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標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析

標的分子であるTBPに結合した転写活性化ドメインの立体構造解析
与靶分子TBP结合的转录激活域的三维结构分析
批准号:
13014214
负责人:
古久保 哲朗
金额:
$1.02万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 --

项目摘要

项目成果

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転写制御機構を理解するためには、転写活性化ドメイン(AD)とその標的分子の間に成立する蛋白質間相互作用の実体を明らかにする必要がある。われわれはTFIIDサブユニットであるyTAF145/dTAF230のN末端にTBPと極めて強く結合し、その機能を阻害する活性領域(TAND)を同定し、TANDが役割分担の異なる二個の小サブドメイン(TAND1,TAND2)から構成されること、TAND1はADと多くの機能的な共通点を持つことなどを明らかにしてきた。またすでにIkuraらにより、ショウジョウバエ由来のdTAND1がTATAボックスの分子擬態を利用してTBPに結合していることも明らかにされている。今年度は、出芽酵母細胞内においてdTANDを有するyTAF145蛋白質の発現を試みると、そのほとんどがTAND領域を欠失した形で発現するか、その原因の少なくとも一部はdTANDに含まれるコドンの使用頻度によることを見いだした。すなわちdTANDをN末端に有するyTAF145蛋白質の場合、翻訳開始点が通常の開始メチオニンよりも下流側へシフトしており、このシフトはコドンを出芽酵母において使用頻度の高いものへ変換することにより解消された。従ってdTANDを含むyTAF145蛋白質が全長で発現できない理由は、コードされるキメラ型TAF145の活性が細胞に対して何らかの悪影響を及ぼした結果というよりも、むしろリボソーム固有の一般的な性質によるものと考えられる。そこであらためてコドンを最適化したyTAF145変異体を用いて再検討を行ったところ、dTAND2にはyTAND2様の活性が確認されたが、dTAND1にはyTAND1としての活性は認められず、むしろ酵母の生育に対して阻害効果を示すことが明らかとなった。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Y.Tsukihashi, M.Kawaichi, T.Kokubo: "Requirement for yeast TAF145 function in transcriptional activation of the RPS5 promoter that depends on both core promoter structure and upstream activating sequences"Journal of Biological Chemistry. 276・28. 25715-257
Y.Tsukihashi、M.Kawaichi、T.Kokubo:“RPS5 启动子转录激活中酵母 TAF145 功能的要求取决于核心启动子结构和上游激活序列”《生物化学杂志》276·257。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
A.Kobayashi, T.Miyake, Y.Ohyama, M.Kawaichi, T.Kokubo: "Mutations in the TATA binding protein, affecting transcriptional activation, show synthetic lethality with the TAF145 Gene lacking the TAF N-terminal domain in Saccharomyces cerevisiae"Journal of Bio
A.Kobayashi、T.Miyake、Y.Ohyama、M.Kawaichi、T.Kokubo:“影响转录激活的 TATA 结合蛋白突变,在酿酒酵母中显示出缺乏 TAF N 末端结构域的 TAF145 基因的合成致死性”
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
出芽酵母におけるプロモーターリプログラミング因子の同定とコア因子選択機構の解明
  • 批准号:
    23K05642
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $3.0万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    古久保 哲朗
  • 依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
  • 批准号:
    20052024
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $4.61万
  • 财政年份:
    2008
  • 负责人:
    古久保 哲朗
  • 依托单位:
新規窒素固定菌における遺伝子発現の可視化
  • 批准号:
    06F05755
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $0.77万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    古久保 哲朗
  • 依托单位:
転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能
  • 批准号:
    18055028
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $5.57万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    古久保 哲朗
  • 依托单位:
海外基金