標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
批准号:
10179211
负责人:
古久保 哲朗
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 --
中文摘要
転写制御機構を理解するためには、転写活性化ドメイン(AD)とその標的分子の間に成立する蛋白質間相互作用の実体を明らかにする必要がある。しかしながらADの構造を原子レベルで明らかにすることはこれまで困難とされてきた。われわれはTFIIDサブユニット(TAF)の機能を解析する過程で、(i)出芽酵母yTAF145及びショウジョウバエdTAF230のN末端にはTBPと極めて強く結合し、その機能を阻害する領域(TAND)が存在すること、(ii)TANDは役割分担の異なる二個の小サブドメイン(TANDI,TANDII)から構成されること、(iii)TANDIはADと多くの機能的な共通点を持つことなどを見出した。さらにADとTANDIIの融合蛋白質を用いることにより、TBPとADの安定な複合体を試験管内で作らせることに成功した。そこで本年度はまず、dTAF230のTANDI(dTANDI)とTBPの複合体についてNMRによる立体構造解析を行った(米国・カナダの研究者との共同研究)。その結果、dTANDIは単独では安定な構造を取らず、TBPと結合してはじめてTATAボックス様の構造を取ることが明らかとなった。しかしながらdTANDIはいくつかの点でyTAF145のTANDI(yTANDI)とは性質が異なっており、ADはむしろyTANDIに良く似た性質を示す。われわれはdTANIが高等真核細胞における複雑な転写制御に対応するため、dTANDI/yTANDI両者に共通の機能に加えて、yTANDIには存在しない新たな機能を獲得して進化したのではないかと考えた。そこで欠失変異体解析により、dTANDI中に含まれるyTANDI様の活性領域の有無について検索を行ったところ、二個の独立して機能するyTANDI相当領域を見出した。
英文摘要
転写制御機構を理解するためには、転写活性化ドメイン(AD)とその標的分子の間に成立する蛋白質間相互作用の実体を明らかにする必要がある。しかしながらADの構造を原子レベルで明らかにすることはこれまで困難とされてきた。われわれはTFIIDサブユニット(TAF)の機能を解析する過程で、(i)出芽酵母yTAF145及びショウジョウバエdTAF230のN末端にはTBPと極めて強く結合し、その機能を阻害する領域(TAND)が存在すること、(ii)TANDは役割分担の異なる二個の小サブドメイン(TANDI,TANDII)から構成されること、(iii)TANDIはADと多くの機能的な共通点を持つことなどを見出した。さらにADとTANDIIの融合蛋白質を用いることにより、TBPとADの安定な複合体を試験管内で作らせることに成功した。そこで本年度はまず、dTAF230のTANDI(dTANDI)とTBPの複合体についてNMRによる立体構造解析を行った(米国・カナダの研究者との共同研究)。その結果、dTANDIは単独では安定な構造を取らず、TBPと結合してはじめてTATAボックス様の構造を取ることが明らかとなった。しかしながらdTANDIはいくつかの点でyTAF145のTANDI(yTANDI)とは性質が異なっており、ADはむしろyTANDIに良く似た性質を示す。われわれはdTANIが高等真核細胞における複雑な転写制御に対応するため、dTANDI/yTANDI両者に共通の機能に加えて、yTANDIには存在しない新たな機能を獲得して進化したのではないかと考えた。そこで欠失変異体解析により、dTANDI中に含まれるyTANDI様の活性領域の有無について検索を行ったところ、二個の独立して機能するyTANDI相当領域を見出した。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Kotani T et al: "Identification of highly conserved amino-terminal segments of dTAFII230 and yTAFII145 that are functionally interchangeable for inhibiting TBP:DNA interactions in vitro and in promoting yeast cell growth in vivo" Journal of Biological Che
Kotani T 等人:“dTAFII230 和 yTAFII145 高度保守的氨基末端片段的鉴定,这些片段在功能上可互换,可抑制体外 TBP:DNA 相互作用并促进体内酵母细胞生长”Journal of Biological Che
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Liu D et al: "Solution structure of a TBP-TAFII230 complex: Protein mimicry of the minor groove surface of the TATA box unwound by TBP" Cell. 94(5). 573-583 (1998)
Liu D 等人:“TBP-TAFII230 复合物的溶液结构:TBP 解绕的 TATA 盒小沟表面的蛋白质模拟”细胞。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
出芽酵母におけるプロモーターリプログラミング因子の同定とコア因子選択機構の解明
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批准号:23K05642
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:20052024
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.61万
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财政年份:2008
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
新規窒素固定菌における遺伝子発現の可視化
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批准号:06F05755
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2006
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:18055028
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.57万
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财政年份:2006
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:17054034
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.56万
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财政年份:2005
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:16013240
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2004
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:15013247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2003
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:14014244
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2002
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
新規in vivo可視化技術を用いた真核細胞における遺伝情報発現機構の解析
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批准号:13GS0013
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项目类别:Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
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资助金额:$217.73万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
転写調節における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
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批准号:13680765
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:13206051
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.52万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:13014214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2001
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
基本転写因子TFIIDに支配される標的遺伝子群の網羅的単離とそのプロモーター特性
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批准号:12206060
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:12028225
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:12034215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2000
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母も用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:11154220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
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批准号:11160211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1999
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の機能解析
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批准号:10173221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1998
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニットp145の機能解析
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批准号:09277217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1997
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
酵母を用いた基本転写因子TFIIDサブユニットp145の機能解析
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批准号:08250217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1996
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负责人:古久保 哲朗
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依托单位:
海外基金