモ-タ-に強く結合するようになる事が判った。このリン酸化は,外膜タンパク質のEnvZによっておこる。5.大腸菌から,特に強く湾曲したDNAに結合するタンパク質を見出した。このタンパク質は湾曲してないDNAには結合せず,DNAの立体構造を認識しているものと思われる。このタンパク質は結果的に,従来報告されているHーNSであった。
期刊论文(7)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
石井 知恵: "The Tryptophan Cluster:A Hypothetical Structure of the DNAーbinding Domain of the myb Protooncogene Product" J.Biol.Chem. 265. 19990-19995 (1990)
Chie Ishii：“色氨酸簇：myb 原癌基因产物的 DNA 结合结构域的假设结构”J.Biol.Chem. 265。19990-19995 (1990)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
宇野 公之: "Spectrophotometric and Resonance Raman Studies on the Formation of Phenolate and Thiolate Complexes of (Octaethylporphinato)tron(III)" Inorganic Chemistry. 29. 2803-2807 (1990)
Kimiyuki Uno：“（八乙基卟啉）tron (III) 酚盐和硫醇盐复合物形成的分光光度和共振拉曼研究”无机化学 29. 2803-2807 (1990)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
山田 寿美: "An Escherichia coli Protein That Prefentially Binds to Sharply Curred DNA" J.Biochem.108. 420-425 (1990)
Sumida Yamada：“一种优先结合急剧固化 DNA 的大肠杆菌蛋白”J.Biochem.108（1990）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
小田井 修: "Synthesis and NMR Study of Ribooligonucleotides Forming a Hammerheadーtype RNA Enzyme System" Nucleic Acids Res.18. 5955-5960 (1990)
Osamu Odai：“形成锤头型 RNA 酶系统的核寡核苷酸的合成和 NMR 研究”核酸研究 5955-5960 (1990)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
    • 批准号：
      23K27119
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $8.74万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
    • 批准号：
      23H02426
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.9万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造解析
    • 批准号：
      20247018
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $8.9万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    染色体末端テロメアの構造生物学
    • 批准号：
      17012020
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.44万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      西村 善文
    • 依托单位：
      Yokohama City University
    海外基金