転写のチェックポイントとして機能する基本転写因子TFIIEの情報認識機構の研究

转录检查点基本转录因子TFIIE的信息识别机制研究

• 批准号: 08260213
• 负责人: 大熊 芳明
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08260213/
• 关键词: 転写; 基本転写因子; チェックポイント; 情報認識機構; DNA除去修復; TFIIE; TFIIH

1.TFIIEの欠失変異体の調製と情報認識の際の構造一活性相関の生化学的解析1)構造解析に用いるため、2つあるTFIIEのサブユニットを単独あるいは複合体で大腸菌にて産生させ、S-セファロース、mono-Q、phenyl HPLC等のカラムにて精製した。2)TFIIEのTFIIEβサブユニットの欠質変異体を大腸菌にて産生させ、転写への影響や反応に関与する蛋白質との相互作用を解析した。N末端、C末端から削った変異体及び内部を欠失させた変異体を作成し、解析したところ、N末の50アミノ酸までを削っても転写活性は影響を受けず、C末から13個削ると活性は見られるが野生株の10%以下となった。次にTFIIEβがどの基本転写因子と結合するかを調ると、TFIIBとTFIIFβと強く結合したので、TFIIEβ内のこれら因子の結合領域を解析した。その結果、両者は共にC末端近傍の塩基性領域(アミノ酸257番-277番目)に結合した。2.TFIIEの結晶化とX線構造解析による情報認識機構の検討TFIIEの両サブユニットの精製が完了したので、現在それら全長の蛋白質を結晶化する試みを開始している。3.TFIIHおよびIIEとDNA修復関連蛋白質の相互認識機構の研究精製した蛋白質による無細胞DNA除去修復系を構築し、転写とカップルしたDNA除去修復の際にTFIIHとIIEがいかに情報認識を行なっているかを、精製したこれらの蛋白質を用いて生化学的に解析している。具体的には、現在までに修復因子XPC、XPGとTFIIHとの相互作用が見出された。

1. The structure of TFIIE'S incomplete heterogeneic modulation and information recognition 1) Biochemical analysis of activity 1) Structural analysis for the use of TFIIE's separation and separation 1) Structural analysis for the use of complex 3) Escherichia coli production 3) S-S-S, mono-Q, phenyl HPLC, etc. 2) Analysis of the interaction between TFIIEβ-protein and the production of Escherichia coli N-terminal, C-terminal, and C-terminal, respectively, are not available for production, analysis, and analysis. TFIIEβ is the basic factor for binding, TFIIB β is the strong factor for binding, and TFIIEβ is the binding domain for binding. As a result, the binding between the two groups was found in the basic domain near the C-terminal (257 - 277). 2. Crystallization of TFIIE and X-ray structural analysis of the information recognition mechanism to discuss the purification of TFIIE protein and the beginning of the crystallization of full-length protein. 3. TFIIH and IIE study on mutual recognition mechanism of proteins involved in DNA repair, purification and purification of proteins, construction and characterization of cell-free DNA removal repair system, and information recognition during DNA removal repair. Specific interactions between repair factors XPC, XPG and TFIIH were identified.

项目成果

Sugasawa,K.et al.: "HHR23B,a human rad 23 homolog,stimulates XPC protein in nucleotide excision repair in vitro" Mol.Cell.Biol.16. 4852-4861 (1996)

Sugasawa,K.et al.：“HHR23B，一种人类 rad 23 同源物，在体外核苷酸切除修复中刺激 XPC 蛋白”Mol.Cell.Biol.16。

Sugiyama,S.et al.: "Crystal Structure of PotD,the primary receptor of the polyamine transport system in Esherichia coli" J.Biol.chem.271. 9519-9525 (1996)

Sugiyama,S.et al.：“PotD 的晶体结构，大肠杆菌中多胺转运系统的主要受体”J.Biol.chem.271。

van der Spek,P.J.et al.: "XPC and human homologs of RAD23 : intracellular localization and relationship to other nucleotide excision repair complexes." Nucl.Acids Res.24. 2551-2559 (1996)

van der Spek,P.J.等人：“XPC 和 RAD23 的人类同源物：细胞内定位以及与其他核苷酸切除修复复合物的关系。”

Kawakami,K.et al.: "Characterization of the Core promoter of the Na^+/K^+-ATPase α1 subunit gene" Eur.J.Biochem.237. 440-446 (1996)

Kawakami, K. 等人：“Na^+/K^+-ATPase α1 亚基基因的核心启动子的表征”Eur.J.Biochem.237 (1996)。

Kamada,K.et al.: "Structure of a replication-terminator protein complexed with DNA" Nature. 383. 598-603 (1996)

Kamada,K.et al.：“与 DNA 复合的复制终止子蛋白的结构”自然。