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Design of Base-discriminating Fluorescent Nucleosides and Their Application to Gene Analysis and SNP Genotyping

Design of Base-discriminating Fluorescent Nucleosides and Their Application to Gene Analysis and SNP Genotyping
碱基识别荧光核苷的设计及其在基因分析和 SNP 基因分型中的应用
批准号：
18201026
负责人：
SAITO Isao
金额：
$30.7万
依托单位：
Nihon University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18201026/
关键词：
DNAデバイスDNAチップ遺伝子検出遺伝子診断SNP検出ナノバイオゲノム蛍光分子

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
我们设计了新的碱基鉴别荧光（BDF）核苷，成功地用于SNP基因分型和基因检测。猝灭分子信标和末端自由分子信标首次被发现。这些低成本的MB用于细胞内的基因检测。我们还成功地设计了环境敏感的荧光核苷，根据核碱基周围的局部环境发出不同波长的强荧光。
英文摘要
We have designed novel base-discriminating fluorescent (BDF) nucleosides which are successfully used for SNP genotyping and gene detection. Quencher and end free molecular beacons (MB) were discovered for the first time. These low cost MB were used for the gene detection in a cell. We have also succeeded to design environmentally sensitive fluorescent nucleosides that emits strong fluorescence at different wavelengths depending upon a local environment around the nucleobase.
期刊论文(39)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Design of dual-labeled oligonucleotide probes for SNPs genotyping
用于 SNP 基因分型的双标记寡核苷酸探针的设计
DOI： --
发表时间： 2007
期刊： Nucleic Acids Symp. Ser vol.51
影响因子： --
作者： [Yoshio Saito, Subhendu Sekhar Bag, Satoshi Kodate, Isamu Suzuka, Isao Saito]
通讯作者： Isao Saito
Ends Free and Self-quenched Molecular Beacons with Pyrene Labeled Pyrrolocitidine in the Middle of the Stem.
在茎中部末端带有芘标记的吡咯胞苷的游离和自猝灭的分子信标。
DOI： --
发表时间： 2009
期刊： Terahedron 65
影响因子： --
作者： [Y. Saito, Y. Sinohara, S.S. Bag, Y. Takeuchi, K. Matsumoto, I. Saito]
通讯作者： I. Saito
Site?specific Transition of Cytosine to mUracil via Reversible DNA Photoligation
通过可逆 DNA 光连接将胞嘧啶位点特异性转变为 mUracil
DOI： --
发表时间： 2006
期刊： Chem. Commun
影响因子： --
作者： [K.Fujimoto, S.Matsuda, Y.Yoshimura, T.Matsumura, M.Hayashi, I.Saito]
通讯作者： I.Saito
Intelligent Fluorescent Nucleoside in Sensing Cytosine Base
传感胞嘧啶碱基的智能荧光核苷
DOI： --
发表时间： 2006
期刊： Bioorganic Med. Chem. Lett. 16
影响因子： --
作者： [S.S.Bag, Y.Saito, K.Hanawa, S.Kodate, I.Suzuka, I.Saito]
通讯作者： I.Saito
共 35 条
    Design of Environmentally Sensitive Fluorescent Nucleosides and Their Application to Innovative Fluorescence Probe for Gene Analysis
    • 批准号：
      23350082
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.48万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      SAITO Isao
    • 依托单位：
      Nihon University
    Evaluation for primary prevention of cardiovascular disease in a community.
    • 批准号：
      23590795
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.24万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      SAITO Isao
    • 依托单位：
      Ehime University
    Evaluation of the pattern of the skeletal deviation by the simulation of bone remodeling.
    • 批准号：
      22592281
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2010
    • 负责人：
      SAITO Isao
    • 依托单位：
      Niigata University
    Epidemiological study on the association between the autonomic function and glucose intolerance
    • 批准号：
      20590647
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      SAITO Isao
    • 依托单位：
      Ehime University
    海外基金