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シグナル伝達マップ作成とプロテオーム解析による先天奇形症候群の病因遺伝子探索

通过创建信号转导图谱和蛋白质组分析来寻找导致先天性畸形综合征的基因

基本信息

批准号：
19659083
负责人：
松原洋一
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

申請者らは2005年にHRASの生殖細胞系列での変異を先天奇形症候群であるCostello症候群で同定した(Aoki et.al., Nature Genetics, 2005)。また2006年にcarcio-facio-cutaneous(CFC)症候群の原因がKRAS, BRAFの遺伝子変異が原因であることを報告した(Niihori, Aoki et.al. Nature Genetics, 2006)。申請者らの発見がブレークスルーとなり、RAS/MAPKに異常を持つ先天異常症という新しい疾患概念が確立した。本研究の目的は、これまでの細胞ベース・マウスベースとは異なる、ヒト発生異常の表現型の臓器別・stage別の詳細な情報と遺伝子の機能・シグナル伝達マップを包括的に網羅するヒト発生異常のデータベースを構築し、データベースに基づいたプロテオーム解析(遺伝子発現タンパクの網羅的解析)をおこなうことによってMCA/MRの原因遺伝子を革新的な探索法を開発しようとするものである。申請者らは、これまでにNoonan類縁疾患250人を収集し既知の原因遺伝子PTPN11, HRAS, KRAS, BRAF, MEK1, MEK2の包括的遺伝子解析を行ってきた。今年度はPTPN11, HRAS, KRAS, BRAF, MEK1, MEK2陰性のNoonan症候群22家系とCFC症候群30人に対してSOS1遺伝子解析を行ったところ、3世代の家系を含むヌーナン症候群2家系とCFC症候群3人に遺伝子変異を同定した。ヌーナン症候群とその類縁疾患はシグナル伝達経路であるRAS/MAPK経路の異常により起こることが明らかになり、私達はこの新しい疾患概念をRAS/MAPK症候群と呼ぶことを提唱した総説を発表した。また遺伝子変異と表現型・シグナル伝達での役割を包括的に記したデータベースを構築中であり、その一部をホームページで公開を開始した。

Applicants since 2005 HRAS germ cell series variation congenital anomaly syndrome variation Costello syndrome variation (Aoki et.al., Nature Genetics, 2005)。In 2006, the causes of carcio-facio-cutaneous(CFC) syndrome were reported (Niihori, Aoki et.al. Nature Genetics, 2006). The concept of congenital abnormality and new disease was established. The purpose of this study is to construct a network of cell types, stage types, and gene functions that include the expression of abnormal genes. The basic analysis of MCA/MR is based on the analysis of the network of gene discovery. The innovative exploration method of MCA/MR is developed. The applicant responded to this request by collecting 250 known causes of Noonan disease, including PTPN11, HRAS, KRAS, BRAF, MEK1 and MEK2. This year, PTPN11, HRAS, KRAS, BRAF, MEK1, MEK2 negative Noonan syndrome 22 families and CFC syndrome 30 individuals, SOS1 gene analysis, 3 generations of families, including CFC syndrome 2 families and CFC syndrome 3 individuals, gene analysis, and the same. A new concept of RAS/MAPK syndrome is proposed. The first part of the project is to open up to the public.