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SFXを用いたHIVアクセサリータンパク質と宿主制限因子の複合体の動的構造の解明

SFXを用いたHIVアクセサリータンパク質と宿主制限因子の複合体の動的構造の解明
使用 SFX 阐明 HIV 辅助蛋白和宿主限制因子复合物的动态结构
批准号:
16F16111
负责人:
大塚 雅巳
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2016
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2016-04-22 至 2018-03-31
关键词:

项目摘要

项目成果

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①SAMHD1およびDCAF1タンパク質を発現し精製することに成功したが、アクセサリータンパク質Vpxを精製するには至らなかった。E. coliの系統を変える、GSTタグをもつVpxタンパク質を構築するなど試みたが、結晶精製スクリーニングに必要なVpx-SAMHD1-DCAF1三者複合体を形成するに十分な濃度のVpxタンパク質を得るに至らなかった。②MA-IP6複合体結晶を得ることができ、2つの異なった形の結晶を回折実験に供し、2.7および2.5 Åの分解能で結晶構造を解くことができた。予想したとおり、IP6分子はタンパク質の塩基性の高い領域のアミノ酸残基と相互作用していた。両結晶のパッキングについてはMAの集合とIP6分子との観点から議論することができる。現在、スタンフォード大学との共同研究により、大阪のSACLAの2018年5月のビームタイムにおいてIP6のナノ結晶の室温におけるSFX実験を行っているところである。③トルコ薬用植物と合成化合物を基軸とした医薬スクリーニングについては、benzyl 3-hydroxy-23-oxoolean-12-en-28-oateがBcr-Abl陽性のK562細胞に対して最も有効で(IC50は9.3 μM)、腫瘍特異性とアポプトーシス誘導活性を示した。本化合物はAblプロテインキーゼを低いマイクロモルオーダーのIC50値で阻害するが、BRK, BTK, CSK, LYN BおよびSRCキナーゼに対する阻害効果はイマチニブより高いものであった。さらに、本化合物とBcr-Ablの複合体のドッキングシミュレーションの結果ベンジルエステル部分が幾つかの重要なアミノ酸残基と結合および疎水性相互作用を持つことが示された。全体として、本研究でジプソジェニン誘導体がキナーゼ阻害剤の新しいクラスとなることを示した。
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会议论文
tructural Basis of Inositol Phosphate Recognition in the HIV-1 Gag Matrix
HIV-1 Gag 矩阵中肌醇磷酸识别的结构基础
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [Halil I Ciftci, Hiroshi Tateishi, Kotaro Koiwai, Ryoko Koga, Masami Otsuka, Mikako Fujita, Fumiaki Yumoto, Toshiya Senda]
通讯作者: Toshiya Senda
DOI: 10.1099/jgv.0.000701
发表时间: 2017-02
期刊: The Journal of general virology
影响因子: --
作者: [Minami Yamamoto;Ryoko Koga;Haruna Fujino;Kazunori Shimagaki;Halil I. Ciftci;Masahiro Kamo;Hiroshi Tateishi;M. Otsuka;M. Fujita]
通讯作者: Minami Yamamoto;Ryoko Koga;Haruna Fujino;Kazunori Shimagaki;Halil I. Ciftci;Masahiro Kamo;Hiroshi Tateishi;M. Otsuka;M. Fujita
Restructuring of the bleomycin Metal Core
博来霉素金属核心的重组
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Taha F. S. Ali, Satomi Ida, Yosuke Kanemaru, Ryoko Koga, Ayumi Tanaka, Akiyuki Hamasaki, Tomohiko Ejima, Mohamed Osman Radwan, Halil Ibrahim Ciftci, Hiromasa Kurosaki, Yoshinari Okamoto, Mikako Fujita, Masami Otsuka]
通讯作者: Masami Otsuka
DOI: 10.1038/sdata.2017.55
发表时间: 2017-04-25
期刊: Scientific data
影响因子: 9.8
作者: [Yoon CH, DeMirci H, Sierra RG, Dao EH, Ahmadi R, Aksit F, Aquila AL, Batyuk A, Ciftci H, Guillet S, Hayes MJ, Hayes B, Lane TJ, Liang M, Lundström U, Koglin JE, Mgbam P, Rao Y, Rendahl T, Rodriguez E, Zhang L, Wakatsuki S, Boutet S, Holton JM, Hunter MS]
通讯作者: Hunter MS
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    Development of therapeutic drugs that tandemly suppress infection, lung fibrosis, and malignant transformation of the new coronavirus
    • 批准号:
      22K06529
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.75万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      大塚 雅巳
    • 依托单位:
    イノシトール結合ドメインをもつ蛋白質を標的とした新規脳保護薬の分子設計
    • 批准号:
      19659025
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.05万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      大塚 雅巳
    • 依托单位:
    新規ビスインドール化合物コノフィリンを基盤とした糖尿病薬の設計と合成
    • 批准号:
      16659032
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.18万
    • 财政年份:
      2004
    • 负责人:
      大塚 雅巳
    • 依托单位:
    Rasファルネシルトランスフェラーゼの亜鉛部位を標的とした抗がん剤の創製
    • 批准号:
      15025261
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.92万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      大塚 雅巳
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    二维MA₂Z₄材料家族热输运特性的高通量计算研究
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
      李振东
    • 依托单位:
    二维MA2Z4异质结中多体效应的理论研究
    ALKBH1通过6mA去甲基化调控mtDNA释放在急性胰腺炎中的作用与机制
    • 批准号:
      2025JJ60542
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      朱帅
    • 依托单位:
    新型氟[18F]标记的MA0-B分子探针的合成及其用于帕金森病发病机制的探索研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      --
    • 依托单位: