標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
批准号:
12034215
负责人:
古久保 哲朗
金额:
$1.02万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 --
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転写制御機構を理解するためには、転写活性化ドメイン(AD)とその標的分子の間に成立する蛋白質間相互作用の実体を明らかにする必要がある。われわれはTFIIDサブユニットであるyTAF145/dTAF230のN末端にTBPと極めて強く結合し、その機能を阻害する活性領域(TAND)を同定し、TANDが役割分担の異なる二個の小サブドメイン(TAND1,TAND2)から構成されること、TAND1はADと多くの機能的な共通点を持つことなどを明らかにしてきた。またすでにIkuraらにより、ショウジョウバエ由来のdTAND1がTATAボックスの分子擬態を利用してTBPに結合していることが明らかにされている。その後の詳細な解析からdTAND1が二個のyTAND1相当領域を内包する可能性が示されたため、それぞれについてTBPとの複合体形成を試みたが、yTAND2との融合蛋白質のin vitroにおけるTBP結合活性はいずれも極めて低いものであった。そこで今回dTAND1-dTAND2間に本来挿入されているspacer領域(78-115aa)の機能に新たに注目し、in vivo及びin vitroにおいて種々の解析を行った。その結果、(1)spacer領域の付加はin vivoにおいて野生型orキメラ型TANDを持つyTAF145蛋白質全長の発現を抑制すること、(2)spacer領域をC端側に融合することにより転写活性化ドメインの活性が顕著に低下すること、(3)spacer領域の挿入によりdTANDIN(or C)-yTAND2融合蛋白質のTBP結合能がわずかながら増大することなどが明らかとなった。以上の結果は、spacer領域が単なるリンカーではなく、少なくともショウジョウバエのTFIIDにおいてはTAND1,TAND2と同様にTBPと可逆的に結合する第三のサブドメインとして機能していることを強く示唆している。
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C.R.Lim,Y.Kimata,H.Ohdate,T.Kokubo,N.Kikuchi,T.Horigome,K.Kohno: "The Saccharomyces cerevisiae RuvB-like protein, tih2p, is required for cell cycle progression and RNA polymerase II-directed transcription"Journal of Biological Chemistry. 275・29. 22409-224
C.R. Lim、Y. Kimata、H. Ohdate、T. Kokubo、N. Kikuchi、T. Horigome、K. Kohno:“酿酒酵母 RuvB 样蛋白 tih2p 是细胞周期进展和 RNA 聚合酶 II 指导所必需的转录“生物化学杂志.275・29.22409-224
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
T.Kotani,K-i.Banno,M.Ikura,A.G.Hinnebusch,Y.Nakatani,M.Kawaichi,T.Kokubo: "A role of transcriptional activators as anti-repressors for the auto-inhibitory activity of TATA box binding of TFIID"Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 97・13. 7178-7183 (2000)
T. Kotani、K-i. Banno、M. Ikura、A. G. Hinnebusch、Y. Nakatani、M. Kawaichi、T. Kokubo:“转录激活剂作为 TFIID 的 TATA 盒结合的自动抑制活性的抗阻遏物的作用”美国国家科学院院刊 97・13。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
A.Kobayashi,T.Miyake,Y.Ohyama,M.Kawaichi,T.Kokubo: "Mutations in the TATA binding protein, affecting transcriptional activation, show synthetic lethality with the TAF145 gene lacking the TAFN-terminal domain in Saccharomyces cerevisiae"Journal of Biologic
A.Kobayashi、T.Miyake、Y.Ohyama、M.Kawaichi、T.Kokubo:“TATA 结合蛋白的突变影响转录激活,在酿酒酵母中缺乏 TAFN 末端结构域的 TAF145 基因显示出合成致死性”杂志
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Y.Tsukihashi,T.Miyake,M.Kawaichi,T.Kokubo: "Impaired core promoter recognition caused by novel yeast TAF145 mutations can be restored by creating a canonical TATA element within the promoter region of the TUB2 gene"Molecular and Cellular Biology. 20・7. 23
Y. Tsukihashi、T. Miyake、M. Kawaichi、T. Kokubo:“通过在 TUB2 基因的启动子区域内创建规范的 TATA 元件,可以恢复由新型酵母 TAF145 突变引起的核心启动子识别受损”《分子与细胞生物学》。 20・7.23
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
出芽酵母におけるプロモーターリプログラミング因子の同定とコア因子選択機構の解明
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批准号:23K05642
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:20052024
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.61万
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财政年份:2008
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
新規窒素固定菌における遺伝子発現の可視化
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批准号:06F05755
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2006
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:18055028
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.57万
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财政年份:2006
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:17054034
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.56万
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财政年份:2005
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:16013240
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2004
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:15013247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2003
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:14014244
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2002
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
新規in vivo可視化技術を用いた真核細胞における遺伝情報発現機構の解析
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批准号:13GS0013
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项目类别:Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
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资助金额:$217.73万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写調節における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:13680765
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:13206051
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.52万
-
财政年份:2001
-
负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:13014214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:12206060
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
-
财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:12028225
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母も用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:11154220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:11160211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1999
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:10173221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1998
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:10179211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1998
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニットp145の機能解析
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批准号:09277217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1997
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニットp145の機能解析
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批准号:08250217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1996
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
海外基金