RNaseによるRNA分解制御

RNase 控制 RNA 降解

• 批准号: 14035208
• 负责人: 正木 春彦
• 金额: $ 25.73万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14035208/
• 关键词: コリシン; リボヌクレアーゼ; tRNA; リボソーム; mRNA; メチオニン生合成; シロイヌナズナ; フィードバック阻害; アンチコドン

<代表者>1.コリシンDのtRNase高活性ドメインをC末端103残基(D-CRD595)に特定し、D-CRD595単独およびImmDとの複合体の構造をX線結晶解析で決定し、先にImmDとの複合体構造を決定していたC末端94残基(D-CRD604)と構造と活性を比較した。D-CRD595に比べD-CRD604はN末端9残基を欠き、活性を大きく損なうが、ImmD複合体構造はほとんど同一なので、9残基の特異的重要性が示唆された。ImmDはD-CRD595の活性中心に結合し、またImmDの結合前後でD-CRD595は構造をほとんど変えていなかった。2.D-CRD595領域のさまざまな点変異体を作製して各残基の寄与を評価した。予想に反しN末端9アミノ酸は個別には重要でなかった。Hisと二つのLysが触媒中心と考えられ、先のコリシンE5とも異なる新しいRNase反応機構が推定できた。3.D-CRD遺伝子を出芽酵母に導入し、E5-CRDの場合と同様に、CRDの誘導発現に伴ってコロニー形成が停止した。しかし、大腸菌と異なり、tRNA感受性は同等なのに殺菌的でなく静菌的に見え、細胞毒としての作用が細菌と真核細胞とで異なる可能性が生じた。<分担者>1.植物のメチオニン生合成系の鍵酵素であるシスタチオニンγ-シンターゼ(CGS)の遺伝子発現制御では、S-アデノシルメチオニンに応答して翻訳伸長が停止し、それに引き続いてmRNAの分解が誘導され、その際に5'側を欠いたmRNA分解中間体を生じる。トープリント解析によってリボソームの停止位置を決定したところ、mRNA分解中間体の5'末端の位置は停止したリボソームに覆われる領域の5'側であることが明らかになった。2.停止したリボソーム内のペプチジルtRNAのtRNA分子種を同定したところ、ペプチジルtRNAがA部位に存在する状態でリボソームが停止していることがわかった。このことから、翻訳の伸長停止はtRNAの転座の段階で起こることが示唆された。このことは翻訳伸長阻害剤を用いた解析からも支持された。

& the representative of lt; & gt;1. The C-terminal residue 94 (D-CRD595) of the C-terminal 94 residue (D-CRD595) was determined by the analysis of the X-ray structure of the D-CRD595-specific and D-CRD595-specific ImmD complex, and the determination of the C-terminal 94 residue (D-CRD604) of the C-terminal 94 residue (D-CRD604). D-CRD595 is more important than the N-terminal 9 residues of D-CRD604, the activity of 9 residues, the ImmD complex, and the 9 residues. The combination of ImmD D-CRD595 active center and D-CRD595 ImmD was performed before and after the combination. In the field of 2.D-CRD595, the residue will be sent to the customer in the field. If you want to change the number of people at the end of the network, you will find that you are very important. The Hisdom Lys Catalyst Center examines the performance of the E5 anti-RNase anti-drug agency in advance. 3.D-CRD spores sprouted yeast into yeast, E5-CRD cells combined with yeast cells, and CRD spools led to the formation of stop spores. The susceptibility of bacteria to eukaryotic cells and tRNA susceptibility to bacteria is similar to that of static bacteria, cytotoxin, eukaryotic cells, possibility of infection. & lt; contributor & gt;1. The plant growth and synthesis system is based on the enzyme enzyme, the enzyme, the CGS, the enzyme, the The position at the end of the 5 'end of the body in the mRNA decomposition determines the location of the 5' end of the body, the location of the 5 'end of the body in the decomposition of the body. two。 Stop the location of the tRNA molecule in the same location as that in the tRNA location A. there is a profile in the location A. If you want to stop the tRNA seat from starting to start, you will show that you are instigating it. It is necessary to use the analysis method to support the expansion and resistance of the machine.

项目成果

Chiba Y.: "S-adenosyl-L-methionine is an effector in the posttranscriptional autoregulation of the cystathionine gamma-synthase gene in Arabidopsis"Proc.Natl.Acad.Sci.USA.. 100・18. 10225-10230 (2003)

Chiba Y.：“S-腺苷-L-甲硫氨酸是拟南芥中胱硫醚γ-合酶基因转录后自动调节的效应子”Proc.Natl.Acad.Sci.USA.. 100・10230 (2003)。

K.Ominato: "Identification of a short highly conserved amino acid sequence as the functional region required for posttranscriptional autoregulation of the cystathionine γ-synthase gene in arabidopsis"J. Biol. Chem.. 277(39). 36380-36386 (2002)

K.Ominato：“拟南芥中胱硫醚 γ-合酶基因转录后自动调节所需的短高度保守氨基酸序列的鉴定”J. Biol. 277(39)。

H.MASAKI: "The modes of action of colicins E5 and D, and related cytotoxic tRNases"Biochimie. 84(5/6). 433-438 (2002)

H.MASAKI：“大肠杆菌素 E5 和 D 以及相关细胞毒性 tRNA 酶的作用方式”Biochimie。

Autoregulation of the gene for cystathionine γ-synthase in arabidopsis:: post-transcriptional regulation induced by S-adenosylmethionine

• DOI: 10.1042/bst0320597
• 发表时间: 2004-08-01
• 期刊: BIOCHEMICAL SOCIETY TRANSACTIONS
• 影响因子: 3.9
• 作者: Onouchi, H;Lambein, I;Naito, S
• 通讯作者: Naito, S

Hirao I.: "In vitro selection of RNA aptamers that bind to colicin E3 and structurally resemble the decoding site of 16S ribosomal RNA"Biochemistry. (印刷中). (2004)

Hirao I.：“体外选择与大肠菌素 E3 结合且结构类似于 16S 核糖体 RNA 的解码位点的 RNA 适体”（出版中）。