ES細胞を用いた新しい構成的発生生物学による分化におけるゲノム機能の網羅的解析

使用 ES 细胞利用新的组成发育生物学全面分析分化中的基因组功能

基本信息

批准号：
18016013
负责人：
山下潤
金额：
$ 5.5万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

研究代表者等は、ES細胞(胚性幹細胞)を用いて血管および心臓の分化研究を行い、心血管分化過程を細胞レベルで経時的系統的に解析できる新しい分化システムを構築した(Nature, 2000; FASEB J, 2005)。本研究は、ヒトを含めた哺乳動物の発生及び細胞分化過程を構成的に再現し、その過程におけるゲノム機能のダイナミズムを細胞レベルで解析・提示できる新たな研究基盤の構築を目的とする。研究期間内においては、1)我々の新しいES細胞分化系を用いた心血管細胞分化過程における細胞レベルでの遺伝子プロファイルの作製、2)心血管分化における機能遺伝子の網羅的同定、3)同機能遺伝子群による構成的細胞分化の再現を行う。また、4)分化過程におけるゲノム構造変遷の可視化と5)同定遺伝子発現制御機構の解析により、個々の細胞分化におけるゲノム機能の経時的系統的解析を試みる。さらには6)ヒトES細胞を用いた構成的ヒト発生学の構築を試みる。本年度は、1)動静脈分化における遺伝子プロファイルの作製:誘導した動静脈リンパ管内皮細胞を純化し遺伝子発現プロファイルを作製した。数々の動静脈リンパ管内皮特異的遺伝子を同定した。2)心筋分化における遺伝子プロファイルの作製:心筋及び心筋前駆細胞特異的遺伝子群を同定。3)心筋ペースメーカー細胞分化機構の解析(Yanagi, Stem Cells, 2007)。4)ヒトES細胞血管分化誘導システムの構築(Sone, Arterioscler Thromb Vasc Biol, 2007)。5)マウス人工多能性幹細胞(iPS細胞)を用いた心血管分化誘導システムの構築6)ヒトiPS細胞を用いた心血管分化誘導。

研究人员使用ES细胞（胚胎干细胞）进行了血管和心脏分化研究，并创建了一个新的分化系统，该系统可以在细胞水平上随时间进行系统分析（自然，2000； Faseb J，2005）。这项研究旨在建立一个新的研究基础，该研究基础可以组成性地重现哺乳动物的发育和细胞分化过程，包括人类，并在细胞水平上分析并介绍基因组功能的动态。在研究期间，1）使用我们的新ES细胞分化系统在心血管细胞分化过程中在细胞水平上创建基因谱，2）使用同一基因的构成性细胞分化在心血管分化中对功能基因的全面鉴定，3）使用同一基因繁殖组成型细胞分化。此外，我们尝试通过时间4）分化过程中分化过程中基因组结构变化的可视化和5）分析调节鉴定基因表达的机制，并系统地分析单个细胞分化中的基因组功能的机制。此外，6）尝试使用人ES细胞构建组成型人类胚胎学。今年，1）动静脉分化中的基因谱生成：诱导的动型淋巴内皮细胞纯化以产生基因表达谱。鉴定了许多动静脉淋巴内皮特异性基因。 2）心肌分化中的基因谱的产生：鉴定心肌和心肌祖细胞特异性基因组。 3）分析心肌起搏器细胞分化的机理（Yanagi，Stem Cell，2007）。 4）构建用于诱导人ES细胞血管分化的系统（Sone，Alterioscler Thromb Vasc Biol，2007年）。 5）使用小鼠诱导的多能干细胞（IPS细胞）6）使用人IPS细胞诱导心血管分化。

项目成果

期刊论文数量（16）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Furuse M. Identification of adherens junction-associated GTPase activating proteins by the fluorescence localization-based expression cloning.

Furuse M. 通过基于荧光定位的表达克隆鉴定粘附连接相关的 GTP 酶激活蛋白。

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
Exp Cell Res (印刷中)
影响因子：
0
作者：
Matsuda M;Kobayashi Y;Masuda S;Adachi M;Watanabe T;Yamashita JK;Nishi E;Tsukita S
通讯作者：
Tsukita S

Differentiation stage-specific analysis of gene function with inducible short hair-pin RNA in differentiating embryonic stem cells.

利用诱导型短发夹 RNA 在分化胚胎干细胞中进行基因功能的分化阶段特异性分析。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Biochem Biophys Res Commun 351
影响因子：
0
作者：
Hiraoka-Kanie M;Miyagishi M;Yamashita JK
通讯作者：
Yamashita JK

A pathway for differentiation of human embryonic stem Cells to vascular cell components and their potential for vascular regeneration.

人类胚胎干细胞分化为血管细胞成分的途径及其血管再生潜力。

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Arterioscler Thromb Vasc Biol 27
影响因子：
0
作者：
Sone M;Itoh h;Yamahara K;Yamashita JK;他16名
通讯作者：
他16名

TGF-beta signaling in embryonic stem cell-derived endothelial cells.

胚胎干细胞衍生的内皮细胞中的 TGF-β 信号传导。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Methods Mol Biol 330
影响因子：
0
作者：
Watabe T;Yamashita JK;Mishima K;Miyazono K
通讯作者：
Miyazono K

Two populations OF Thyl-positive mesenchymal cells regulate the in vitro maturation of hepatic progenitor cells.

两个Thyl阳性间充质细胞群调节肝祖细胞的体外成熟。

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Am J Physiol Gastr Liver Physiol. 292
影响因子：
0
作者：
Kamo N;Yasuchika K. Ishii T;Fujita N;Tsuruo T;Yamashita JK;Kubo H;Ikai I
通讯作者：
Ikai I

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0
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Quy Ngoc Phuong Le;Doo-Chul Kim;新井祥穂・大呂興平・奥間瑞巴;黒木貴一・池見洋明・後藤健介・宗建郎;山下潤;木村恵樹・苅谷愛彦;杉浦芳夫;中村　努;Yasuhisa Abe;宮内久光;磯望・黒木貴一
通讯作者：
磯望・黒木貴一