RNaseによるRNA分解制御
RNaseによるRNA分解制御
批准号:
14035208
负责人:
正木 春彦
金额:
$25.73万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2006
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英文摘要
<代表者>1.コリシンDのtRNase高活性ドメインをC末端103残基(D-CRD595)に特定し、D-CRD595単独およびImmDとの複合体の構造をX線結晶解析で決定し、先にImmDとの複合体構造を決定していたC末端94残基(D-CRD604)と構造と活性を比較した。D-CRD595に比べD-CRD604はN末端9残基を欠き、活性を大きく損なうが、ImmD複合体構造はほとんど同一なので、9残基の特異的重要性が示唆された。ImmDはD-CRD595の活性中心に結合し、またImmDの結合前後でD-CRD595は構造をほとんど変えていなかった。2.D-CRD595領域のさまざまな点変異体を作製して各残基の寄与を評価した。予想に反しN末端9アミノ酸は個別には重要でなかった。Hisと二つのLysが触媒中心と考えられ、先のコリシンE5とも異なる新しいRNase反応機構が推定できた。3.D-CRD遺伝子を出芽酵母に導入し、E5-CRDの場合と同様に、CRDの誘導発現に伴ってコロニー形成が停止した。しかし、大腸菌と異なり、tRNA感受性は同等なのに殺菌的でなく静菌的に見え、細胞毒としての作用が細菌と真核細胞とで異なる可能性が生じた。<分担者>1.植物のメチオニン生合成系の鍵酵素であるシスタチオニンγ-シンターゼ(CGS)の遺伝子発現制御では、S-アデノシルメチオニンに応答して翻訳伸長が停止し、それに引き続いてmRNAの分解が誘導され、その際に5'側を欠いたmRNA分解中間体を生じる。トープリント解析によってリボソームの停止位置を決定したところ、mRNA分解中間体の5'末端の位置は停止したリボソームに覆われる領域の5'側であることが明らかになった。2.停止したリボソーム内のペプチジルtRNAのtRNA分子種を同定したところ、ペプチジルtRNAがA部位に存在する状態でリボソームが停止していることがわかった。このことから、翻訳の伸長停止はtRNAの転座の段階で起こることが示唆された。このことは翻訳伸長阻害剤を用いた解析からも支持された。
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Chiba Y.: "S-adenosyl-L-methionine is an effector in the posttranscriptional autoregulation of the cystathionine gamma-synthase gene in Arabidopsis"Proc.Natl.Acad.Sci.USA.. 100・18. 10225-10230 (2003)
Chiba Y.:“S-腺苷-L-甲硫氨酸是拟南芥中胱硫醚γ-合酶基因转录后自动调节的效应子”Proc.Natl.Acad.Sci.USA.. 100・10230 (2003)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
K.Ominato: "Identification of a short highly conserved amino acid sequence as the functional region required for posttranscriptional autoregulation of the cystathionine γ-synthase gene in arabidopsis"J. Biol. Chem.. 277(39). 36380-36386 (2002)
K.Ominato:“拟南芥中胱硫醚 γ-合酶基因转录后自动调节所需的短高度保守氨基酸序列的鉴定”J. Biol. 277(39)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.MASAKI: "The modes of action of colicins E5 and D, and related cytotoxic tRNases"Biochimie. 84(5/6). 433-438 (2002)
H.MASAKI:“大肠杆菌素 E5 和 D 以及相关细胞毒性 tRNA 酶的作用方式”Biochimie。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1042/bst0320597
发表时间:
2004-08-01
期刊:
BIOCHEMICAL SOCIETY TRANSACTIONS
影响因子:
3.9
作者:
[Onouchi, H, Lambein, I, Naito, S]
通讯作者:
Naito, S
Hirao I.: "In vitro selection of RNA aptamers that bind to colicin E3 and structurally resemble the decoding site of 16S ribosomal RNA"Biochemistry. (印刷中). (2004)
Hirao I.:“体外选择与大肠菌素 E3 结合且结构类似于 16S 核糖体 RNA 的解码位点的 RNA 适体”(出版中)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 8 条
コロニーを作らない大腸菌変異株の分離によるコロニー形成の遺伝学
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批准号:21658029
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2009
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
コロニーを作れない微生物の多様性解析と分離法の研究
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批准号:17658039
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
コリシンE5とRNAおよびインヒビターとの特異的相互作用
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批准号:12029206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2000
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
tRNAアンチコドンを標的とするヌクレアーゼトキシンの研究
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批准号:11155207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
Cytotoxic tRNase,コリシンDの研究
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批准号:11876019
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
tRNAアンチコドンを標的とするヌクレアーゼトキシンの研究
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批准号:10174209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1998
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
病原性大腸菌O157株の生態学的な生存・流行戦略の研究
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批准号:09876022
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
tRNAアンチコドンを標的とするヌクレアーゼトキシンの研究
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批准号:09278208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1997
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
変異リボトキシンを用いたリボソーム暗号解読中心の研究
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批准号:08458179
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$5.44万
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财政年份:1996
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
コリシン・リシス遺伝子による大腸菌蛋白質の分泌放出機構
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批准号:04259204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1992
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
コリシン・リシス遺伝子による大腸菌蛋白質の分泌放出機構
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批准号:03264204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1991
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
宿主不適合コドンを持つコリシン遺伝子の発現調節機構
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批准号:01656503
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1989
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
枯草菌における異種蛋白質高能率分泌生産系の構築に関する研究
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批准号:63470112
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$4.48万
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财政年份:1988
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
コリシンE3耐性リボソーム変異にもとづく蛋白質高次構造認識機構の研究
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批准号:62780284
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1987
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
潜在的致死性遺伝子の進化を用いた蛋白質間高次相互作用の解析
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批准号:62220005
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1987
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
潜在的致死性遺伝子の進化を用いた蛋白質間高次相互作用の解析
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批准号:61230006
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1986
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
シグナル配列に依存しない大腸菌蛋白質分泌機構の研究
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批准号:61760091
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1986
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
コリシン・免疫オペロンにおける両遺伝子の転写・翻訳制御機構
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批准号:59760075
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1984
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
大腸菌プラスミドにおけるコリシン‐阻害蛋白複合体の転写・翻訳調節機構の解析
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批准号:58760077
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1983
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
Co1E2, Co1E3因子におけるコリシンと免疫性の発現調節機構の解析
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批准号:57760081
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1982
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负责人:正木 春彦
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依托单位:
海外基金