Identification of novel driver genes by whole genome sequencing of early stage lung tumors

通过早期肺部肿瘤的全基因组测序鉴定新的驱动基因

基本信息

  • 批准号:
    20H00545
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 28.79万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 财政年份:
    2020
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2020-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

上皮内肺がん26例、微小浸潤腺がん18例について、全ゲノム/RNAシークエンスデータを、そのうち37例については長鎖シークエンスデータを取得し、進行がんと比較することで、総合的に早期肺発がん機構のメカニズムの推定を行った。既知のがん遺伝子変異としては、EGFR、KRAS、MET、BRAF、HER2、MAP2K1遺伝子の変異、RET及びALK遺伝子融合は、早期肺がん形成に働くドライバー変化であることが明らかにされた。一方、TP53やSMARCA2/4がん抑制遺伝子の変異は、進行がんに多く存在したことから、発がん後の悪性化に働くことが明らかにされた。また、がんが進行するにつれ、グローバルなDNA低メチル化とそれに伴うコピー数変化、また、BRCA2遺伝子変異などによる変異増加がみられることが明らかになった。一方、肺がんでみられるものを含めたRET遺伝子の細胞外ドメイン変異について、NIH3T3細胞やBa/F3細胞を用いたTransforming assayを行い、がん化変異であることを見出した。この細胞外ドメイン変異は、Caイオン結合部位の不安定化を介して、分子間SS結合によるRETタンパク質の恒常的な二量体化、ERK分子の活性化をもたらし、その活性化やがん可能はRETキナーゼ阻害薬セルパカチニブ、プラルセチニブの投与により抑えられた。以上のことより、RET遺伝子の点変異は、肺がんなど、複数のがん種の発がんに寄与し、治療標的分子となることが明らかとなった。
26 cases of intraepithelial lung, 18 cases of microinvasive glands, 37 cases of long locks, comparison and estimation of early lung development mechanism. It is known that there are differences between EGFR, KRAS, MET, BRAF, HER2, MAP2K1, RET and ALK genes, and early lung formation. One side, TP53, SMARCA2/4, inhibit the transmission of different, carry out more than one existence, after the transmission of different characteristics, For example, if you want to change your DNA, you can change your DNA. A party, lung, lung These extracellular molecules are different, Ca ~(3 +) binding sites are unstable, intermolecular SS binding is stable, and ERK molecule activation is reversed, and activation is possible. The above is the same as the above, the RET gene is different, the lung is different, the plural is different, and the therapeutic target molecule is different.

项目成果

期刊论文数量(30)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
非喫煙者肺がん・喫煙者肺がんの病因とゲノム解析
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    萩原 浩生;内山 圭司;吉丸 哲郎;松下 洋輔;片桐 豊雅;河野隆志
  • 通讯作者:
    河野隆志
Vaginal Transmission of Cancer from Mothers with Cervical Cancer to Infants
  • DOI:
    10.1056/nejmoa2030391
  • 发表时间:
    2021-01-07
  • 期刊:
  • 影响因子:
    158.5
  • 作者:
    Arakawa, Ayumu;Ichikawa, Hitoshi;Ogawa, Chitose
  • 通讯作者:
    Ogawa, Chitose
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takashi Kohno;Kouya Shiraishi;Takashi Nakaoku
  • 通讯作者:
    Takashi Nakaoku
NCI, NIH(米国)
NCI、NIH(美国)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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知道了