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分子構造情報としてのアンチセンスペプチドホモロジーボックス

作为分子结构信息的反义肽同源盒

基本信息

批准号：
09261231
负责人：
岡田秀親
金额：
$ 1.15万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

センス・アンチセンスペプチドの対応部位を探索するプログラムを作成して蛋白質分子を解析したところ、アミノ酸配列の中にセンス・アンチセンスペプチドの関係にある部位が高頻度に、しかも約50個のアミノ酸毎に集積して存在することを発見し、アンチセンスペプチドホモロジーボックス(ASP・ホモロジーボックスと命名した。このASP・ホモロジーボックス(AHB)のペプチドを合成して作用させることによりエンドセリンレセプター(ETR)の機能を強力に抑制したり、C5aレセプター(C5aR)の活性を変化させるペプチドをつくることができた。可溶性蛋白質に対する作用を解析するモデルとして、補体成分のC3について、分子内のAHBに対応するペプチドを35種類合成してC3の活性に及ぼす作用を解析した。比較的強い活性抑制作用を示した5種類のAHBペプチドについて解析を行い、以下の結果を得た。C3とAHBペプチドを反応させたあと、ゲル濾過によりC3をAHBペプチドと分離しても、AHBペプチドの抑制作用は残っていた。このことから、AHBペプチドが分子内のAHB間の相互作用に割り込んで、分子の高次構造維持に必要な相互作用を阻わしめたために、高次構造が不可逆的に変化したと推察された。C3とAHBペプチドの反応を50℃で行うと抑制作用が高まったので、熱をかけることにより分子内の相互作用がゆるんでAHBペプチドの侵入が起こり易くなった為であろうと考えられた。同様にRNaseに対するAHBペプチドの作用も解析したが、この場合は70℃に加熱してAHBペプチドの作用を行ったが、AHBペプチド内にシステインが含まれるときには、システインの作用が強く現れ見かけ上の抑制活性が強くなった。しかし、システインを含む無関係のペプチドよりは、AHBペプチドの方が抑制作用が強かったので、RNase分子に対する場合にもセンス・アンチセンスペプチドの反応が関与すると考えられた。

To explore the corresponding sites of the protein molecules, the protein molecules were analyzed, and the protein molecules were assigned to the sites with high frequency, and about 50 of the protein molecules were assigned to the sites with high frequency. The ASP·AHB (AHB) selection option is integrated into the function of the ASP·AHB (AHB) selection option. The functionality of the ASP·AHB selection option (AHB) selection option (AHB) selection option is strongly suppressed. Analysis of the role of soluble proteins in the synthesis of C3, complement components, and intramolecular AHB in the synthesis of 35 species and the activity of C3 The comparative strong activity inhibitory effects of 5 types of AHB inhibitors were analyzed and the following results were obtained. C3-AHB is the best choice. The interaction between AHB and AHB in the molecule is necessary for the maintenance of high-order structure. C3 and AHB are resistant to heat at 50℃ and intramolecular interactions are easy to initiate. In the same case, when the RNase is heated at 70℃, the AHB inhibitor has a strong inhibitory activity. For example, if the enzyme is active, the enzyme is active.